Современные методы лабораторной диагностики сепсиса


Актуальность. Стратегия лечения сепсиса у больных основывается на быстром применении эмпирической антибиотикотерапии. Одновременно у пациента берется кровь на бактериальный посев. Это позволяет значительно снизить летальность при данном тяжелом осложнении. Однако срок культивирования посевов составляет 7 суток, и результат микробиологического анализа может быть получен самое раннее через 24 - 48 часов и может лишь подтвердить инфекционную этиологию и идентифицировать возбудителя (к тому же микробиологический метод малоприменим для культивирования микоплазм, нокардий, риккетсий, хламидий и др. - для их диагностики используются серологические и молекулярно-биологические методы). Таким образом, роль бактериологи ческой лаборатории в первый критический период возникновения сепсиса невелика, и успех лечения полностью определяется правильностью проводимой эмпирической антибиотикотерапии. В случае неэффективности проводимой эмпирической терапии критическое значение приобретает быстрая корректировка лечения, так как каждый час ее задержки повышает вероятность летального исхода на 5 - 8% (Kumar A., Roberts D., Wood K.E., et al., 2006). В этот период выявление возбудителя и определение его чувствительности к антибиотикам приобретает решающее значение. В связи с этим понятен интерес к разработке быстрых и в тоже время чувствительных методов диагностики сепсиса и оценки его тяжести.

Современные методы лабораторной диагностики. В.Н. Чеботкевич, Е.И. Кайтанджан, В.В. Бурылев, Е.Е. Щетинкина (Российский НИИ гематологии и трансфузиологии ФМБА России, Санкт-Петербург, Россия; 2013) провели обзор применяемых микробиологических и молекулярно-биологических методов лабораторной диагностики сепсиса.

Разрабатываются также методы выделения ДНК непосредственно из биоматериалов – образцов цельной крови, плазмы и сыворотки. Экстракция из образцов цельной крови, обработанной ЭДТА, позволяет получить большее количество бактерий, чем при выделении из сыворотки или плазмы. Однако присутствие ингибиторов ПЦР в цельной крови снижает чувствительность этого метода. Показана более высокая чувствительность образцов сыворотки для диагностики бруцеллеза, несмотря на то, что представители рода Brucella являются факультативными внутриклеточными паразитами. Это говорит о необходимости выбирать протокол экстракции при разработке стандартной процедуры выделения. Существуют автоматизированные системы прямой экстракции ДНК из цельной крови. Однако их высокая стоимость ограничивает использование в практических лабораториях.

Дальнейшее совершенствование NAT-технологий диагностики позволит внедрить их в работу практических микробиологических лабораторий. На сегодняшний день, наряду с методологическими трудностями, главным препятствием внедрения NAT технологий является их высокая стоимость, однако развитие и совершенствование этих методов, безусловно, позволит удешевить их проведение и ввести NAT-тестирование в алгоритм диагностики сепсиса.

Протеомные технологии с использованием время-пролетной масс-спектрометрии ( MALDI-TOF MS) позволяют идентифицировать бактерии и грибы по их белковому профилю. Также он позволяет определять некоторые маркеры антибиотикорезистентности. Основным недостатком данной технологии является невозможность ее применения непосредственно для биологических образцов. Здесь требуется предварительное культивирование образцов для увеличения числа микробных тел в пробе. Кроме того, ввиду большой стоимости оборудования этот метод является недоступным для многих лабораторий.

Ряд методов используется для идентификации микробов в положительных микробиологических пробах. Наиболее изученным из не микробиологических тестов является PNA-FISH (AdvanDX, США). Метод основан на гибридизации in situ флуоресцентно меченных пептидно-нуклеотидных проб к ограниченному набору бактерий. Метод удобен для использования, и анализ может быть выполнен за 3 часа. Заявленная фирмой чувствительность и специфичность метода близка к 99 - 100%. В наборе Hyplex BloodScreen (BAG, Германия) используется мультиплексная ПЦР. Возможна идентификация нескольких бактериальных видов, включая метициллино-чувствительные и метициллино-резистентные штаммы стафилококков, стрептококков и энтерококков, а также грамотрицательных бактерий (E. coli, Enterobacter aerogenes, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella spp.). Продолжительность проведения исследования 3 – 4 часа при заявленной чувствительности в дифференцировке различных видов от 96,6 до 100% и специфичности от 92,5 до 100%. Метод позволяет определять маркеры резистентности – гены van и несколько генов -лактамаз. Недавно предложен набор с использованием метода микрочипов для определения большого количества видов бактерий и гена mecA (Mobidiag, Финляндия). Анализ занимает 3 часа с заявленной чувствительностью 94% и специфичностью 96%.

Разрабатываются также методы по индикации микробов непосредственно из крови. Набор SepsiTest (Molzym, Германия) представляет собой метод, основанный на выявлении генов 16S рРНК бактерий и генов 18S рРНК грибов. Потенциально этот метод позволяет провести полную видовую дифференцировку бактерий и грибов с помощью секвенирования генома. Однако имеется большой риск контаминирования пробы на пост-амплификационном этапе исследований и получения ложноположительных результатов. Кроме того, секвенирование для его проведения требует 8 - 12 часов, что не позволяет рассматривать его как метод ранней диагностики сепсиса.

Полный текст:

1. Грувер К.П., Белобородов В.Б., Кузьменко Т.Н. Актуальные аспекты сепсиса. Антибиотики и химиотерапия. 2011, 56 (3-4): 35-40.

2. Ильина В.Н., Субботовская А.И., Князькова Л.Г., Козырева В.С., Скачкова Т.С., Шипулина О.Ю., Сергеевичев Д.С., Субботовский А.П. Применение молекулярно-биологических методов исследования для диагностики инфекции области хирургического вмешательства, вызванной бактериями рода Staphylococcus. Патология кровообращения и кардиохирургия. 2011, 4: 43-46.

3. Савельев В.С., Гельфанд Б.Р (ред.) Сепсис в начале XXI века. Классификация, клиникодиагностическая концепция и лечение. Патолого-анатомическая диагностика. Практическое руководство. М, 2006.

5. Avolio M., Diamante P, Modolo M.L. et al. Direct molecular detection of pathogens in blood as specific rule-in diagnostic biomarker in patients with presumed sepsis: our experience on a heterogeneous cohort of patients with signs of infective systemic inflammatory response syndrome. Shock. 2014, 42 (2): 86-92.

6. Bauer K.A., West J.E., Balada-Llasat J.-M. et al. An antimicrobial stewardship program’s impact with rapid polymerase chain reaction methicillin-resistant Staphylococcus aureus/S. aureus blood culture test in patients with S. aureus bacteremia. Clin. Infect. Dis. 2010, 5: 1074-1080.

7. Becker K., Larsen A.R., Skov R.L. et al. Evaluation of a modular multiplex-PCR methicillin-resistant Staphylococcus aureus detection assay adapted for mecC detection. J. Clin. Microbiol. 2013, 51 (6): 1917-1919.

8. Blaschke A.J., Heyrend C., Byington C.L. et al. Rapid identification ofpathogens from positive blood cultures by multiplex polymerase chain reaction using the Film Array system. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 2012, 74 (4): 349-355.

9. Bloos F., Sachse S., Kortgen A. et al. Evaluation of a polymerase chain reaction assay for pathogen detection in septic patients under routine condition: an observational study. PLoS One. 2012, 7 (9): e46003.

10. Burdino E., Ruggiero T., Allice T. et al. Combination of conventional blood cultures and the SeptiFast molecular test in patients with suspected sepsis for the identification of bloodstream pathogens. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 2014, 79 (3): 287-292.

11. Carrara L., Navarro F., Turbau M. et al. Molecular diagnosis of bloodstream infections with 1 a new dual priming oligonucleotide-based multiplex PCR assay. J. Med. Microbiol. 2013, 62: 16731679.

12. Chang S.-S., Hsieh W-H., Liu T.-S. et al. Multiplex PCR system for rapid detection of pathogens in patients with presumed sepsis - a systemic review and meta-analysis. PLoS One. 2013, 8 (5): e62323.

13. Clerc O., Prod’hom G., Vogne C. et al. Impact of matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry on the clinical management ofpatients with Gram-negative bacteremia: a prospective observational study. Clin. Infect. Dis. 2013, 56: 1101-1107.

14. Drancourt M. Detection of microorganisms in blood specimens using matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry: a review. Clin. Microbiol. Infect. 2010, 16: 16201625.

15. Fantin Y.S., Neverov A.D., Favorov A.V. et al. Base-Calling Algorithm with Vocabulary (BCV) method for analyzing population sequencing chromatograms. PLoS One. 2013, 8 (1): e54835.

16. Fast-track diagnostics. FTD neonatal sepsis. Manual. 2012, V1.

17. Forrest G.N. PNA FISH: present and future impact on patient management. Expert Rev. Mol. Diagn. 2007, 7: 231-236.

18. Gescher D.M., Kovacevic D., Schmiedel D. et al. Fluorescence in situ hybridization (FISH) accelerates identification of Gram-positive cocci in positive blood cultures. Int. J. Antimicrob. Ag. 2008, 32 (S1): S51-S59.

19. Haag H., Locher F., Nolte O. Molecular diagnosis of microbial aetiologies using SepsiTest™ in the daily routine of a diagnostic laboratory. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 2013, 76 (4): 413-418.

20. Jarvinen A.K., Laakso S., Piiparinen P et al. Rapid identification of bacterial pathogens using a PCR- and microarray-based assay. BMC Microbiol. 2009, 9: 161.

21. Kasper D.C., Altiok I., Mechtler T.P. et al. Molecular detection of late-onset neonatal sepsis in premature infants using small blood volumes: proof-of-concept. Neonatology. 2013, 103 (4): 268273.

22. Kommedal O., Karlsen B., Saebо O. Analysis of mixed sequencing chromatograms and its application in direct 16s rRNA gene sequencing of polymicrobial samples. J. Clin. Microbiol. 2008, 46: 3766-3771.

23. Lebovitz E.E., Burbelo P.D. Commercial multiplex technologies for the microbiological diagnosis of sepsis. Mol. Diagn. Ther. 2013, 17 (4): 221-231.

24. Lee A., Mirrett S., Reller L.B., Weinstein M.P Detection of bloodstream infections in adults: how many blood cultures are needed? J. Clin. Microbiol. 2007, 45: 3546-3548.

25. Leggieri N., Rida A., Francois P, Schrenzel J. Molecular diagnosis ofbloodstream infections: planning to (physically) reach the bedside. Curr. Opin. Infect. Dis. 2010, 23: 311-319.

26. Lehmann L.E., Alvarez J., Hunfeld K.-P. et al. Potential clinical utility of polymerase chain reaction in microbiological testing for sepsis. Crit. Care Med. 2009, 37 (12): 3085-3090.

27. Lehmann L.E., Herpichboehm B., Kost G.J. et al. Cost and mortality prediction using polymerase chain reaction pathogen detection in sepsis: evidence from three observational trials. Crit. Care. 2010, 14: R186.

28. Liesenfeld O., Lehman L., Hunfeld K.-P et al. Molecular diagnosis ofsepsis: new aspects and recent developments. Europ. J. Microbiol. Immunol. 2014, 4 (1): 1-25.

29. Lindholm L., Sarkkinen H. Direct identification ofgram-positive cocci from routine blood cultures by using AccuProbe tests. J. Clin. Microbiol. 2004, 42: 5609-5613.

30. Mancini N., Carletti S., Ghidoli N. et al. The era of molecular and other non-culture-based methods in diagnosis of sepsis. Clin. Microbiol. Rev. 2010, 23: 235-251.

31. Mencacci A., Leli C., Montagna P et al. Diagnosis of infective endocarditis: comparison of the LightCycler SeptiFast real-time PCR with blood culture. J. Med. Microbiol. 2012, 61 (6): 881-883.

32. Paolucci M., Capretti M.G., Dal Monte P et al. Laboratory diagnosis of late-onset sepsis in newborns by multiplex real-time PCR. J. Med. Microbiol. 2009, 58: 533-534.

33. Pendleton J.N., Gorman S.P, Gilmore B.F. Clinical relevance of the ESKAPE pathogens. Expert Rev. Anti Infect. Ther. 2013, 11 (3): 297-308.

34. Poritz M.A., Blaschke A.J., Byington C.L. et al. FilmArray, an automated nested multiplex PCR system for multi-pathogen detection: development and application to respiratory tract infection. PLoS One. 2011, 6: e26047.

35. Reuter S., Ellington M.J., Cartwright E.J. et al. Rapid bacterial whole-genome sequencing to enhance diagnostic and public health microbiology. JAMA Intern. Med. 2013, 173 (15): 1397-1404.

36. Rice L.M., Reis A.H.Jr., Ronish B. et al. Design of a single-tube, endpoint, linear-after-the-expo-nential-PCR assay for 17 pathogens associated with sepsis. J. Appl. Microbiol. 2013, 114: 457469.

37. Schreiber J., Nierhaus A., Braune S.A. et al. Comparison of three different commercial PCR assays for the detection of pathogens in critically ill sepsis patients. Med. Klin. Intensivmed. Notfmed. 2013, 108 (4): 311-318.

39. StorhoffJ.J., Lucas A.D., Garimella V et al. Homogeneous detection ofunamplified genomic DNA sequences based on colorimetric scatter of gold nanoparticle probes. Nat. Biotechnol. 2004, 22 (7): 883-887.

40. Tissari P, Zumla A., Tarkka E. et al. Accurate and rapid identification of bacterial species from positive blood cultures with a DNA-based microarray platform: an observational study. Lancet. 2010, 375 (9710): 224-230.

41. Torres-Martos E., Perez-Ruiz M., Pedrosa-Corral I. et al. Evaluacion de la tecnica LightCycler® SeptiFast en recien nacidos y lactantes con sospecha de sepsis. Enferm. Infec. Microbiol. Clin. 2013, 31 (6): 375-379.

42. Vlek A.L.M., Bonten M.J.M., Boel C.H.E. Direct matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry improves appropriateness of antibiotic treatment of bacteremia. PLoS One. 2012, 7 (3): e32589.

43. Wellinghausen N., Wirths B., Essig A. et al. Evaluation of the hyplex bloodscreen multiplex PCR-enzyme-linked immunosorbent assay system for direct identification of gram-positive cocci and gram-negative bacilli from positive blood cultures. J. Clin. Microbiol. 2004, 42: 3147-3152.



Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


Сепсис - угрожающая жизни органная дисфункция, причиной которой является дисрегуляторный ответ организма на инфекцию. Для выявления и диагностики сепсиса рекомендовано использовать шкалы SOFA и qSOFA. Такие серьезные состояния сопряжены с длительным пребыванием в стационаре, частыми осложнениями и высокой смертностью. Когда дорога каждая минута, срочно нужна точная информация. Компания bioMérieux является вашим партнером по лечению сепсиса, позволяя быстро получать достоверные результаты для принятия клинических решений и оптимального лечения пациентов.

Хотите узнать больше ?

Сепсис: дорога каждая минута

Раннее начало лечения сепсиса – спасение жизней

Сепсис – сложный процесс, его роль в заболеваемости и смертности во всем мире сильно недооценена. При том, что ежегодно в мире регистрируют 20-30 миллионов случаев, каждые 3-4 секунды 1 человек умирает от сепсиса 1 . Причина сепсиса — острая ответная реакция иммунной системы организма на тяжелую инфекцию. Отдаленные последствия у выживших после сепсиса включают стойкое повреждение органов и нарушение физических и когнитивных функций 2,3 .

Несмотря на достижения медицины, частота тяжелого сепсиса растет 4,5 . С ростом заболеваемости растут и расходы: в США в период с 1997 по 2008 год стационарное лечение подорожало на 11,9 % 4 ; в Германии за последнее десятилетие расходы на лечение одного типичного случая выросли более чем вдвое 6 .

Ранняя диагностика и соответствующее лечение играют решающую роль в улучшении исходов при сепсисе. Действительно, задержка с лечением резко снижает шансы на выживание. Если пациент получает противомикробную терапию в течение первого часа после установления диагноза, то его шансы выжить приближаются к 80%; каждый час задержки снижает их на 7,6%. При этом у пациентов, первоначально получающих неправильную противомикробную терапию, вероятность выживания снижается в пять раз 7 .

Обновленные руководства

На съезде экспертов Европейского сообщества интенсивной медицины (European Society of Intensive Care Medicine) и Сообщества реанимационной медицины (Society of Critical Care Medicine) принято решение пересмотреть понятие сепсиса. С этой целью в 2014 г. была собрана специальная комиссия из 19 ведущих специалистов в области реанимацинной медицины, инфекционных заболеваний, хирургии и пульмонологии. В период 2014–2015 гг. было проведено обсуждение старых дефиниций и предложены новые.

Органную дисфункцию следует рассматривать как острые изменения в общем количестве баллов по шкале Sepsis-related Organ Failure Assessment (SOFA) на ≥2 пункта как следствие инфекции.

Пациентов с инфекцией, которые имеют высокий риск смерти или длительного нахождения в отделении интенсивной терапии, можно идентифицировать при помощи индекса quick SOFA (qSOFA).

Микробиологическая лаборатория играет решающую роль на всем пути ведения пациентов с сепсисом, особенно в отношении некоторых наиболее важных рекомендаций: стандартного скринингового обследования пациента, диагностики и противомикробной терапии.

Для принятия клинических решений на каждом этапе врачи-клиницисты нуждаются в быстрой и надежной диагностике. Как диагностические методы in vitro помогают решить эту задачу?

Раннее ведение пациента с сепсисом


У пациента с подозрением на сепсис в течение первого часа до начала антимикробной терапии необходимо получить соответствующие культуры (образцы крови для гемокультивирования / посева крови на стерильность или образцы из очага инфекции). Кроме того, быстро (в течение 20 минут) помогут с диагнозом или прогнозом такие биомаркеры, как прокальцитонин (ПКТ). Для скорейшего начала соответствующей терапии важно не только выявить патогенный микроорганизм, но и протестировать его на резистентность к антимикробным препаратам. Мониторинг эффективности антибиотикотерапии следует вести постоянно. Наконец, эпидемиологический надзор и определение профиля антимикробных препаратов помогают выработать местную эпидемиологическую и больничную антимикробную политику.

Компания bioMérieux понимает, что каждый из этих этапов не является отдельным мероприятием, а проводится в рамках непрерывной медицинской помощи, предполагающей тесное сотрудничество между микробиологической лабораторией и клиническими подразделениями. Вот почему мы разработали глобальное ориентированное на пациента решение по ведению сепсиса для помощи на всех этапах. Мы понимаем, что оперативные результаты лабораторных исследований позволяют принимать обоснованные клинические решения и улучшают исходы лечения пациентов.

Рекомендации по выживанию при сепсисе

Компания bioMérieux помогает в решении ваших задач

ДИАГНОСТИКА

  • Получение соответствующих культур в течение 1 часа до начала антибиотикотерапии
  • Подтверждение раннего клинического диагноза
  • Прогностические данные с помощью биомаркеров
  • Мониторинг эффективности антибиотикотерапии для более раннего прекращения антибиотиков

Гемокультивирование / Посев крови на стерильность



Специфические культуры, выделенные из очага инфекции


Идентификация микроорганизмов/ исследование устойчивости к антимикробным препаратам


Тест на прокальцитонина (ПКТ)


ПРОТИВОМИКРОБНАЯ ТЕРАПИЯ

  • Начало эмпирической терапии в течение 1 часа после постановки начального диагноза сепсиса
  • Начальная эмпирическая терапия с учетом особенностей местной эпидемиологической картины и устойчивости (антибиотикограм-ма)

Профили устойчивости к антимикробным препаратам/быстрый отчет о результатах


Сепсис - угрожающая жизни органная дисфункция, причиной которой является дисрегуляторный ответ организма на инфекцию. Для выявления и диагностики сепсиса рекомендовано использовать шкалы SOFA и qSOFA. Такие серьезные состояния сопряжены с длительным пребыванием в стационаре, частыми осложнениями и высокой смертностью. Когда дорога каждая минута, срочно нужна точная информация. Компания bioMérieux является вашим партнером по лечению сепсиса, позволяя быстро получать достоверные результаты для принятия клинических решений и оптимального лечения пациентов.

Хотите узнать больше ?

Сепсис: дорога каждая минута

Раннее начало лечения сепсиса – спасение жизней

Сепсис – сложный процесс, его роль в заболеваемости и смертности во всем мире сильно недооценена. При том, что ежегодно в мире регистрируют 20-30 миллионов случаев, каждые 3-4 секунды 1 человек умирает от сепсиса 1 . Причина сепсиса — острая ответная реакция иммунной системы организма на тяжелую инфекцию. Отдаленные последствия у выживших после сепсиса включают стойкое повреждение органов и нарушение физических и когнитивных функций 2,3 .

Несмотря на достижения медицины, частота тяжелого сепсиса растет 4,5 . С ростом заболеваемости растут и расходы: в США в период с 1997 по 2008 год стационарное лечение подорожало на 11,9 % 4 ; в Германии за последнее десятилетие расходы на лечение одного типичного случая выросли более чем вдвое 6 .

Ранняя диагностика и соответствующее лечение играют решающую роль в улучшении исходов при сепсисе. Действительно, задержка с лечением резко снижает шансы на выживание. Если пациент получает противомикробную терапию в течение первого часа после установления диагноза, то его шансы выжить приближаются к 80%; каждый час задержки снижает их на 7,6%. При этом у пациентов, первоначально получающих неправильную противомикробную терапию, вероятность выживания снижается в пять раз 7 .

Обновленные руководства

На съезде экспертов Европейского сообщества интенсивной медицины (European Society of Intensive Care Medicine) и Сообщества реанимационной медицины (Society of Critical Care Medicine) принято решение пересмотреть понятие сепсиса. С этой целью в 2014 г. была собрана специальная комиссия из 19 ведущих специалистов в области реанимацинной медицины, инфекционных заболеваний, хирургии и пульмонологии. В период 2014–2015 гг. было проведено обсуждение старых дефиниций и предложены новые.

Органную дисфункцию следует рассматривать как острые изменения в общем количестве баллов по шкале Sepsis-related Organ Failure Assessment (SOFA) на ≥2 пункта как следствие инфекции.

Пациентов с инфекцией, которые имеют высокий риск смерти или длительного нахождения в отделении интенсивной терапии, можно идентифицировать при помощи индекса quick SOFA (qSOFA).

Микробиологическая лаборатория играет решающую роль на всем пути ведения пациентов с сепсисом, особенно в отношении некоторых наиболее важных рекомендаций: стандартного скринингового обследования пациента, диагностики и противомикробной терапии.

Для принятия клинических решений на каждом этапе врачи-клиницисты нуждаются в быстрой и надежной диагностике. Как диагностические методы in vitro помогают решить эту задачу?

Раннее ведение пациента с сепсисом


У пациента с подозрением на сепсис в течение первого часа до начала антимикробной терапии необходимо получить соответствующие культуры (образцы крови для гемокультивирования / посева крови на стерильность или образцы из очага инфекции). Кроме того, быстро (в течение 20 минут) помогут с диагнозом или прогнозом такие биомаркеры, как прокальцитонин (ПКТ). Для скорейшего начала соответствующей терапии важно не только выявить патогенный микроорганизм, но и протестировать его на резистентность к антимикробным препаратам. Мониторинг эффективности антибиотикотерапии следует вести постоянно. Наконец, эпидемиологический надзор и определение профиля антимикробных препаратов помогают выработать местную эпидемиологическую и больничную антимикробную политику.

Компания bioMérieux понимает, что каждый из этих этапов не является отдельным мероприятием, а проводится в рамках непрерывной медицинской помощи, предполагающей тесное сотрудничество между микробиологической лабораторией и клиническими подразделениями. Вот почему мы разработали глобальное ориентированное на пациента решение по ведению сепсиса для помощи на всех этапах. Мы понимаем, что оперативные результаты лабораторных исследований позволяют принимать обоснованные клинические решения и улучшают исходы лечения пациентов.

Рекомендации по выживанию при сепсисе

Компания bioMérieux помогает в решении ваших задач

ДИАГНОСТИКА

  • Получение соответствующих культур в течение 1 часа до начала антибиотикотерапии
  • Подтверждение раннего клинического диагноза
  • Прогностические данные с помощью биомаркеров
  • Мониторинг эффективности антибиотикотерапии для более раннего прекращения антибиотиков

Гемокультивирование / Посев крови на стерильность



Специфические культуры, выделенные из очага инфекции


Идентификация микроорганизмов/ исследование устойчивости к антимикробным препаратам


Тест на прокальцитонина (ПКТ)


ПРОТИВОМИКРОБНАЯ ТЕРАПИЯ

  • Начало эмпирической терапии в течение 1 часа после постановки начального диагноза сепсиса
  • Начальная эмпирическая терапия с учетом особенностей местной эпидемиологической картины и устойчивости (антибиотикограм-ма)

Профили устойчивости к антимикробным препаратам/быстрый отчет о результатах


Руководитель - к.м.н., врач-бактериолог высшей категории Поликарпова Светлана Вениаминовна

ПРИОРИТЕТНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТИ

В бактериологической лаборатории выполняются следующие виды анализов:

- бактериологическое исследование крови (гемокультура) и ликвора;
- бактериологическое исследование мокроты, трахеального аспирата, промывных вод бронхов;
- бактериологическое исследование отделяемого из различных очагов воспаления: тонзилло-фарингиты, отиты, синуситы и др.;
- бактериологическое исследование пунктатов, выпотов, экссудатов;
- бактериологическое исследование отделяемого со слизистой оболочки зева и носа на условно патогенную микрофлору;
- бактериологическое исследование мочи с определением степени бактериурии;
- бактериологическое исследование отделяемого половых органов на условно патогенную микрофлору;
- бактериологическое исследование отделяемого конъюнктивы;
- исследование фекалий на патогенную кишечную флору;
- бактериологическое исследование кала на дисбактериоз;
- бактериологическое исследование грудного молока;
- качественное определение антигена стрептококков группы В;
- качественное определение антигена Helicobacter pylori в фекалиях человека;
- качественное определение антигена токсинов А и В Clostridium difficile в фекалиях человека;
- оценка чувствительности/устойчивости выделенных микроорганизмов к антибиотикам.


В бактериологической лаборатории проводятся исследования по выделению, идентификации и определению чувствительности к антибиотикам патогенных и условно патогенных микроорганизмов, выделенных из различных биоматериалов.

В работу лаборатории, базирующуюся на принципах классической клинической микробиологии, внедрены новые методы исследований, которые основаны на последних достижениях молекулярно-генетических технологий.

Бактериологическая лаборатория выполняет микробиологические исследования, отвечающие современным российским и международным стандартам.

Ежегодно сотрудники лаборатории осуществляют бактериологическое обследование более 10000 больных, госпитализированных в отделения стационара, 6000 пациенток и новорожденных родильного дома, более 5000 пациентов КДЦ и поликлиник ВАО с выполнением более 45000 микробиологических анализов в год.


Для обеспечения надлежащего качества микробиологических исследований в работу лаборатории внедряются:

  • Система менеджмента качества по стандарту ГОСТ Р ИСО 15189 -15

  • Основы LEAN технологий (Бережливое производство) – подходы к управлению лабораторией, направленные на повышение качества работы за счет сокращения потерь: материальных, финансовых, временных;
  • Система 5S- инструмент бережливого производства – организация рабочего пространства с целью создания оптимальных условий для выполнения операций, поддержания порядка, чистоты, аккуратности, экономии времени и энергии.

За время существования подразделения в лаборатории выполнены 2 кандидатские диссертации. Сотрудники подразделения регулярно выступают с докладами на международных, Всероссийских, городских съездах, конференциях, симпозиумах и семинарах, регулярно публикуются в научно-практических печатных изданиях.

Бактериологическая лаборатория сотрудничает:

  • ФГБУ «Федеральный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии

Научная работа осуществляется по следующим направлениям:

  • микробиологическая диагностика и профилактика инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (ИСМП). Микробная экология в ЛПУ.
  • особенности микробиологической диагностики инфекций нижних дыхательных путей у больных муковисцидозом;
  • изучение механизмов резистентности энтеробактерий к антимикробным препаратам;
  • разработка алгоритмов экспресс-диагностики носительства стрептококков группы В у беременных и новорожденных.

В настоящее время бактериологическая лаборатория оснащена современным оборудованием:

  • Автоматический анализатор гемокультур VеrsaTREK (TREK Diagnostic Systems) – возможность диагностики сепсиса в максимально короткие сроки- 90% положительных результатов выявляются в течение первых суток. Максимальное время протокола исследования занимает 5
  • Бактериологический анализатор для идентификации и определения чувствительности микроорганизмов Phoenix 100 (BD) – cреднее время получения результата идентификации 6-8 часов, среднее время получения результата чувствительности к антимикробным препаратам 12-16 часов.
  • Полуавтоматический анализатор iEMSReader (ThermoLabsystems), позволяющий проводить не только идентификацию и определение чувствительности микроорганизмов, но и решать многие практические и научно-практические задачи: определение микробной обсемененности мочи и других биоматериалов, осуществлять лабораторный контроль эффективности проводимой антибактериальной терапии, оценивать бактерицидную активность сыворотки крови, а также исследовать кинетические модели роста микроорганизмов.

Пивкина Надежда Васильевна

Тимофеева Ольга Геннадьевна

Бондаренко Наталья Александровна

Врач-бактериолог первой категории, член Федерации лабораторной медицины (ФЛМ). Является соавтором многих научных статей по проблемам клинической микробиологии. Стаж работы по специальности с 1988 года.

Балина Валерия Владимировна

Средний медицинский персонал

В лаборатории работают:

  • 1 медицинский технолог
  • 1 медицинский лабораторный техник
  • 5 фельдшеров-лаборантов
  • 1 лаборант
  • Все сотрудники имеют высшую квалификационную категорию.

Читайте также:

Пожалуйста, не занимайтесь самолечением!
При симпотмах заболевания - обратитесь к врачу.

Copyright © Иммунитет и инфекции