Типирование вируса гриппа а

Типирование Influenza virus A (H1N1, H3N2) – идентификация субтипов вируса гриппа типа А путем качественного выявления в исследуемом материале вирусной нуклеиновой кислоты (РНК).

Идентификация субтипов H1N1 и H3N2 вируса гриппа А методом полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР).

Influenza virus A RT-PCR subtyping, Influenza virus reverse transcription PCR test.

Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Мазок из зева (ротоглотки) и носа, мокрота.

Общая информация об исследовании

Вирус гриппа относится к РНК-содержащим вирусам. Род вирусов гриппа включает три типа вирусов: А, В и С. Вирусная частица имеет сферическую форму, в центре которой находится генетический материал вируса – РНК, а в оболочке присутствуют сложные белки – гемагглютинин (Н) и нейраминидаза (N). Для вирусов гриппа типа А характерна постоянная изменчивость этих поверхностных белков: на данный момент известно 15 вариантов гемагглютинина и 9 вариантов нейраминидазы. Их сочетание в определенной комбинации определяет субтип вируса. Вирусы субтипов H1N1 и H3N2 вызывают сезонный грипп человека.

Попадая в организм человека, вирус гриппа проникает в клетки эпителия слизистой оболочки дыхательных путей и размножается в них. Пораженные вирусом клетки дегенерируют, погибают и отторгаются. Таким образом, в отделяемом дыхательных путей (слизь, мокрота и т.п.) присутствуют погибшие эпителиальные клетки вместе с вирусными частицами.

Идентификация субтипа вируса проводится методом полимеразной цепной реакции. Принцип метода основан на обнаружении в материале специфичных фрагментов вирусной РНК, их избирательном синтезе с образованием огромного числа копий, что позволяет их легко детектировать, в том числе визуально. К преимуществам метода ПЦР можно отнести:

прямое определение наличия возбудителя – выявление специфического участка РНК возбудителя дает прямое указание на присутствие вируса;

высокую специфичность – в исследуемом материале идентифицируется уникальный, характерный только для данного вируса фрагмент РНК;

высокую чувствительность – ПЦР позволяет обнаружить возбудитель, даже если его исходная концентрация в исследуемом материале чрезвычайно мала.

Однако стоит отметить, что обнаружение вирусной РНК методом ПЦР не обязательно указывает на обнаружение жизнеспособного вируса или продолжающееся его размножение.

Для чего используется исследование?

• Для идентификации субтипа вируса гриппа.

Когда назначается исследование?

При нетипичных проявлениях заболевания;

при высоком риске осложнений от гриппа (возраст более 65 и менее 2 лет, беременные, а также женщины в период первых двух недель после родов, лица с хроническими заболеваниями легких, сердца, почек, пациенты с иммунодефицитом или гематологическими заболеваниями);

при идентификации возбудителя у пациентов, заболевших вне эпидемиологического сезона.

Что означают результаты?

Референсные значения: не обнаружено.

Положительный результат – если искомый фрагмент вирусной РНК обнаружен - инфицирование вирусом гриппа А определенного субтипа.

Отрицательный результат – если искомый фрагмент вирусной РНК не обнаружен – отсутствие инфекции.

Что может влиять на результат?

Количество дней, прошедшее от начала болезни (после 4 дней возрастает вероятность необнаружения вируса).

Исследуемый образец – при инфекции нижних дыхательных путей вирус может не выявляться в образце, полученном из верхних дыхательных путей (мазки из носа, ротоглотки). В таких случаях необходимо повторить анализ с исследованием отделяемого нижних дыхательных путей.

• У иммунокомпетентных лиц с неосложненным гриппом вирусовыделение в верхних дыхательных путях, как правило, значительно уменьшается после 4 дней болезни, соответственно, снижается вероятность выделения возбудителя. Поэтому образцы для исследования у таких пациентов должны быть получены в первые четыре дня заболевания, когда выделение вируса максимально. И напротив, у пациентов с ослабленным иммунитетом и при инфекции нижних дыхательных путей (вирусная пневмония) выделение вируса в бронхиальный секрет сохраняется дольше.
• Ожидание результата исследования или отрицательный результат при очевидной клинической картине не должны быть препятствием для назначения противовирусной терапии.

Общий анализ крови с лейкоцитарной формулой

Influenza virus A/H1, РНК [реал-тайм ПЦР]

Mycoplasma pneumoniae, ДНК [ПЦР]

Adenovirus, ДНК [реал-тайм ПЦР]

Streptococcus pneumoniae, ДНК [реал-тайм ПЦР]

Кто назначает исследование?

Инфекционист, терапевт, врач общей практики, педиатр, эпидемиолог.

Литература

Инфекционные болезни: национальное руководство / Под ред. Н. Д. Ющука, Ю. Я. Венгерова. – М.: ГЭОТАР-Медиа, 2009. С. 701-710.

Клиническая лабораторная диагностика: национальное руководство: в 2 т. – T. II / Под ред. В. В. Долгова, В. В. Меньшикова. – М.: ГЭОТАР-Медиа, 2012. С. 649-653.

Guidance for Clinicians on the Use of RT-PCR and Other Molecular Assays for Diagnosis of Influenza Virus Infection by Centers of Disease Control and Prevention, U.S. Department of Health and Human Services, 2016.

Henry's Clinical Diagnosis and Management by Laboratory Methods, 23e by Richard A. McPherson MD MSc (Author), Matthew R. Pincus MD PhD (Author). St. Louis, Missouri : Elsevier, 2016. Page 1316.

Возбудители гриппа – РНК-содержащие вирусы, относятся к семейству Orthomyxoviridae, в котором выделяют три рода – Influenzavirus A, Influenzavirus В и Influenzavirus С, каждый из которых имеет по одному виду – Influenza A virus, Influenza В virus и Influenza С virus. Вирусы гриппа А и В ежегодно вызывают эпидемии большей или меньшей интенсивности практически во всех странах мира. Вирусы гриппа А широко распространены в природе, их выделяют от большинства зверей и птиц, в связи с чем они имеют высокий пандемический потенциал, так как способны преодолевать межвидовые барьеры. Вирусы гриппа В выделяли только от людей. Вирусы гриппа С вызывают спорадические заболевания в форме ОРЗ. Вирусы гриппа А, В и С дифференцируют друг от друга с помощью иммунологических и молекулярно-генетических методов. Вирусы гриппа А дополнительно типируют на подтипы (или субтипы) в соответствии с антигенной структурой поверхностных гликопротеинов: гемагглютинина – на 16 субтипов и нейраминидазы – на 9 субтипов.

После перенесенного гриппа нередко наблюдаются осложнения в виде отитов и синуситов, пневмонии, вследствие присоединения бактериальных инфекций. Наиболее опасен грипп возможным быстрым развитием вирусной пневмонии с геморрагическим синдромом, приводящей к острой дыхательной недостаточности, что характерно для гриппа А/H1N1pdm2009. Дифференциальная диагностика гриппа и других ОРВИ возможна только с помощью лабораторных методов исследования.

Показания к обследованию. Острое начало с высокой лихорадкой (выше 38°С), продолжающейся до 3-х дней и синдромом интоксикации (головная боль преимущественно в области лба, боль в глазных яблоках, ломота в мышцах, сильная слабость) с последующим развитием катаральных явлений.

Материал для исследований

• Мазки из носоглотки – культуральное исследование, обнаружение АГ;
• мокрота, плевральная жидкость, аспираты из зева, БАЛ – выявление РНК вирусов (поражение нижних дыхательных путей);
• мазки со слизистой носоглотки и ротоглотки – выявление РНК вирусов (поражение верхних дыхательных путей);
• сыворотка крови – обнаружение АТ.

Этиологическая лабораторная диагностика включает культуральное исследование, выявление РНК возбудителей и их АГ, обнаружение специфических АТ.

Сравнительная характеристика методов лабораторной диагностики. Культуральное исследование основано на изоляции вирусов в живых культурах клеток млекопитающих или на развивающихся куриных эмбрионах с последующим определением активности гемагглютинации (агглютинации вирусами эритроцитов) и идентификацией субтипов гемагглютинина в реакции торможения гемагглютинации с типоспецифическими сыворотками. Методы отличаются трудоемкостью и длительностью, во многом зависят от качества не стандартизованных реагентов, в связи с чем для рутинной диагностики практически не используется, но применяется в эпидемиологических исследованиях.

При выявлении специфических АТ оценивают нарастание их титра в образцах крови полученных с интервалом в 2 недели (парные сыворотки) с использованием методов РТГА, РСК. Результаты в значительной степени зависят от состояния иммунной системы пациента.

Показания к применению различных лабораторных исследований. Выявление РНК вирусов гриппа методом ПЦР используется для быстрой этиологической диагностики гриппа и скрининга клинического материала в целях эпидемиологического надзора. Выявление АТ используется для определения уровня коллективного гуморального иммунитета, ретроспективной диагностики и ретроспективного анализа природы эпидемических вспышек гриппа.

Особенности интерпретации результатов лабораторных исследований. Исследования методом ПЦР позволяют обнаружить РНК вируса гриппа А, В или С и/или определить подтип вируса гриппа А. Несоблюдение техники получения мазков из носоглотки и ротоглотки или использование данного материала при диагностике вирусной пневмонии, может сильно снизить информативность исследования вплоть до получения отрицательного результата.

Учитывая возможность сочетанного инфицирования вирусами гриппа и другими возбудителями ОРЗ, желательно проведение исследования полного спектра возбудителей.

В связи с недостаточной чувствительностью тестов для выявления АГ методами РИФ и ИХА получение отрицательных результатов при их использовании не исключает возможного инфицирования.

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, пользовательских данных (сведения о местоположении; тип и версия ОС; тип и версия Браузера; тип устройства и разрешение его экрана; источник откуда пришел на сайт пользователь; с какого сайта или по какой рекламе; язык ОС и Браузера; какие страницы открывает и на какие кнопки нажимает пользователь; ip-адрес) в целях функционирования сайта, проведения ретаргетинга и проведения статистических исследований и обзоров. Если вы не хотите, чтобы ваши данные обрабатывались, покиньте сайт.

Copyright ФБУН Центральный НИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 1998 - 2020

! Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, пользовательских данных (сведения о местоположении; тип и версия ОС; тип и версия Браузера; тип устройства и разрешение его экрана; источник откуда пришел на сайт пользователь; с какого сайта или по какой рекламе; язык ОС и Браузера; какие страницы открывает и на какие кнопки нажимает пользователь; ip-адрес) в целях функционирования сайта, проведения ретаргетинга и проведения статистических исследований и обзоров. Если вы не хотите, чтобы ваши данные обрабатывались, покиньте сайт.

Грипп и острые респираторные вирусные инфекции (ОРВИ) остаются глобальной проблемой общественного здравоохранения, представляя собой реальную угрозу здоровью и жизни населению.

В Российской Федерации эпидемический подъём заболеваемости гриппом и ОРВИ в прошедшем эпидсезоне начался- на 3-4 неделе 2019 года (с 14.01 по 27.01) - раньше, чем в предыдущем эпидсезоне 2017/2018г.г. (на 6-7 неделе 2018г.).

Сезонный подъём заболеваемости гриппом и ОРВИ в Москве в эпидсезон 2018/2019 также как и в предыдущем эпидсезоне 201 8/2019 начался в начале сентября 2018 года на 37 неделе (с 10 по 16.09) и, начиная с 12-ой недели 2019 года, в городе началось устойчивое снижение активности эпидемического процесса. Пик заболеваемости по совокупному населению в Москве пришёлся на 5 неделю 2019 года (с 28.01 по 03.02.19г.

Доля циркулирующих вирусов гриппа увеличилась до 50 % (в РФ - до 78,6 %). При этом, на пике заболеваемости в структуре вирусов гриппа превалировали вирусы гриппа A/H₁/N₁/pdmO9 - 53,3 %, доля вирусов гриппа A/H₃N₂/ составила 46,7 %.

Уровень заболеваемости гриппом и ОРВИ в прошедшем эпидсезоне 2018/2019 был на 8,6 % ниже, чем в предыдущем эпидсезоне, при этом показатели заболеваемости, как по совокупному населению, так и в отдельных возрастных группах не достигли эпидемических значений и на пике заболеваемости были ниже расчётных эпидемических пороговых величин.

Анализ эпидемиологических и лабораторных данных показал, что в целом эпидсезон гриппа и ОРВИ 2018/2019 в городе Москве характеризовался умеренной интенсивностью эпидпроцесса и она была меньшей по сравнению с предыдущими двумя эпидсезонами 2016/2017 и 2017/2018; с невысокими показателями, не достигшими на пике заболеваемости эпидемических значений; более ранним началом эпидемического подъёма заболеваемости, вовлечением в эпидемический процесс всех возрастных групп населения; меньшей, по сравнению с предыдущим эпидсезоном длительностью эпидемического подъёма заболеваемости (4 недели),смешанной этиологией возбудителей с широким распространением и высокой активностью вирусов гриппа А с преобладанием вирусов гриппа A(H₃N₂); более низким уровнем госпитализации больных, низкой летальностью среди заболевших гриппом.

В прошедшем эпидсезоне 2018/2019 в г. Москве гриппом и острыми респираторными вирусными инфекциями переболело 21,2 % населения города, было зарегистрировано 2 млн. 616 тыс. 612 больных гриппом и ОРВИ, что на 8,6 % меньше, чем в предыдущем эпидсезоне (2 млн. 862 тыс. 587 человек), показатель 21 177,8 на 100 тыс. населения. На долю детского населения пришлось 62,3 % от всех зарегистрированных случаев, против 44,7 % в предыдущем году. По клиническим диагнозам в городе было выявлено 1 793 больных гриппом. При этом в эпидсезоне 2018/2019 по сравнению с предыдущим эпидсезоном активность вирусов гриппа была выше, в предыдущем эпидсезоне. По данным регистрационного учёта из 1793 случаев - 1 771 случаев лабораторно подтверждены, из них: 902 случая - грипп А без типирования, 108 случаев грипп В, 539 случай - грипп A/HlNl/pdmO9, 204 случаев - A/H3N2/, 15 случаев - грипп без типирования (экспресс-диагностика) и 3 случая - сочетанные вирусы гриппа А и В. В эпидсезоне 2018/2019гг. в Москве не было зарегистрировано случаев заболевания гриппом среди привитых против гриппа.

По данным регистрационного учёта в эпидсезоне 2018/2019 в инфекционные стационара города Москвы с диагнозом ОРВИ или грипп было госпитализировано 63319 больных. В текущем эпидсезоне в городе был зарегистрирован 1 случай заболевания гриппом, осложненным двусторонней внебольничной бронхопневмонией, с летальным исходом у гражданина Боснии и Герцеговины 66 лет, летальность обусловлена вирусом гриппа A/HlNl/pdmO9.

В структуре собственно вирусов гриппа в прошедшем эпидсезоне превалировал вирус гриппа A/H₃N₂/ доля которого составила 59,2 %, вируса гриппа A/HlNl/pdmO9 - 40,8 %.

Самым надёжным и эффективным средством профилактики гриппа по-прежнему остаётся своевременно сделанная прививка. В предэпидемический период эпидсезона 2018/2019гг. за счет всех 3-х источников финансирования в городе было выполнено 7 млн. 870 тыс. прививок, охват прививками против гриппа составил 60,7 % населения (по РФ - 49,0 %).

Согласно рекомендациям Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) по штаммовому составу вакцин на предстоящий эпидсезон 2019/2020 для стран Северного полушария, Комиссия по гриппозным вакцинам и диагностическим штаммам Минздрава России рекомендовала включить в состав противогриппозной вакцины следующие штаммы:

> A/ Kansas/14/2017 (Н3N2)-подобный вирус;

> Вирус типа B/Colorado/06/2017 (линия B/Viktoria/2/87).

Для четырехвалентных вакцин вакцины, содержащей 2 вируса гриппа В, рекомендовано к трём выше указанным вирусам добавить и штамм подобный B/Phuket/3 073/2013 (линия B/Yamagata/16/88).

Если вы нашли ошибку: выделите текст и нажмите Ctrl+Enter

Уважаемые пациенты, в нашем центре Вы можете не только сделать прививку от гриппа, но и сдать анализы на грипп и ОРВИ.
Забор материала производится из носа и ротоглотки.

Взятие анализа	400 руб.
Выявление РНК вируса гриппа А и гриппа В	1300 руб.	1-3 рабочих дня
Идентификация вируса гриппа swine А/Н1N1	1000 руб.	1-3 рабочих дня
Типирование вирусов гриппа A/H1N1 и A/H3N2	1500 руб.	1-3 рабочих дня
Диагностика гриппа (выявление РНК вируса гриппа А и В, типирование вирусов гриппа A/H1N1и A/H3N2)	2600 руб.	1-3 рабочих дня
Диагностика ОРВИ: - Респираторно-синцитиальный вирус (РНК hRSv) - Парагрипп 1 (РНК hPiv) - Парагрипп 2(РНК hPiv) - Парагрипп 3 (РНК hPiv) - Парагрипп 4 (РНК hPiv) - Аденовирус грипп (ДНК hAdv) - Риновирус (РНК hRv) - Метапневмовирус (hMpv) - Коронавирус (hCov) NL-63,229E - Коронавирус (hCov) HKU-1,OC43 - Бокавирус (hBov)	1950 руб.	1-3 рабочих дня
Респираторно-синцитиальный вирус (РНК hRSv)	1050 руб.	1-3 рабочих дня
Парагрипп 1,2,3,4 (РНК hPiv)	1050 руб.	1-3 рабочих дня
Аденовирус грипп (ДНК hAdv)	700 руб.	1-3 рабочих дня
Риновирус (РНК hRv)	700 руб.	1-3 рабочих дня

Что нужно знать о гриппе?

С наступлением холодного времени года резко возрастает число острых респираторных вирусных инфекций (ОРВИ) и гриппа.

Грипп – это высококонтагиозная вирусная инфекция, распространённая повсеместно. Характерные клинические проявления гриппа: внезапное острое начало заболевания, сопровождающееся резким повышением температуры тела (выше 38-40˚С), ознобом, головной болью, болью в мышцах, общей слабостью, кашлем. Болезнь может протекать легко, однако могут наблюдаться тяжёлые формы течения вплоть до смертельных исходов.

Возбудители гриппа – вирусы типов А и В отличаются агрессивностью, исключительно высокой скоростью размножения. За считанные часы после заражения вирус гриппа приводит к глубоким поражениям слизистой оболочки дыхательных путей, открывая возможности для проникновения в неё бактерий. Это объясняет большее число бактериальных осложнений, возникающих при гриппе. Также важной особенностью вирусов гриппа является их способность видоизменяться: практически ежегодно появляются всё новые варианты вирусов, штаммы которых включаются в состав вакцины против сезонного гриппа. Поэтому ежегодно состав вакцины против гриппа меняется в зависимости от видов вируса гриппа превалирующих в данном эпидсезоне.

Чем опасен грипп?

Грипп крайне опасен своими осложнениями:

• Легочные осложнения (пневмония, бронхит). Именно пневмония является причиной большинства смертельных исходов от гриппа.
• Осложнения со стороны верхних дыхательных путей и ЛОР органов (отит, синусит, ринит, трахеит).
• Осложнения со стороны сердечно-сосудистой системы (миокардит, перикардит).
• Осложнения со стороны нервной системы (менингит, менингоэнцефалит, энцефалит, невралгии, полирадикулоневриты).

Грипп часто сопровождается обострением имеющихся хронических заболеваний.

Как защитить себя от гриппа?

Что делать, если Вы заболели гриппом?

Следует остаться дома и немедленно обратиться к врачу. Самолечение при гриппе недопустимо. Именно врач должен поставить диагноз и назначить необходимое лечение, соответствующее Вашему состоянию и возрасту. Необходимо строго выполнять все рекомендации лечащего врача: своевременно принимать лекарства и соблюдать постельный режим во время болезни, так как при заболевании увеличивается нагрузка на сердечно-сосудистую, иммунную и другие системы организма. Рекомендуется обильное питье - горячий чай, клюквенный или брусничный морс, щелочные минеральные воды. Для предупреждения распространения инфекции больного следует изолировать от здоровых лиц (желательно выделить отдельную комнату). Помещение, где находится больной, необходимо регулярно проветривать, предметы обихода, а также полы протирать дезинфицирующими средствами.
Общение с больным, по возможности, следует ограничить. При уходе за больным гриппом следует использовать медицинскую маску (марлевую повязку).

Диагностика ОРВИ

Кроме гриппа причиной ОРЗ может являться ряд других вирусов.

В нашем центре осуществляется диагностика ОРВИ методом ПЦР.
Лабораторный анализ на определение ОРВИ даёт возможность назначить адекватное лечение, точно определить прогноз, не допустить характерных для каждого возбудителя осложнений и в ряде случаев избежать необоснованной антибиотикотерапии.