Инфекции респираторного тракта у детей

ОРЗ составляют около 90% всей инфекционной патологии детского возраста, это самые частые заболевания в амбулаторной практике. Наиболее высокий уровень заболеваемости респираторными инфекциями отмечается у детей дошкольного возраста, посещающих организованные коллективы.

ОРЗ — группа заболеваний с поражениями органов дыхания, которая характеризуется воспалением слизистых оболочек дыхательных путей. По локализации ОРЗ принято разделять на заболевания верхних и нижних отделов дыхательных путей. К первым относят ринит, ринфарингит, фарингит, ринсинусит и синусит, тонзиллит, отит, эпиглотит. Трахеит, бронхит и пневмония являются заболеваниями нижних отделов респираторного тракта. Ларингит занимает промежуточное положение.

Основными возбудителями ОРЗ являются так называемые респираторные вирусы. Приблизительно в 10% случаев острые респираторные инфекции имеют бактериальную или вирусно-бактериальную природу. Одним из самых частых возбудителей ОРЗ является риновирус. Наряду с риновирусами возбудителями ОРВИ являются аденовирусы, вирусы парагриппа, респираторно-синцитиальный вирус (РС-вирус) и, в период эпидемических вспышек, вирусы гриппа.
Клиническая симптоматика ОРЗ вирусной этиологии в основном сходна: катаральные явления, насморк, кашель, повышение температуры. Однако имеются и характерные синдромы, позволяющие по клиническим данным предположить этиологию заболевания.

Грипп диагностируют на основании внезапного начала, выраженного озноба, повышения температуры тела до высоких цифр, симптомов интоксикации (адинамия, головная боль, миалгии), а также сухого кашля. Парагрипп протекает тоже с острой лихорадкой, но катаральные явления в виде фаринготонзиллита или синдрома крупа значительно выражены. Для аденовирусной инфекции характерны высокая лихорадка, симптомы катара дыхательных путей, гиперплазии лимфоидной ткани ротоглотки и шейных лимфоузлов, а также поражения глаз (конъюнктивит). Клинические симптомы развиваются постепенно, что может обусловливать длительную лихорадку (до 7-14 дней). Риновирусная инфекция проявляется обильными слизистыми выделениями из носа, легким недомоганием и покашливанием, температура нормальная. РС-инфекцию диагностируют на основании клинической картины бронхиолита с выраженным обструктивным синдромом (кашлем), с выраженной гипоксией при умеренной температурной реакции.

Лечение ОРЗ должно быть комплексным и строиться индивидуально в каждом конкретном случае. Наилучшей системой профилактики ОРЗ является формирование собственного адекватного иммунного ответа. Способствуют этому здоровый образ жизни, рациональный режим дня, полноценное питание, закаливание.

Профилактика респираторных инфекций предусматривает ограничение контактов ребенка с больными гриппом и ОРВИ, проведение санитарно-гигиенических мероприятий, сокращение использования городского транспорта и увеличение времени пребывания ребенка на воздухе. Частая респираторная заболеваемость тесно связана с пассивным курением (то есть нахождением рядом с курящими родителями), поэтому прекращение курения возле ребенка – важное условие лечения и профилактики.

Основным методом повышения сопротивляемости ребенка инфекционным агентам служит закаливание. Систематическое контрастное воздушное или водное закаливание сопровождается повышением устойчивости организма к температурным колебаниям окружающей среды и повышением иммунной реактивности организма. Хорошо закаливают воздействия на подошвы ног и постепенно – на всю кожу туловища и конечностей. Максимальная длительность закаливающих процедур не должна превышать 10–20 мин., гораздо важнее их регулярность и постепенность. Закаливающие процедуры хорошо сочетать с проведением гимнастики и массажа грудной клетки. Закаливание после не тяжелого ОРЗ можно начать через 7–10 дней, при заболевании с длительностью температурной реакции более 4 дней – через 2 недели, а после 10-дневной лихорадки – через 3–4 недели. Эффективность закаливания можно оценить через 3–4 месяца, а максимальный эффект наблюдается через год от начала регулярных процедур.

Одним из самых важных профилактических мероприятий является вакцинация. Частые ОРВИ не могут быть поводом для отвода от прививок. По окончании ОРВИ, как и других острых заболеваний, прививки возможно проводить через 2–3 недели после нормализации температуры. Для специфической профилактики гриппа у детей рекомендуются вакцины Гриппол (Россия), Агриппал S1, Бегривак (Германия), Ваксигрип (Франция), Инфлювак (Нидерланды), Флюарикс (Германия). Иммунитет вырабатывается через 14 дней после вакцинации, он кратковременный (6–12 мес.) и типоспецифичный, что требует ежегодных прививок. Профилактическая эффективность 70–90%, и при заражении другими разновидностями гриппа заболевание протекает в более лёгкой форме.

Г. Хасанова,
зам. главного врача по детству.

Ключевые слова: острые респираторные инфекции, вирусы, противовирусные препараты, вакцинация, иммуномодуляторы

Keywords: acute respiratory infections, viruses, antiviral preparations, vaccination, immunomodulators

Вопросы профилактики, диагностики и лечения острых инфекционных болезней органов дыхания у детей всегда были и остаются в центре внимания педиатров [1].

Таблица. Основные группы возбудителей ОРИ у детей [3]

Группа	Возбудители
Респираторные вирусы	Грипп (А, В), парагрипп, аденовирусы, респираторно-синцитиальный вирус (РС-вирус), риновирусы, коронавирусы
Внутри- и внеклеточные возбудители	Chlamidophila pneumonia, Ch. trachomatis, Mycoplasma pneumoniae, M. hominis, Pneumocystis spp.
Герпесвирусы	Герпес 1-го, 2-го типа, вирус Эпштейна – Барр (ВЭБ) 4-го типа, цитомегаловирус (ЦМВ) 5-го типа, герпес 6-го типа
Представители эндогенной микрофлоры	Стафилококки, стрептококки, энтерококки и др.
Бактериальные возбудители лор-органов и респираторного тракта	Пневмококк, гемофильная палочка, моракселла, золотистый стафилококк, кишечная палочка, клебсиелла
Другие возбудители	Легионеллы, бокавирусы, метапневмовирусы

Возбудителями острых респираторных инфекций вирусной этиологии являются представители разных вирусных семейств, многие вирусы неоднородны по своей антигенной структуре и имеют несколько серотипов, что во многом может затруднять клиническую диагностику, так как это, в свою очередь, определяет разнообразие клинических проявлений одной и той же инфекции. Одними из самых распространенных являются риновирусы (известно более 100 штаммов возбудителя), вызывающие заболевание в более трети случаев ОРВИ. Наряду с риновирусами причинами острых респираторных инфекций являются аденовирусы, вирусы парагриппа, респираторно-синцитиальный вирус (РС-вирус), энтеровирусы, а в период эпидемических вспышек - вирусы гриппа.

Сегодня уже известно, что важными этиологическими агентами в развитии инфекций верхних дыхательных путей, а также бронхиолитов и пневмонии, крупа и обострения бронхиальной астмы являются не только вирусы гриппа и РС-вирус, но и риновирусы, аденовирусы, метапневмовирус человека, а также герпесвирусы и атипичные возбудители [3, 8-11]. Например, возбудителями внебольничных пневмоний наряду с наиболее значимым патогеном для данной патологии Streptococcus pneumoniae могут быть и РС-вирус, и риновирусы. Причем, если для взрослых при внебольничных пневмониях вирусной этиологии актуальными являются чаще всего вирусы гриппа, коронавирусы и аденовирусы, то у детей спектр этиологически значимых вирусных возбудителей пневмоний гораздо шире и чаще обнаруживаются вирусные и вируснобактериальные ассоциации 12.

Острые респираторные инфекции из-за высокого риска развития осложнений в любые сроки от начала болезни - серьезная проблема для здоровья, и особенно у детей [15]. Но наиболее тяжелым заболеванием по течению и риску развития осложнений из всех ОРИ является грипп. Ежегодно, даже только во время сезонных вспышек гриппа, в мире заболевает до 5 млн человек, смертность от гриппа в период эпидемий в разных возрастных группах колеблется от десятков до сотен случаев, а в период пандемии показатель может достигать 1000 случаев на 100 тыс. населения [16, 17]. Результаты 8-летнего эпидемиологического исследования, проведенного Центром по контролю и профилактике заболеваний (CDC) в период с октября 2004 года по сентябрь 2012 года в США, показали, что риск летального исхода при гриппе высок и для детей с хронической патологией, и для здоровых детей. По данным исследования, более трети заболевших гриппом детей погибали до госпитализации, в течение 3 дней от начала появления первых симптомов заболевания, средний возраст умерших пациентов составил 7 лет (вероятное отклонение: 1-12 лет). Из 794 связанных с гриппом смертельных исходов в 43% случаев дети не имели повышенного риска заболевания. В то же время данные исследования подтвердили повышенный риск развития осложнений, включая высокий уровень смертности среди детей с сопутствующими заболеваниями: у 33% умерших детей имелись неврологические патологии и у 12% - генетические или хромосомные нарушения. Авторы подчеркивают, что своевременное назначение противогриппозных препаратов могло бы уменьшить тяжесть заболевания и осложнений, однако сведения о назначении противогриппозной химиотерапии имелись лишь у менее половины умерших детей [18].

Эффективным методом профилактики инфекций является вакцинация - активная иммунизация, приводящая к развитию специфической невосприимчивости к инфекционным агентам [19]. В настоящее время вакцинация проводится против таких возбудителей респираторных инфекций, как грипп, пневмококковая и гемофильная (Hib) инфекции. Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ) в связи с постоянными генетическими и антигенными изменениями вирусов гриппа рекомендуется ежегодная вакцинация до начала сезона.

Специфическая профилактика гриппа осуществляется вакцинами, которые готовятся из актуальных штаммов вируса, рекомендуемых ВОЗ для нового эпидемического сезона, состав вакцин содержит 3 штамма: 2 - подтипов A/H1N1/, A/H3N2/ и 1 - вируса гриппа В. Кроме того, в сезоне 2013-2014 годов в США, Канаде и ряде стран Европы были одобрены к применению, в том числе у детей, 4-компонентные вакцины, содержащие 4 штамма: по 2 - каждого подтипа вирусов гриппа А и В.

Сегодня важным моментом в профилактике респираторных инфекций у детей является возможность вакцинации против гемофильной и пневмококковой инфекций, являющихся причиной острого инфекционного заболевания у детей преимущественно в возрасте до 5 лет, а также связанных с тяжелыми бактериальными осложнениями гриппа и ОРВИ. Результаты недавнего исследования распространенности в России внебольничной пневмонии и острого среднего отита у детей в возрасте до 5 лет, проведенного в рамках программы PAPIRUS (Prospective Assessment of Pneumococcal Infection in Russia), подтвердили высокую частоту этих заболеваний и продемонстрировали ведущую роль Streptococcus pneumoniae и Haemophilus influenzae в их развитии [20]. Анализ эпидемиологических исследований о распространенности различных серотипов пневмококкового возбудителя в настоящее время в России, выявление устойчивых к антибиотикам штаммов во всех возрастных группах позволили заключить авторам, что широкое использование современных конъюгированных пневмококковых вакцин в рамках программы иммунизации позволит решить эту серьезную проблему отечественного здравоохранения и значительно снизить заболеваемость данными нозологическими формами [21].

Пассивная иммунопрофилактика РС-вирусной инфекции иммуноглобулином паливизумаб (Синагис) в нашей стране с недавнего времени проводится детям из групп высокого риска по развитию тяжелых инфекций нижних дыхательных путей [22]. По данным зарубежных публикаций, ежемесячное введение паливизумаба в период циркуляции РС-вируса среди населения приводит к уменьшению числа тяжелых случаев инфекции у детей групп риска, требующих госпитализации, на 50% по сравнению с плацебо [23].

Для сезонной профилактики острых инфекционных заболеваний органов дыхания используются также методы неспецифической активации иммунной системы с применением иммуномодулирующих фармакопрепаратов, например бактериальных вакцин и синтетических иммуномодуляторов [24, 25]. Бактериальные вакцины - иммуномодуляторы микробного происхождения: очищенные бактериальные лизаты (ИРС19, Имудон, Бронхомунал, Бронховаксом), комбинированные иммунокорректоры, содержащие антигены бактерий и неспецифические иммуномодуляторы ЛПС и протеогликан (Рибомунил, Иммуновак ВП-4) и полусинтетические аналоги (Ликопид), имеют двойное действие: специфическое (вакцинирующее) и неспецифическое (иммуностимулирующее). Из синтетических иммуномодуляторов применяют азоксимера бромид (Полиоксидоний), пидотимод (Имунорикс), индукторы интерферона тилорон (Амиксин).

ВОЗ в дополнение к вакцинации как основной стратегии борьбы с гриппом рекомендует применение этиотропных химиопрепаратов, блокирующих функциональную активность вируса на разных этапах его репликативного цикла. Медикаментозная профилактика гриппа и ОРВИ назначается как дополнение к поздней вакцинации лицам группы риска в первые 2 недели после вакцинации (в период образования антител); детям, которые вакцинируются впервые (так как образование антител заканчивается ко 2-й неделе после второй вакцинации); пациентам с хронической патологией, сопровождающейся иммунодефицитом, у которых в результате вакцинации образуется недостаточный иммунный ответ; лицам, которым вакцинация против гриппа противопоказана (например, при аллергической реакции на предыдущие вакцинации); невакцинированным лицам после контакта с заболевшим. Медикаментозная профилактика гриппа и ОРВИ эффективно дополняет вакцинацию и при применении во время эпидемий гриппа позволяет значительно снизить заболеваемость и смертность от инфекции. Рекомендации ВОЗ одинаковы для сезонного и пандемического гриппа, но требуют выполнения условий кратности и длительности приема противовирусного препарата. Не рекомендуется проводить химиопрофилактику позже 48 часов от момента контакта с больным. Постконтактная химиопрофилактика эффективна только в случае ежедневного приема в рекомендованных дозировках при длительности не менее 7 суток после контакта с больным. Для только что вакцинированных рекомендуемая продолжительность химиопрофилактики - не менее 2 недель, то есть до момента формирования специфического иммунитета (для детей возможно увеличение срока в зависимости от возраста и анамнеза вакцинации).

Обширный отечественный фармацевтический рынок требует четкого понимания критериев выбора этиотропного препарата. Противовирусные химиопрепараты оказывают прямое воздействие на репродукцию вируса и направлены на определенную вирусспецифическую мишень в цикле вирусной репродукции. Использование критериев исключения - а это отсутствие доказанного механизма действия, отсутствие прямого влияния на одно из звеньев репликации вируса, невозможность достижения терапевтической концентрации препарата в плазме крови - позволяет четко ограничить круг эффективных противовирусных средств [26]. В педиатрической практике для проведения химиопрофилактики и терапии гриппа применяют ингибиторы нейраминидазы - осельтамивир (Тамифлю) у детей с 1 года, занамивир (Реленза) - с 5 лет и ингибитор слияния вируса с клеткой умифеновир (Арбидол) - с 3 лет жизни. Препараты римантадина, блокирующего М2-каналы вириона вируса гриппа А и не активного в отношении вируса гриппа В, в настоящее время не рекомендуются ВОЗ для применения из-за высокой распространенности резистентных к препарату штаммов вируса. В отличие от ингибиторов нейраминидазы умифеновир активен не только в отношении вирусов гриппа А и В, но и ряда других возбудителей ОРВИ, применяется и как средство для сезонной профилактики ОРВИ, и как средство экстренной профилактики не только гриппа, но и ОРВИ в детских коллективах, в семейных очагах, в том числе и у беременных женщин, контактировавших с больными, предотвращая развитие у них тяжелых форм заболевания [27, 28].

В комплекс профилактических мер, помимо вакцинации и фармакопрофилактики, входят общеукрепляющие мероприятия, направленные на снижение антигенного воздействия и повышение резистентности организма ребенка в целом - рациональный режим дня, оптимальное питание, закаливающие процедуры, санация местных очагов хронической инфекции; назначение витаминно-минеральных комплексов. Использование комплекса этих мероприятий позволяет снизить частоту острых инфекционных респираторных заболеваний и обострений очагов хронической инфекции.

Полный текст:

Исследования метагенома верхних отделов респираторного тракта у детей показали присутствие пяти основных бактериальных филумов: Proteobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria и Fusobacteria. Выявлены популяционные различия в распределении удельных весов выше перечисленных филумов, но с обязательным доминированием Firmicutes. Доказана роль факторов окружающей среды и времени года на представительство в этих биотопах филумов Firmicutes, Proteobacteria, Bacteroidetes. Рецидивирующие респираторные инфекции, гипертрофия миндалин лимфоидного глоточного кольца, секреторные средние отиты у детей ассоциированы с носительством Haemophilus (H.) parainfluenzae, H. paraphrohaemolyticus, Gemella (G.) haemolysans, G. morbillorum, G. sanguinis, Streptococcus (S.) pneumoniae, S. pseudopneumoniae, S. intermedius, S. agalactiae.

1. Альбицкий В.Ю., Баранов А.А. Часто болеющие дети. Клинико-социальные аспекты. Пути оздоровления. Саратов: Саратовский национальный исследовательский государственный университет им. Н.Г. Чернышевского, 1986. 184 с. [Albitsky V.Yu., Baranov A.A. Chasto boleyushchie deti. Kliniko-sotsial’nye aspekty. Puti ozdorovleniya [Frequently ill children. Clinical and social aspects. The road to recovery]. Saratov: N.G. Chernyshevsky Saratov National Research University, 1986. 184 p.]

2. Бонч-Осмоловская Е.А., Равин Н.В. Анализ полных геномов — очередной этап в развитии микробиологии // Вестник Российской академии наук. 2010. Т. 80, № 11. С. 977–984. [Bonch-Osmolovskaya E.A., Ravin N.V. Analysis of complete genome as successive stage in development of microbiology review. Vestnik Rossiiskoi akademii nauk = Herald of the Russian Academy of Sciences, 2010, vol. 80, no. 11, pp. 977–984. (In. Russ.)]

3. Волкова Р.А., Сколетнева Е.С., Эльберт Е.В., Мыца Е.Д., Давыдов Д.С., Мовсесянц А.А., Меркулов В.А., Бондарев В.П., Борисевич И.В. Проблемы генотипирования микроорганизмов // БИОпрепараты. Профилактика, диагностика, лечение. 2016. Т. 16, № 3 (59). С. 139–144. [Volkova R.A., Skoletneva E.S., El’bert E.V., Mytsa E.D., Davydov D.S., Movsesyants A.A., Merkulov V.A., Bondarev V.P., Borisevich I.V. Genotyping problems of microorganisms. BIOpreparaty. Profilaktika, diagnostika, lechenie = BIO Preparations. Prevention, Diagnosis, Treatment, 2016, vol. 16, no. 3 (59), pp. 139–144. (In Russ.)]

4. Карпова Е.П., Тулупов Д.А. Хронический аденоидит у детей: пособие для врачей. М.: РМАПО, 2009. 54 с. [Karpova E.P., Tulupov D.A. Khronicheskii adenoidit u detei: posobie dlya vrachei [Chronic adenoiditis in children: manual for physicians]. Moscow: Russian Medical Academy, 2009. 54 p.]

5. Кушнарева М.В., Виноградова Т.В., Кешишян Е.С., Парфенов В.В., Кольцов В.Д., Брагина Г.С., Паршина О.В., Гусева Т.С. Особенности иммунного статуса и системы интерферона у детей раннего возраста // Российский вестник перинатологии и педиатрии, 2016. Т. 61, № 3. С. 12–21. [Kushnareva M.V., Vinogradova T.V., Keshishian E.S., Parfenov V.V., Koltsov V.D., Bragina G.S., Parshina O.V., Guseva T.S. Specific features of the immune status and interferon system of infants. Rossiyskiy vestnik perinatologii i pediatrii = Russian Bulletin of Perinatology and Pediatrics, 2016, vol. 61, no. 3, pp. 12–21. doi: 10.21508/1027-4065-2016-61-3-12-21 (In. Russ.)]

6. Раввин Н.В., Шестаков С.В. Геном прокариот // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2013. Т. 17, № 4/2. С. 972– 984. [Ravvin N.V., Shestakov S.V. The Genome of prokaryotes. Vavilovskii zhurnal genetiki i selektsii = Vavilov Journal of Genetics and Breeding, 2013, vol. 17, no. 4/2, pp. 972–984. (In. Russ.)]

7. Романцев М.Г., Ершов Ф.И. Часто болеющие дети: современная фармакотерапия. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2006. 192 с. [Romantsev M.G., Ershov F.I. Chasto boleyushchie deti: sovremennaya farmakoterapiya [Frequently ill children: modern pharmacotherapy]. Moscow: GEOTAR-Media, 2006. 192 p.]

8. Романцов М.Г., Мельникова И.Ю. Часто болеющие дети: вопросы фармакотерапии (научный обзор) // Terra medica. 2014. № 1. С. 55–69. [Romantsov M.G., Melnikova I.Yu. Sickly children: issues of pharmacotherapy (scientific review). Terra Medica, 2014, no. 1, pp. 55–69. (In. Russ.)]

9. Патент 2576839 Российская Федерация. Способ диагностики дисбиотических нарушений в биоптатах слизистой носа и глотки у детей раннего и дошкольного возраста с постоянно рецидивирующими острыми респираторными инфекциями / Тюменев А.В., Шабалдина Е.В., Шабалдин А.В., Рязанцев С.В., Симбирцев А.С. Заявители и патенто-обладатели: Тюменев А.В., Шабалдина Е.В., Шабалдин А.В., Рязанцев С.В., Симбирцев А.С.; завл. 16.10.2013; опубл. 10.03.2016 [Patent 2576839 Russian Federation. A method for diagnosing dysbiotic disorders in biopsies of nasal mucosa and pharynx in children of early and preschool age with recurring acute respiratory infections / Tyumenev A.V., Shabaldina E.V., Shabaldin A.V., Ryazantsev S.V., Simbirtsev A.S. Applicants and patent holders: Tyumenev A.V., Shabaldina E.V., Shabaldin A.V., Ryazantsev S.V., Simbirtsev A.S.; stat. 10.16.2013; publ. 03.10.2016]

10. Патент 2569054 Российская Федерация. Способ определение провоспалительных и проаллергических интерлей-кинов в назальном секрете у детей раннего и дошкольного возраста для диагностики этиологии рецидивирующих острых ринофарингитов и аденоидитов / Тюменев А.В., Шабалдина Е.В., Шабалдин А.В., Симбирцев А.С., Рязан-цев С.В. Заявитель и патентообладатель ГБОУ ВПО Кемеровская государственная медицинская академия МЗ РФ; заявл. 24.09.2013; опубл. 20.11.2014 [Patent 2569054 Russian Federation. Method for the determination of proinflammatory and proallergic interleukins in nasal secretion in children of early and preschool age for diagnosis of the etiology of recurrent acute rhinopharyngitis and adenoiditis / Tyumenev A.V., Shabaldina E.V., Shabaldin A.V., Simbirtsev A.S., Ryazantsev S.V. Applicant and patent holder: Kemerovo State Medical Academy, Ministry of Health of the Russian Federation; stat. 24.09.2013; publ. 20.11.2014]

11. Шабалдина Е.В., Кутенкова Н.Е, Шабалдин А.В., Лисаченко Г.В. Особенности иммунного и цитокинового статусов у детей с гипертрофией лимфоидного глоточного кольца и сопутствующей аллергией к инфекционным антигенам // Российская оториноларингология. 2012. № 2. С. 118–123. [Shabalina E.V., Kutenkova N.E., Shabaldin A.V., Tikhonuk V.P., Lisachenko G.V. Characteristics of immune and cytokine status in children with hypertrophy of lymphoid pharyngeal ring and concomitant allergies to infectious antigens. Rossiiskaya otorinolaringologiya = Russian Otorhinolaryngology, 2012, no. 2, pp. 118– 123. (In. Russ.)]

12. Шабалдина Е.В., Кутенкова Н.Е., Шабалдин А.В., Тихонюк В.П., Лисаченко Г.В. Роль сенсибилизации к инфек-ционным антигенам в патогенезе рецидивирования острых респираторных инфекций у детей // Педиатрия. 2013. № 1. С. 24–33. [Shabalina E.V., Kutenkova N.E., Shabaldin A.V., Tikhonuk V.P., Lisachenko G.V. The role of sensitization to infectious antigens in the pathogenesis of recurrence of acute respiratory infections in children. Pediatriya = Pediatrics, 2013, no. 1, pp. 24–33. (In. Russ.)]

13. Шестаков С.В. Как происходит и чем лимитируется горизонтальный перенос генов у бактерий // Экологическая генетика. 2007. Т. 2, № 5. С. 12–24. [Shestakov S.V. How is and then is limited by horizontal gene transfer in bacteria. Ekologicheskaya genetika = Ecological Genetics, 2007, vol. 2, no. 5, pp. 12–24. (In. Russ.)]

14. Шестаков С.В. Метагеномика микробиома человека // Успехи современной биологии. 2010. Т. 130, № 6. С. 531–543. [Shestakov S.V. Metagenomics of the human microbiome. Uspekhi sovremennoi biologii = Advances in Current Biology, 2010, vol. 130, no. 6, pp. 531–543. (In. Russ.)]

15. Щеплягина Л.А. Секреторный иммунитет кишечника у детей раннего возраста // Педиатрия. 2011. № 3. С. 48–50. [Schepljagina L.A. Secretory immune system of the intestine at children of early age. Pediatriya = Pediatrics, 2011, no. 3, pp. 48–50. (In. Russ.)]

16. Bassis C.M., Erb-Downward J.R., Dickson R.P., Freeman C.M., Schmidt T.M., Yong V.B., Beck J.M., Curtis J.L., Huffnagle G.B., Ravel J. Analysis of the upper respiratory tract microbiotas as the source of the lung and gastric microbiotas in healthy individuals. MBio, 2015, vol. 6, no. 2: e00037-15. doi: 10.1128/mBio.00037-15

17. Benninger M., Brook I., Bernstein J.M., Casey J.R., Roos K., Marple B., Farrar J.R. Bacterial interference in upper respiratory tract infections: a systematic review. Am. J. Rhinolm. Allergy, 2011, vol. 25, no. 2, pp. 82–88. doi: 10.2500/ajra.2011.25.3594

18. Biesbroek G., Tsivtsivadze E., Sanders E.A., Montijn R., Veenhoven R.H., Keijser B.J. Early respiratory microbiota composition determines bacterial succession patterns and respiratory health in children. Am. J. Respir. Crit. Care Med., 2014, vol. 190, no. 11, pp. 1283–1292. doi: 10.1164/rccm.201407-1240OC

19. Bochkov Y.A., Grindle K., Vang F., Evans M.D., Gern J.E. Improved molecular typing assay for rhinovirus species A, B, and C. J. Clin. Microbiol., 2014, vol. 52, no. 7, pp. 2461–2471. doi: 10.1128/JCM.00075-14

20. Bogaert D., Keijser B., Huse S., Rossen J., Veenhoven R., Van Gils E., Bruin J., Montijn R., Bonten M., Sanders E. Variability and diversity of nasopharyngeal microbiota in children: a metagenomic analysis. PLoS One, 2011, vol. 6, no. 2, pp. 17035–17043. doi: 10.1371/journal.pone.0017035

21. Bogaert D., van Belkum A., Sluijter M., Luijendijk A., de Groot R., Rumke H.C. Colonisation by Streptococcus pneumoniae and Staphylococcus aureus in healthy children. Lancet, 2004, vol. 363, iss. 9424, pp. 1871–1872. doi: 10.1016/S0140-6736(04)16357-5

22. Costello E.K., Lauber C.L., Hamady M., Fierer N., Gordon J.I., Knight R. Bacterial community variation in human body habitats across space and time. Science, 2009, vol. 326, iss. 5960, pp. 1694–1697. doi: 10.1126/science.1177486

23. Dickson R.P., Erb-Downward J.R., Huffnagle G.B. The role of the bacterial microbiome in lung disease. Expert Rev. Respir. Med., 2013, vol. 7, iss. 3, pp. 245–257. doi: 10.1586/ers.13.24

24. Dickson R.P., Erb-Downward J.R., Martinez F.J., Huffnagle G.B. The microbiome and the respiratory tract. Annu. Rev. Physiol., 2016, vol. 78, pp. 481–504. doi: 10.1146/annurev-physiol-021115-105238

25. Dickson R.P., Martinez F.J., Huffnagle G.B. The role of the microbiome in exacerbations of chronic lung diseases. Lancet, 2014, vol. 384, iss. 9944, pp. 691–702. doi: 10.1016/S0140-6736(14)61136-3

26. Edwards R.A., Rohwer F. Viral metagenomics. Nat. Rev. Microbiol., 2005, vol. 3, pp. 504–510. doi: 10.1038/nrmicro1163

27. Gao Z., Kang Y., Jun Y., Ren L. Human pharyngeal microbiome may play a protective role in respiratory tract infections. Genom. Proteom. Bioinformat., 2014, vol. 12, iss. 3, pp. 144–150. doi: 10.1016/j.gpb.2014.06.001

28. Hilty M., Burke C., Pedro H., Cardenas P., Bush A., Bossley C., Davies J., Ervine A., Poulter L., Pachter L., Moffatt M.F., Cookson W.O. Disordered microbial communities in asthmatic airways. PLoS One, 2010, vol. 5, iss. 1, e:8578. doi: 10.1371/journal.pone.0008578

29. Jensen A., Fago-Olsen H., Sorensen C.H., Kilian M. Molecular mapping to species level of the tonsillar crypt microbiota associated with health and recurrent tonsillitis. PLoS One, 2013, vol. 8, iss. 2: e56418. doi: 10.1371/journal.pone.0056418

30. Kononen E. Development of oral bacterial flora in young children. Ann. Med, 2000, vol. 32, iss. 2, pp. 107–112. doi: 10.3109/ 07853890009011759

31. Kumar H., Lund R., Laiho A., Lundelin K., Ley R.E., Isolauri E., Salminen S. Gut microbiota as an epigenetic regulator: pilot study based on whole-genome methylation analysis. MBio, 2014, vol. 5, no. 6: e02113-14. doi: 10.1128/mBio.02113-14

32. Lebon A., Labout J.A., Verbrugh H.A., Jaddoe V.W., Hofman A., van Wamel W., Moll H.A., van Belkam A. Dynamics and determinants of Staphylococcus aureus carriage in infancy: the Generation R Study. J. Clin. Microbiol., 2008, vol. 46, no. 10, pp. 3517–3521. doi: 10.1128/JCM.00641-08

33. Lee W.-M., Grindle K., Pappas T., Marshall D.J., Moser M.J., Beaty E.L., Shult P.A., Prudent J.R., Gern J.E. High-throughput, sensitive, and accurate multiplex PCR-microsphere flow cytometry system for large-scale comprehensive detection of respiratory viruses. J. Clin. Microbiol., 2007, vol. 45, no. 8, pp. 2626–2634. doi: 10.1128/JCM.02501-06

34. Liu C.M., Cosetti M.K., Aziz M., Buchhagen J.L., Contente-Cuomo T.L., Price L.B., Keim P.S., Lalwani A.K. The otologic microbiome: a study of the bacterial microbiota in a pediatric patient with chronic serous otitis media using 16SrRNA gene-based pyrosequencing. Arch. Otolaryngol. Head Neck Surg., 2011, vol. 137, no. 7, pp. 664–668. doi: 10.1001/archoto.2011.116

35. Lysholm F., Wetterbom A., Lindau C., Darban H., Bjerkner A., Fahlander K., Lindberg A.M., Persson B., Allander T., Anders-son B. Characterization of the viral microbiome in patients with severe lower respiratory tract infections, using metagenomic sequencing. PLoS One, 2012, vol. 7, no. 2: e30875. doi: 10.1371/journal.pone.0030875

36. Malygina O.G., Bazhukova T.A. Influence of antibiotics on formation of microecology in premature children with low and extremely low body weight at birth. J. Microbiol. Epidemiol. Immunobiol., 2014, no. 1, pp. 61–65. PMID: 24738296

37. Moore H.C., Jacoby P., Taylor A., Harnett G., Bowman J., Riley T.V., Smith D.W., Lehmann D. The interaction between respiratory viruses and pathogenic bacteria in the upper respiratory tract of asymptomatic aboriginal and non-aboriginal children. Pediatr. Infect. Dis. J., 2010, vol. 29, iss. 6, pp. 540–545. doi: 10.1097/inf.0b013e3181d067cb

38. Peterson S.W., Knox N.C., Golding G.R., Tyler S.D., Tyler A.D., Mabon P., Embree J.E., Fleming F., Fanella S., van Domselaar G., Mulvey M.R., Graham M.R. A study of the infant nasal microbiome development over the first year of life and in relation to their primary adult caregivers using cpn60 universal target (UT) as a phylogenetic marker. PLoS One, 2016, vol. 11, no. 3: e0152493. doi: 10.1371/journal.pone.0152493

39. Quintero B., Araque M., van der Gaast-de Jongh C., Escalona F., Correa M., Morillo-Puente S., Vielma S., Hermans P.W.M. Epidemiology of Streptococcus pneumoniae and Staphylococcus aureus colonization in healthy Venezuelan children. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis., 2011, vol. 30, iss. 1, pp. 7–19. doi: 10.1007/s10096-010-1044-6

40. Rajeschwary A., Rai S., Somayaji G., Pai V. Bacteriology of symptomatic adenoids in children. North Am. J. Med. Sci., 2013, vol. 5, no. 2, pp. 113–118. doi: 10.4103/1947-2714.107529

41. Ren T., Ulrike D.G., Nguyen T.N., Kaitlynn E.A., Early S.V., Sale M., Winther B., Wu M. 16S rRNA survey revealed complex bacterial communities and evidence of bacterial interference on human adenoids. Environ. Microbiol., 2012, vol. 15, no. 2, pp. 2–13. doi: 10.1111/1462-2920.12000

42. Sakwinska O., Schmid V.B., Berger B., Bruttin A., Keitel K., Lepage M., Moine D., Bru C.N., Brüssow H., Gervaix A. Nasopharyngeal microbiota in healthy children and pneumonia patients. J. Clin. Microbiol., 2014, vol. 52, no. 5, pp. 1590–1594. doi:10.1128/JCM.03280-13

43. Santee C.A., Nagalingam N.A., Faruqi A.A., DeMuri G.P., Gern J.E., Wald E.R., Lynch S.V. Nasopharyngeal microbiota composition of children is related to the frequency of upper respiratory infection and acute sinusitis. Microbiome, 2016, vol. 4: 34. doi: 10.1186/s40168-016-0179-9

44. Scholz C.F., Poulsen K., Kilian M. Novel molecular method for identification of Streptococcus pneumoniae applicable to clinical microbiology and 16S rRNA sequence-based microbiome studies. J. Clin. Microbiol., 2012, vol. 50, no. 6, pp. 1968–1973. doi: 10.1128/JCM.00365-12

45. Shilts M.H., Rosas-Salazar C., Tovchigrechko A., Larkin E.K., Torralba M., Akopov A., Halpin R., Peebles R.S., Moore M.L., Anderson L.J., Nelson K.E., Hartert T.V., Das S.R. Minimally invasive sampling method identifies differences in taxonomic richness of nasal microbiomes in young infants associated with mode of delivery. Microb. Ecol., 2016, vol. 71, iss. 1, pp. 233–242. doi: 10.1007/s00248-015-0663-y

46. Stearns J.C., Davidson C.J., McKeon S., Whelan F.J., Fontes M.E., Schryvers A.B., Bowdish D.M., Kellner J.D., Surette M.G. Culture and molecular-based profiles show shifts in bacterial communities of the upper respiratory tract that occur with age. ISME J., 2015, no. 9, pp. 1246–1259. doi: 10.1038/ismej.2014.250

47. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome. The Human Microbiome Project Consortium. Nature, 2012, vol. 486, no. 7402, pp. 201–214. doi: 10.1038/nature11234

48. Teo S.M., Mok D., Pham K., Kusel M., Serralha M., Troy N., Holt B.J., Hales B.J., Walker M.V., Hollams E., Bochkov Y.A., Grindle K., Johnston S.L., Gern J.E., Sly P.D., Holt P.G., Holt K.E., Inouye M. The infant nasopharyngeal microbiome impacts severity of lower respiratory infection and risk of asthma development. Cell Host & Microbe, 2015, vol. 17, no. 5, pp. 704–715. doi: 10.1016/j.chom.2015.03.008

Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.