Классификация вирусов по воз

26 апреля 2013 г.

Просьба принять к сведению, что настоящий документ заменяет предыдущий. Обновления будут публиковаться по мере поступления новой информации.

Вирусы птичьего гриппа A H7 являются группой вирусов гриппа, обычно циркулирующих среди птиц. Вирус птичьего гриппа A(H7N9) представляет одну из подгрупп в составе более крупной группы вирусов H7. Несмотря на то, что иногда происходят случаи инфицирования людей некоторыми вирусами H7 (H7N2, H7N3 и H7N7), случаев инфицирования людей вирусами H7N9 ранее, до недавних сообщений о таких случаях из Китая, не регистрировалось.

На сегодняшний день у большинства пациентов с этой инфекцией развивается тяжелая пневмония. Симптомы включают высокую температуру, кашель и нехватку дыхания. Однако информация о всех проявлениях заболевания, которое может развиваться в результате инфицирования вирусом птичьего гриппа A(H7N9), до сих пор носит ограниченный характер.

В настоящее время ежедневно собираются и публикуются данные о новых зарегистрированных случаях заболевания. Последнюю информацию о случаях заболевания можно найти в разделе "Новости о вспышках болезней".

У нас пока нет ответа на этот вопрос, потому что мы не знаем, что является источником воздействия инфекции на людей. Однако генетический анализ этих вирусов позволяет предположить, что, несмотря на их эволюцию среди птиц, эти вирусы могут более свободно инфицировать млекопитающих, чем другие птичьи вирусы.

С 1996 по 2012 гг. случаи инфицирования людей вирусами гриппа H7 (H7N2, H7N3 и H7N7) регистрировались в Италии, Канаде, Мексике, Нидерландах, Соединенном Королевстве Великобритании и Северной Ирландии и Соединенных Штатах Америки. Большинство из этих случаев было связано со вспышками болезни среди домашних птиц. Инфекции, в основном, протекали в форме конъюнктивита и легкой симптоматики верхних дыхательных путей, за исключением одного смертельного случая, произошедшего в Нидерландах. До событий, регистрируемых в настоящее время, случаев инфицирования людей вирусами гриппа H7 в Китае не регистрировалось.

Да. Все три вируса являются вирусами гриппа A, но отличаются друг от друга. H7N9 и H5N1 считаются вирусами гриппа животных, которые иногда инфицируют людей. Вирусы H1N1 можно подразделить на вирусы, обычно инфицирующие людей, и вирусы, обычно инфицирующие животных.

На данный момент неизвестно, как происходит инфицирование людей. В некоторых подтвержденных случаях пациенты имели контакты с животными или посещали места, где находятся животные. В настоящее время вирус обнаружен у кур, уток и выведенных в неволе голубей, продаваемых на рынках живой птицы неподалеку от мест, где зарегистрированы случаи заболевания. Исследуется возможность передачи инфекции от животных человеку и от человека человеку.

Несмотря на то, что источник инфекции и путь ее передачи неизвестны, для предотвращения инфицирования следует соблюдать основные гигиенические меры предосторожности. Они включают гигиену рук, респираторную гигиену и меры по безопасности пищевых продуктов.

  • Мойте руки до, во время и после приготовления пищи; перед едой; после посещения туалета; после контактов с животными и их отходами; в случае загрязнения рук; и при уходе за больными людьми в вашем доме. Гигиена рук позволяет предотвратить как свое собственное инфицирование (при контактах с зараженными поверхностями), так и передачу инфекции в больницах пациентам, работникам здравоохранения и другим лицам.
  • Мойте руки с мылом под проточной водой при их видимом загрязнении; при отсутствии видимого загрязнения мойте руки водой с мылом или используйте спиртосодержащее очищающее средство для рук.

  • Закрывайте рот и нос медицинской маской, бумажной салфеткой, рукавом или согнутым локтем при кашле и чихании; выбрасывайте использованную салфетку в закрывающееся мусорное ведро сразу после использования; принимайте меры по гигиене рук после контакта с выделениями из дыхательных путей.

Не следует употреблять в пищу больных или умерших от болезней животных.

В районах, где происходят вспышки болезни, мясные продукты можно употреблять в пищу при условии, что они надлежащим образом приготовлены, а во время их приготовления соблюдались надлежащие меры гигиены. Потребление сырого мяса и блюд, содержащих кровь, не приготовленных надлежащим образом, сопряжено с высоким риском, и такую практику следует избегать.

Для предотвращения заражения всегда храните сырое мясо раздельно от приготовленных и готовых к употреблению пищевых продуктов. Никогда не пользуйтесь одними и теми же разделочной доской и ножом при обращении с сырым мясом и другими продуктами. Мойте руки в промежутках между обращением с сырыми и готовыми продуктами и не помещайте приготовленное мясо на ту же тарелку или поверхность, где оно лежало до приготовления. Не используйте сырые яйца или яйца всмятку для приготовления пищи, которая не будет подвергаться надлежащей тепловой обработке. После обращения с сырым мясом тщательно мойте руки водой с мылом. Мойте и дезинфицируйте все поверхности и посуду, соприкасавшиеся с сырым мясом.

При посещении рынков, где ведется торговля живыми животными, избегайте прямых контактов с живыми животными и поверхностями, соприкасающимися с живыми животными. Если вы живете на ферме и разводите животных, предназначаемых для употребления в пищу, таких как свиньи и домашняя птица, обеспечьте, чтобы дети не имели контактов с больными или мертвыми животными; содержите разные виды животных, по возможности, раздельно; и незамедлительно сообщайте местным властям о каких-либо случаях заболевания и падежа животных. Больных или мертвых животных не следует разделывать и готовить для употребления в пищу.

Несмотря на то, что некоторые фактические данные указывают на живую домашнюю птицу в качестве источника инфекции, пока еще нельзя подтвердить, что живая птица является основным и единственным источником инфекции. Нет также и достаточных фактических данных, которые позволили бы исключить другие возможные источники инфекции среди животных и в окружающей среде.

Рынки, где ведется торговля живыми животными, должны регулярно закрываться на небольшие сроки для проведения тщательной гигиенической обработки. Во время такой обработки все птицы временно должны быть убраны с территории рынка. Регулярное выборочное тестирование новых партий птиц, поступающих на рынки, может способствовать более раннему выявлению инфицированных птиц для изъятия.

Кроме того, регулярное техническое обслуживание рынков, где ведется торговля живыми животными, способствует минимизации экономической дестабилизации и доступа потребителей к источникам белка, а также препятствует тому, чтобы торговля птицей осуществлялась через неконтролируемые каналы распределения и сбыта.

Риск передачи вируса может быть значительно снижен при соблюдении надлежащей рыночной практики.

В настоящее время вакцин для предотвращения инфекции птичьего гриппа A(H7N9) у людей нет. Однако изоляция вирусов от первых пациентов и их характеризация уже произведена. Первым шагом в разработке вакцины является отбор вирусов-кандидатов, которые могут быть использованы для изготовления вакцины. ВОЗ в сотрудничестве с партнерами будет продолжать проводить характеризацию имеющихся вирусов птичьего гриппа A(H7N9) с тем, чтобы определить наилучшие вирусы-кандидаты. Затем этим вирусы могут быть использованы для изготовления вакцины в случае, если это окажется необходимым.

Противогриппозные препараты, известные как ингибиторы нейроминидазы, в случае их применения в начале заболевания, эффективны против вируса сезонного гриппа и вируса гриппа A(H5N1). В то же время, опыт использования этих препаратов для лечения инфекции H7N9 незначителен. Кроме того, вирусы гриппа могут становиться устойчивыми к этим препаратам.

На данный момент мы не располагаем достаточными знаниями для того, чтобы определить, существует ли значительный риск для распространения инфекции от человека человеку на уровне отдельных сообществ. В настоящее время такая возможность является предметом эпидемиологических исследований.

Работники здравоохранения имеют частые контакты с пациентами с инфекционными заболеваниями. Поэтому, ВОЗ рекомендует обеспечивать в медицинских учреждениях непрерывное соблюдение надлежащих мер по профилактике инфекций и инфекционному контролю и внимательно следить за состоянием здоровья работников здравоохранения. Наряду со стандартными мерами предосторожности работники здравоохранения, обеспечивающие уход за пациентами с подозреваемой или подтвержденной инфекцией птичьего гриппа A(H7N9), должны принимать дополнительные меры предосторожности.

Местные и национальные органы здравоохранения, помимо прочего, принимают следующие меры:
• Усиленный эпиднадзор в отношении случаев пневмонии неизвестного происхождения для обеспечения раннего выявления и лабораторного подтверждения новых случаев заболевания.
• Эпидемиологическое расследование, включая оценку состояния пациентов с предполагаемыми случаями заболевания и лиц, имевших контакты с пациентами с известными случаями заболевания.
• Тесное сотрудничество с ветеринарными органами для определения источника инфекции.

Теоретически вирус гриппа животных, у которого развилась способность инфицировать людей, может представлять пандемическую угрозу. Однако неизвестно, может ли вирус птичьего гриппа A(H7N9) в действительности вызвать пандемию. Другие вирусы гриппа животных, которые иногда инфицируют людей, не приводили к пандемии.

Число выявленных случаев заболевания в Китае незначительно. ВОЗ не рекомендует принимать какие-либо меры в отношении поездок в Китай и из Китая.

Каких-либо данных о связи настоящих случаев заболевания с китайскими продуктами нет. В настоящее время ВОЗ не рекомендует вводить какие-либо ограничения в отношении торговли.

Нет. Симптомы у этого пациента появились через три дня после его возвращения в Тайвань, Китай.

Вероятность того, что этот пациент мог инфицировать других пассажиров, очень низка. В результате тестирования более 1000 человек, имевших контакты с пациентами с подтвержденными случаями заболевания, не было выявлено каких-либо данных, подтверждающих передачу этого вируса от человека человеку на уровне отдельных сообществ.

ВОЗ не рекомендует вводить какие-либо ограничения на поездки в связи с этим событием. ВОЗ будет продолжать предоставлять обновленную информацию по мере ее поступления.

Со времени появления этого вируса ВОЗ работает в соответствии с Международными медико-санитарными правилами для предоставления информации государствам-членам. ВОЗ работает также с международными партнерами для координации глобальных ответных медико-санитарных мер, включая оценку риска, предоставление обновленной информации о ситуации, предоставление временных рекомендаций в отношении эпиднадзора для органов здравоохранения и технических учреждений здравоохранения, лабораторное тестирование пациентов, инфекционный контроль и клиническое ведение.

ВОЗ будет продолжать работать с государствами-членами и партнерами в области международного здравоохранения и предоставлять обновленную информацию по мере ее поступления.

Военные меряют температуру жителям Ухани. Фото: EPA


  • Лариса Руденко — эксперт Всемирной организации здравоохранения, заведующая отделом вирусологии имени Смородинцева Института экспериментальной медицины.

    — Разные виды коронавирусов известны давным-давно, а что это за новый такой, в чем его особенность?

    — По поводу коронавирусов долго сохранялись сомнения, могут ли они передаваться от человека к человеку. Теперь пришел мутированный вирус, который стал патогенным для человека. То есть он приобрел какие-то новые свойства, которые позволяют ему активно передаваться от человека к человеку, поражать человека, вызывать тяжелые состояния — вплоть до смертельных случаев.

    — Что это за новые свойства?

    — Вирус же должен войти в организм человека, найти нужные рецепторы, связаться с ними и начать размножаться. Если вирус приобретает эту способность — размножаться в организме человека, — то он будет от человека к человеку передаваться.

    Этот вирус преодолел защитный барьер человека и больше не передается только через животных.

    — Как проявляется болезнь, если человек уже заразился?

    — Сначала появляются высокая температура, кашель, насморк — очень похоже на грипп. В этом и опасность коронавируса: очень трудно различить, что это он, а не грипп. Но вирус гриппа размножается в верхних дыхательных путях, а коронавирус — в легких. Поэтому он сразу дает пневмонию, от нее человек в итоге и умирает. Я не знаю последних данных, мне известно о девяти случаях. То есть диагностику нужно проводить очень быстро, чтобы исключить или подтвердить коронавирус.

    — Можно ли провести диагностику достаточно быстро, чтобы сразу начать специфическое лечение?

    — Против коронавируса нет специального препарата. Только общая терапия, как при лечении пневмонии. О лечении я не могу говорить, я не врач. По-видимому, это должны быть какие-то препараты, снижающие общую тяжесть заболевания, снимающие симптомы. В любом случае, надо очень быстро взять у пациента анализ крови и поставить диагноз.

    — Источником заражения коронавирусом называют рынок в китайском городе Ухань: якобы там продают всяких экзотических животных вроде крыс, люди ели и заразились. Почему эта еда стала опасной именно сейчас?

    — Насчет съедобных крыс — это, боюсь, преувеличение. В Китае действительно еда разнообразная. Но заболевание-то пришло не от еды, а от контакта с животными. Почему сейчас — трудно сказать. Появились какие-то благоприятные условия для распространения этого вируса. Какие — пока не могу сказать.

    Читайте также


    — Если мы говорим именно о новом вирусе, значит, есть тесты, способные его точно распознать?

    — В Китае такие диагностические тесты уже разработаны. Насколько я знаю, у нас в Новосибирске тоже подходит к концу разработка тестов, которые позволят поставить данный диагноз.

    — Откуда тогда известно, что у китайских туристов, отправленных на лечение из Пулково, именно ОРВИ, а не коронавирус?

    — В аэропорту сначала просто определяют пассажира с острым респираторным заболеванием: температура и так далее. В специальном боксе его перевозят в стационар, там его тоже помещают в изолированный бокс, и начинается обследование. Если у пациента началась тяжелая пневмония, то это явно коронавирус.

    — Почему не грипп?

    — Вирус гриппа можно сразу выделить, есть тесты. Кроме того, вирус гриппа сначала дает острое респираторное заболевание, а потом у части людей оно уже осложняется пневмонией. А в случае с коронавирусом все сразу начинается пневмонией. У человека кашель, высокая температура, ему делают рентген легких — и видят пневмонию. Уже возникает подозрение на коронавирус.

    — И как понять, что пневмония вызвана именно коронавирусом?

    — Сейчас тест для этого, как я сказала, только разрабатывается. У китайцев он уже есть, у нас пока нет.

    Читайте также


    — Я каждый год прививаю от коронавируса собаку. Есть ли вакцины для людей?

    — Нет, вакцины не существует, ее только начинают разрабатывать в Китае. ВОЗ поставила такую же задачу. Но вы представляете, сколько времени проходит от разработки вакцины до ее применения на практике? Во-первых, сама разработка. Потом начинается лабораторное тестирование вакцины. Есть определенные требования к безопасности и эффективности вакцины — они оцениваются в лабораторных условиях. Потом оценка на волонтерах. Затем надо разработать технологию производства вакцины, утвердить ее. Словом,

    вакцину нельзя сегодня разработать и завтра применять. Это длительный процесс.

    — Насколько длительный?

    — Лет пять. Испытания на животных занимают примерно год. Дальше идет несколько стадий клинических испытаний на волонтерах. Изучаются иммуногенность вакцины, ее безвредность.

    — И эффективность?

    — Эффективность вакцины можно определить только тогда, когда идет активная циркуляция вируса в природе. Иначе эффективность препарата оценить трудно. Только по каким-то клиническим, иммунологическим маркерам. И это занимает несколько лет. Так что рассчитывать на скорое появление вакцины не стоит.

    — Понимаю. Но почему для животных ее разработали, а для людей до сих пор даже не начинали?

    — Потому что коронавирус до сих пор не считался таким актуальным. Как я уже говорила, оставались сомнения, что он может передаваться от человека к человеку. А если нет, то проблема уже не настолько острая.

    — Если бы мы это знали, то, наверное, могли бы процесс как-то остановить. Но это загадка природы.

    Читайте также



    Вирус появился в китайском городе Ухань в конце прошлого года, и на данный момент, только по официальным данным, уже унес жизни 17 человек, более 600 заражены. Власти Ухани приостановили работу общественного транспорта, прекратили все авиарейсы из города, а гражданам рекомендовали не выезжать за его пределы, закрыт и еще один город — Хуанган.

    Клинические признаки и симптомы, о которых сообщают, — лихорадка и пневмония, вирус передается воздушно-капельным путем. Согласно предварительному эпидемиологическому расследованию Всероссийской организации здравоохранения, большинство зараженных были на оптовом рынке морепродуктов Ухани. Китайские ученые предполагают, что источником коронавируса были дикие животные, которыми незаконно торговали в городе.

    Помимо Китая, случаи заражения были зафиксированы и в других странах, в том числе в Таиланде, Южной Корее, Японии и США.

    Ученые из России, США и ряда стран Евросоюза объявили о начале разработок экспресс-тестов для выявления нового вируса. Глава Роспотребнадзора Анна Попова сообщила, что в России начали создавать вакцину от нового вируса, о разработках заявили и американские ученые.

    В связи с появлением нового вируса Роспотребнадзор рекомендует опрашивать приезжающих в страну людей о состоянии их здоровья и измерять им температуру на контрольно-пропускных пунктах по всей границе. 22 января из петербургского аэропорта Пулково госпитализировали двух человек (россиянина и китайца), прилетевших из Шанхая, с подозрением на коронавирус, однако впоследствии диагноз не подтвердился. Обоим мужчинам диагностировали ОРВИ, они продолжают лечение в городской инфекционной больнице Петербурга. У еще одной китаянки в Петербурге вирус не подтвердился, как и у прилетевшей из Китая в Пермь пассажирки. В Приморье у четырех человек с подозрением на заражение новым вирусом впоследствии его тоже не нашли.

    Спасибо, что прочли до конца

    Каждый день мы рассказываем вам о происходящем в России и мире. Наши журналисты не боятся добывать правду, чтобы показывать ее вам.

    В стране, где власти постоянно хотят что-то запретить, в том числе - запретить говорить правду, должны быть издания, которые продолжают заниматься настоящей журналистикой.

    Что такое 2019-nCoV и чего от него ждать

    В китайском Ухане — самом густонаселенном городе Центрального Китая — зафиксирована вспышка вирусной пневмонии, вызванная новым коронавирусом, который передается от человека к человеку. В среду Всемирная организация здравоохранения соберется на экстренное совещание по этому поводу, поскольку речь идет об опасном штамме, в теории способном привести к эпидемии. Что такое коронавирусы, чем они отличаются от других вирусов и в чем их опасность, мы попросили рассказать профессора вирусологии, заведующего лабораторией в Институте вирусологии имени Ивановского, заместителя директора Федерального научного центра экспериментальной ветеринарии Алексея Забережного.

    На сегодня известно, что мы имеем дело с новым типом коронавируса, который так и называется — новый коронавирус 2019 года (2019-nCoV). Люди не впервые сталкиваются с инфекциями, спровоцированными коронавирусами, — вспомним, например, вспышку атипичной пневмонии в Китае в первой половине 2000-х годов.

    Но сперва надо коротко напомнить, что такое вирусы вообще и как они функционируют.

    Вирусное царство очень разнообразно, разновидностей вирусов больше, чем видов растений и животных. При этом, упрощенно говоря, все вирусы делятся на две группы в зависимости от того, на чем они хранят свою наследственную информацию: на ДНК-вирусы и РНК-вирусы.

    У коронавируса самый большой геном, он чемпион среди среди положительных РНК-вирусов. Поэтому это наиболее коварный вирус среди собратьев по классу.


    Некоторые типы вирусов по старой классификации. Коронавирус — крайний слева в верхнем ряду, он действительно слегка похож на корону

    Коронавирусы, например, долгое время вызывали трансмиссивные гастроэнтериты у свиней, то есть размножались в кишечном тракте — этот вид назвали вирусом трансмиссивного гастроэнтерита свиней. А потом вдруг один из них переключился и начал размножаться в респираторном тракте — и его стали называть респираторным коронавирусом свиней.

    Другой коронавирус появился в США в 2013 году, где стал называться вирусом эпизоотической диареи свиней и привел к очень большим экономическим потерям.

    Существует коронавирус, вызывающий инфекционный перитонит у кошек, есть вирус, который вызывает бронхит у кур. Один коронавирус, SARS, способен вызвать атипичную пневмонию, передаваемую летучими мышами (выделен в 2003 году), а другой, MERS, — верблюдами, поэтому его назвали ближневосточным.

    Последняя по времени вспышка инфекции, спровоцированная коронавирусом, началась в Саудовской Аравии. Ближневосточный респираторный синдром, вызванный вирусом MERS-CoV (Middle East respiratory syndrome coronavirus) был впервые зафиксирован осенью 2012 года.

    С этого момента по 8 октября 2019 года ВОЗ получила уведомления в общей сложности о 2,5 тысячи подтвержденных случаях заражения, из которых 851 закончился смертельным исходом. Всего случаи ближневосточного синдрома были выявлены в 27 странах, но примерно 80 процентов случаев были зарегистрированы в Саудовской Аравии.

    Типичные симптомы похожи на SARS — они включают высокую температуру, кашель, одышку. Пневмония является обычным явлением, однако у некоторых людей, инфицированных вирусом, регистрируется отсутствие симптомов. Зафиксированы также гастроэнтерологические симптомы, включая диарею. Смертность среди людей составляет приблизительно 35 процентов.

    Вирус, вызывающий ближневосточный синдром, передается человеку преимущественно от инфицированных одногорбых верблюдов-дромадеров, однако возможна передача вируса и от человека человеку.

    При этом коронавирус — один из самых непредсказуемых вирусов. Есть вирусы предсказуемые — опасные, но предсказуемые, например вирус африканской чумы свиней. Это ДНК-вирус, один из самых больших ДНК-вирусов, известных нам сегодня.

    Сегодня ученые открывают очень много новых вирусов, в вирусологии происходит настоящая революция. Благодаря новым технологиям мы вдруг увидели то, чего раньше не видели, будто кто-то откинул завесу. Оказывается, вирусов гораздо больше и они гораздо более разнообразны, чем мы думали раньше.

    В результате изменилась даже классификация вирусов. Прежде вирусы называли в зависимости от того, как они выглядят под микроскопом. К примеру, коронавирус называется так потому, что под электронным микроскопом у него видны особые шипики, а на них шарики, как у короны.

    Ротавирус — потому что круглый, парвавирус — потому что маленький, и так далее. Теперь же вирусы будут обозначаться буквенно-цифровыми кодами, так вирусов становится слишком много.


    Разнообразное семейство коронавирусов

    Коронавирусы — наши старые знакомые, в частности, они провоцируют насморк вместе с целым букетом вирусов, в том числе респираторно-синцитиальным вирусом человека, вирусом парагриппа, аденовирусами. Все вместе они могут вызвать ОРВИ.

    Но в некоторых случаях за счет мутаций появляются по-настоящему опасные штаммы. Такой вирус приобретает атипичные и патогенные свойства — неудивительно, что люди бывают так встревожены его появлением. Именно к их числу принадлежит и 2019-nCoV.

    По данным испанских коллег, геном нового коронавируса на 80 процентов совпадает с геномом вируса, провоцировавшего атипичную пневмонию. В настоящее время ученые делают генно-инженерный вирус, с помощью которого будет создаваться вакцина.

    По информации британских эпидемиологов, 217 человек с новым коронавирусом госпитализировано, 6 умерло, 36 находятся в тяжелом состоянии. Исходя из статистики заражений, теоретически на сегодня может быть заражено уже около 2000 человек.

    Последняя крупная вспышка инфекции, спровоцированная коронавирусом, началась в Азии осенью 2003 года. В прессе ее прозвали эпидемией атипичной пневмонии, а медики именовали тяжелым острым респираторным синдромом (Severe Acute Respiratory Syndrome, SARS). Сам вирус получил обозначение SARS-CoV.

    Эпидемиологическое расследование показало, что человек впервые заразился этим вирусом в Китае в 2002 году — от дикой циветы, хищника семейства виверровых. По данным ВОЗ, за время эпидемии в 30 странах мира было зарегистрировано более 8,4 тысячи случаев заболевания, погибло более 900 человек. Больше всего жертв было в Китае (почти 350 случаев) и в Гонконге (около 300 случаев).

    Инфекция передавался воздушно-капельным и воздушно-пылевым путем, но на относительно короткое расстояние — чтобы вирус смог попасть в организм, необходимо было оказался на расстоянии не более 10 сантиметров от носителя. Кроме того, выяснилось, что вирус может жить вне носителя около 3-6 часов.

    Болезнь начиналась с лихорадки (температура тела поднималась выше 38 градусов Цельсия), головной боли, дискомфорта. Около 20 процентов пациентов страдали от диареи. Через несколько дней у большинства пациентов начиналась пневмония. Распространение инфекции сдерживали карантинными мерами. ВОЗ официально объявила о конце вспышки в 2004 году.

    Сейчас же новый коронавирус активно изучают в лабораториях. Например, уже производят коронавирусы одного цикла размножения — то есть он способен попасть в организм и даже один раз размножиться, но затем инактивируется. Практически, это настоящая вакцина — благодаря его присутствию организм учится вырабатывать имунный ответ.

    Но главный способ борьбы с 2019-nCoV, как и в случае с SARS, — не вакцинация, а медико-санитарные мероприятия, карантин. К счастью, он не обладает высокой контагиозностью, поскольку в основном передается от животных к человеку и не слишком приспособлен для передачи от человека к человеку.

    В этом его отличие от куда более контагиозных вирусов. Если, например, человек с корью войдет в автобус, то каждый его пассажир получит вирус кори. Та же ситуация с вирусами гриппа или оспы. В случае с коронавирусом это не обязательно так.

    Тем не менее, считать его совсем безопасным не следует. Во-первых, неизвестно, насколько хорошо справится с ним конкретный организм, а во-вторых, коронавирус продолжает оставаться коварным: может менять тканевую специфичность (скажем, из кишечной формы превратиться в респираторную), может менять круг хозяев.

    Наконец, коронавирус может менять свою поверхность, и в этом случае мы не сможем определить его по антителам. Словом, речь идет о вирусе, который не оставит эпидемологов без работы — им всегда будет чем заняться.


    Disclaimer: Я высказываю свое субъективное мнение на базе доступных данных. Мнение профессиональных вирусологов и эпидемиологов может отличаться от моего. В любой непонятной ситуации обращайтесь к материалам ВОЗ.

    Привет, коллеги. Чем больше роюсь в данных по вспышке коронавируса 2019-nCoV, тем меньше мне нравится происходящее, с учетом предыдущих вспышек аналогичных вирусов. Предлагаю пробежаться по истории прошлых эпидемий и попробовать спрогнозировать дальнейшее течение.

    В мире официально объявлена пандемия COVID-19 — потенциально тяжёлой острой респираторной инфекции, вызываемой коронавирусом SARS-CoV-2 (2019-nCoV). На Хабре много информации по этой теме — всегда помните о том, что она может быть как достоверной/полезной, так и наоборот.

    • Cайт Министерства здравоохранения РФ
    • Cайт Роспотребнадзора
    • Сайт ВОЗ (англ)
    • Сайт ВОЗ
    • Сайты и официальные группы оперативных штабов в регионах

    Если вы проживаете не в России, обратитесь к аналогичным сайтам вашей страны.

    Мойте руки, берегите близких, по возможности оставайтесь дома и работайте удалённо.

    Коронавирусы


    Это семейство РНК-вирусов, как правило, вызывает легкие респираторные заболевания. Могут инфицировать различные виды животных, включая человека. Спектр видов очень широк и включает, помимо человека, летучих мышей, собак, свиней, кошек, верблюдов и многих других. Имеют специфическое строение внешней оболочки, напоминающее солнечную корону, из-за которой и получили свое название.

    Они были бы особо ничем не примечательны, если бы не тяжелые разновидности MERS-CoV и SARS-CoV.

    Тяжелый острый респираторный синдром (ТОРС) был впервые зарегистрирован в Китае в 2002 году. Возбудителем являлся коронавирус SARS-CoV. Надо сказать, что вирусы могут иметь большие различия в контексте судьбы клетки-хозяина. Часть вирусов при размножении минимально травмирует клетку-хозяина и оставляет ее в живых. Часть — выходит в среду только после разрушения цитоплазмы эукариотической клетки. SARS-CoV относился как раз к разновидности, уничтожающей носитель в процессе размножения, что приводило к разрушению клеток легочных альвеол в течение острого периода болезни.

    После инкубации в течение 2-10 суток, заболевание начиналось как легкий насморк и типичная ОРВИ. Дальше развитие шло по следующему сценарию:

    1. стадия первичной гриппоподобной инфекции (длится 2-3 дня), состояние больного средней тяжести
    2. стадия иммунодефицита (резкое снижение иммунитета, критическое падение числа лимфоцитов, ухудшение состояния больных, длится 3-4 дня)
    3. стадия атипичной пневмонии, развивающейся на фоне снижения иммунитета и сопровождающейся дистресс-синдромом. Дыхательная недостаточность, отек легких
    4. терминальная стадия, сопровождающаяся токсическим шоком с выраженной недостаточностью функции органов

    Течение в целом благоприятное. 90% пациентов выздоравливало без особых последствий на 6-7 сутки. Это приблизительный срок, необходимый для выработки антител к любому незнакомому антигену.

    У оставшейся группы вирус вызывал тяжелый острый респираторный синдром, летальность которого составила 6-15%, при этом распределение было неравномерным. У пациентов старше 50 лет смертность доходила до 50%. Пациенты нуждались в искусственной вентиляции легких, подаче дополнительного кислорода для компенсации острой легочной недостаточности.

    Всего было зарегистрировано 8437 случаев заболевания, из которых 813 закончились летальным исходом.



    Еще более неприятный вирус MERS-CoV, вызывавший ближневосточный респираторный синдром является зоонозом, то есть резервуаром заболевания являются животные. Первичными носителями, судя по всему, являются летучие мыши и, возможно, верблюды. От человека к человеку он передавался с большим трудом, только при тесном контакте. Клиника очень похожа на SARS, но отличается более агрессивным течением и большей летальностью.

    Относительно благоприятным эпидемиологическим фактором была низкая контагиозность этого коронавируса. Некоторые исследователи полагают, что основная часть заболевших заразилась не от других людей, а от больных животных.

    Уровень смертности среди инфицированных составляет, по разным данным, от 27% до 40%. Всего было зарегистрировано 1154 подтвержденных случая и не менее, чем 431 погибший.

    2019-nCoV


    А теперь о неприятном. Вспышка 2019-nCoV, начавшаяся в Ухане, потенциально является одной из самых значительных опасностей, с которыми сталкивалось человечество. Исходным резервуаром предположительно являются коронавирусы летучих мышей, в частности азиатских подковоносов. В этом регионе Китая летучих мышей употребляют в пищу, что сильно увеличивает риски межвидового переноса в случае мутации.

    Что очень тревожит



    Уже можно делать определенные первичные выводы по этому заболеванию. Инкубационный период зависит от источника вируса. При заражении от животного он составляет 6-12 дней. При заражении от человека — не более 5 дней. Есть опасения, что носитель является заразным в бессимптомный период, когда методы термоконтроля в аэропортах и на вокзалах бесполезны. Можно предположить, что после набора первичного пула нулевых пациентов фактор заражения от животных будет играть небольшую роль в распространении эпидемии.

    Вирус может передаваться от человека к человеку и отличается высокой контагиозностью, что радикально отличает его от предыдущих SARS-CoV и MERS-CoV. Есть такой показатель как basic reproduction number — R0. Он показывает, сколько людей успевает заразить больной за период болезни. Если число меньше 1, то эпидемия гаснет сама собой. Если больше, то оно определяет скорость нарастания эпидемии и возможность пандемии. Например, у кори это число 12-18. Практически достаточно посмотреть на больного издали, чтобы заразиться. Что-то аналогичное у краснухи. Обычный грипп имеет R0 в районе 2-3.

    Последние данные по 2019-nCoV говорят о диапазоне 3.3(95%CI: 2.73-3.96) — 5.47 (95%CI: 4.16-7.10). Если коротко — это дофига. Ощутимо больше, чем у гриппа. В целом, это подтверждается темпами роста заболевших.

    Клиника очень похожа на SARS/MERS. Вначале гриппоподобное состояние, кашель, температура. Затем резкое ухудшение состояния и появление проблем с дыханием на 8-9 сутки с развитием острого респираторного синдрома. Вирус вызывает очень тяжелую пневмонию, разрушая клетки легочных альвеол. Есть риски присоединения бактериальной инфекции.

    Летальность пока очень сложно определить. При 4515 зараженных имеем 60 выздоровевших и 106 умерших. Пропорции 60/106 жуткие, но есть шанс, что через неделю начнут массово выздоравливать заболевшие первой волны, которых начнут выписывать из больницы. Тем не менее проблема ресурсов здравоохранения в мире остается самой большой проблемой для тяжелых больных.

    Пока отсутствует. Не ведитесь на фуфломицины, арбидолы и прочие *фероны. Бессмысленно стимулировать иммунитет, если пациент не успеет синтезировать антитела до отказа дыхательной системы. Препараты прямого действия на вирус пока не изучены, но, возможно, скоро будут какие-то данные. По данным Lancet, пациенты получали антибиотики широкого спектра действия, кортикостероиды как противовоспалительное и различные комбинации противовирусных.

    Есть подозрение, что может оказаться эффективным довольно токсичный рибавирин, который сам по себе обладает тератогенным воздействием (может вызывать уродства плода) и может приводить к смерти из-за подавления кроветворения. Поэтому беременным его нельзя и применение строго под присмотром врача. Он демонстрировал положительные эффекты на SARS.

    Стандартная. Моем руки, избегаем людных мест типа метро. Не подходим ко всем, кто кашляет.

    Обычные маски малоэффективны. Требуются маски классом не ниже N95 с HEPA-фильтром. При этом есть риски заражения через открытые глаза и конъюнктиву.

    Не в ближайшее время. В лучшем случае к 2022-2023 году. 2020 год — испытания на животных. При успешности, 2021 год — на людях, 2022 — тиражирование и производство, 2023 — начало вакцинации. Скорее всего, все будет дольше, если судить по проблемам с прошлыми коронавирусами.

    Резюме

    Все грустно, увы. Пока я полон пессимизма и очень надеюсь, что ошибаюсь. Пока это похоже на тяжелый MERS с высокой летальностью, но с контагиозностью выше гриппа. С учетом скрытого периода и высокой связности крупных городов, стоит ожидать вспышек во всех крупных городах в ближайшую неделю-две.

    Не нужно реагировать на многочисленные фейки. Ищите оригинальные научные источники, например:


    UPD Альтернативные оптимистичные точки зрения

    Есть шанс, что сейчас статистика сильно перекошена легкобольными, которых никто не регистрирует. Что, на мой взгляд, не сильно поможет в контексте высокой пиковой нагрузки на больницы.

    Издательство Wiley открыло бесплатный доступ к научным статьям, посвященным вирусу: secure.wiley.com/Coronavirus2020

    UPD3 Статистика на 30.01.2020

    18%)
    Выздоровело 131
    Умерло 170

    По прежнему тревожит большой процент тяжелых пациентов. Генеральный директор ВОЗ Тедрос Аданом Гебреисус подтверждает процент тяжелых пациентов:

    People who have contracted new #coronavirus are showing a wide range of symptoms. Of known cases, most people exhibit milder symptoms, but about 1 in 5 people have severe illness, including #pneumonia and respiratory failure.

    — Tedros Adhanom Ghebreyesus (@DrTedros) January 29, 2020

    В Википедии есть ссылки на несколько отчетов об умерших (например за 25).
    По этим отчетам получается что среднее время от постановки диагноза до смерти — около 10 дней. Почти все умершие — люди преклонного возраста и с хроническими заболеваниями. Немногие умершие больные среднего возраста прожили 15 дней и больше с момента попадания в больницу.

    Получается, если мы хотим судить от смертности, то умершие на сегодня 170 человек — это в основном те, кто пришел в больницу 10 дней назад или раньше. Т.е. в дни, когда было зафиксировано 200-400 заболевших.

    Если верить, что это вирус не так опасен как SARS и убивает, к примеру каждого 20-го, тогда грубо, 10 дней назад вместо 270 болеющих в реальности было 170*20 = 3400 человек в активной стадии болезни (чтобы получить смертность 1:20 они должны были быть больными но не смертельно).

    Если наоборот, верить что почти все заболевшие были зарегистрированы, тогда это означало бы что смертность от этого вируса в реальности может быть выше чем у SARS. Учитывая, что пока он распространяется по экспоненте, последнее очень было бы очень плохо.

    Получается, статистика которую мы видим — это вершина айсберга. Количество заболевших пока растет в среднем на 50% в сутки потому, что большинство больных ходят по улицам и те меры которые приняты не работают. Тогда возможно пандемии не удастся избежать.

    Другой вариант — заключается в том, реальная смертность у этого вируса действительно на уровне SARS. Тогда не зарегистрированных больных не так много и меры не останавливают эпидемиую по каким-то другим причинам.

    Какой вариант хуже — сложно сказать.

    UPD4 31.01.2020

    dfgwer провел расчеты по имеющимся данным. Прогнозы пугающие и мрачные, с чем я согласен. Робко надеюсь, что проблема в кривой статистике, на которой мы базируемся.

    Сейчас примерно 20% подтвержденных больных в тяжелом состоянии. При этом подтвержденных больных каждый день становится в 1.3-1.5 раз больше. Есть временной лаг между подтверждением и тяжелым течением болезни.

    Я попытался это учесть и вычислить вероятность тяжелого течения для среднего подтвержденного пациента.

    Буду считать что:

    Все тяжелые — подтвержденные больные
    Доля тяжелых сейчас r = 0.2
    Доля подтвержденных больных от всех заболевших с первыми симптомами Х = неизвестно
    Время наступления тяжелого состояния от первых симптомов Тт = 9 дней Тт
    Время подтверждение короновируса для всех больных от первых симптомов Тх = неизвестно
    База экспоненты q = 1.3 — 1.5
    Длительность тяжелого состояния Ту = неизвестно

    Лаг между подтверждением диагноза и тяжелым состоянием t=Тт-Тх

    Сколько человек на 1 дне тяжелого состояния, вычисляю по формуле суммы геометрической прогрессии r=b(1-qTy)/(1-q). Отсюда можно найти b — доля больных на первом дне тяжелой фазы в текущий момент.

    Вероятность тяжелого течения для подтвержденных больных с учетом лага между подтверждением и тяжелым состоянием r
    r = b(1+q+q2+. +qt-1)/1
    где t — лаг между подтверждением и тяжелым состоянием
    k=1+q+q2+. +qt-1
    k — коэффициент на который нужно домножать b, чтобы найти вероятность тяжелого течения с поправкой на временной лаг.

    Выходит от 30% до 100% тяжелых случаев на подтвержденного больного. Если продолжать увеличивать лаг, то выходят бессмысленные результаты больше 100%. Даже в самых оптимистичных оценках выходит 30% для подтвержденных больных.

    Это теперь надо поделить на долю подтвержденных больных, чтобы получить вероятность тяжелого течения для среднего больного.

    Если применить эти же соображения на количество умерших то выходит от 7% до 60% для подтвержденных больных, в зависимости от лага между подтверждением и смертью.
    таблица с вычислениями

    Буду рад, если вы докажете что я ошибаюсь. Если нет, то это полный пиздец с сотнями миллионов трупов. И каждый третий минимум войдет в число тяжелых.

    П.С. Недвижимость подешевеет.

    UPD5 05.02.2020

    Под подозрением 23 260
    Заражено 24 337
    Тяжелых пациентов 3 219 (

    13%)
    Выздоровело 892
    Умерло 491

    Статистика становится более оптимистичной. Уменьшается доля тяжелых пациентов, улучшается соотношение умерших к выздоровевшим пациентам. Похоже, что оптимистичные прогнозы оправдываются в плане того, что лаг у выздоровевших больше, чем у умерших.

    Если жесткий карантин оправдает себя, то скорость распространения вируса может снизиться. Тем не менее, остается очень вероятной эпидемия во вторичных очагах в других странах. Этому способствует несколько факторов:

    1. Схожесть с обычным ОРВИ в начальной стадии. Сейчас сезон гриппа, легко перепутать
    2. Доказана возможность распространения в инкубационном периоде через 24 часа после заражения ()
    3. Нехватка диагностических мощностей и проблемное здравоохранение во многих странах



    Хорошо видно, что пациент 1 инфицирует пациента 3 через сутки. При этом первые симптомы о обоих появятся только через 4 дня.



    У некоторых исследователей есть подозрение в фальсификации данных по заболеваемости из-за слишком точного соответствия квадратичной зависимости практически без разброса.

    Развернутые графики, спасибо glaz_almaz. В трендах видно повышение эффективности диагностики, из-за чего доля подозреваемых начала падать относительно подтвержденных.

    UPD6 10.02.2020

    Ремдесивир — как и рибавирин является аналогом нуклеиновой кислоты и неспецифически препятствует нормальному синтезу РНК. Уже демонстрировал эффективность против SARS/MERS-CoV на моделях клеточных культур, мышах и нечеловекообразных приматах. Сейчас также тестируется против Эболы. Минусы — такой же потенциально токсичный как и Рибавирин.
    Хлорохин — изначально классический препарат против малярийного плазмодия и легкий иммуносупрессор при аутоиммунных заболеваниях, например, ревматоидном артрите, системной красной волчанке. Противовирусный эффект обусловлен повышением pH в эндосомах, что препятствует сборке вирусных белков. Также его противовоспалительный эффект может дать положительный синергический эффект при использовании in vivo. Дешевый, безопасный и применяется уже 70 лет.

    UPD7 11.02.2020

    Хорошая подборка препаратов для лечения коронавирусов на основании Nature reviews (спасибо glaz_almaz).
    www.nature.com/magazine-assets/d41573-020-00016-0/17663286

    UPD8 12.02.2020

    Особенности пациентов:
    — Средний возраст госпитализированных — 47 лет;
    — Категория от 0 до 14 лет — всего 0,9%, от 15 до 49 — 55%, от 50 до 64 — 29%, свыше 65 — 15%;
    — 85% — никогда не курили;
    — инкубационный период: минимальный — 3 дня, максимальный — 24 дня.

    Предварительные выводы: детям почти ничего не грозит, но они, скорее всего, станут бессимптомными разносчиками. Так что, садики и школы будут инкубатором. Также длительная инкубация в сочетании с заразностью в бессимптомный период будут мощным фактором преодоления карантинов.

    Читайте также:

    Пожалуйста, не занимайтесь самолечением!
    При симпотмах заболевания - обратитесь к врачу.

    Copyright © Иммунитет и инфекции