Что такое аналитическая чувствительность рнк вируса гепатита с-100 ме мл

Исследование для выявления возбудителя гепатита C (HCV), в ходе которого с помощью метода полимеразной цепной реакции в реальном времени (РТ-ПЦР) определяется наличие генетического материала (РНК) вируса и его количество (вирусная нагрузка) в образце крови.

РНК HCV может быть обнаружена в концентрации, находящейся за нижней границей линейного диапазона концентраций. Линейный диапазон концентраций – это диапазон, в котором можно точно посчитать количество копий возбудителя. Для данного анализа линейный диапазон концентраций РНК HCV, определяемых тест-системой: 150-1*10^8 МЕ/мл.

Вирус гепатита С (ВГС), количественное определение РНК.

Синонимы английские

Hepatitis C Virus RNA, Quantitative, Real-Time PCR, Blood, HCV Viral Load, Hepatitis C Virus RNA Quant.

Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Как правильно подготовиться к исследованию?

  • Не курить в течение 30 минут до исследования.

Общая информация об исследовании

Вирус гепатита С (HCV) – РНК-содержащий вирус из семейства Flaviviridae, который поражает печень. Он способен размножаться в клетках крови (нейтрофилах, моноцитах и макрофагах, В-лимфоцитах) и вызывать криоглобулинемию, болезнь Шегрена и В-клеточные лимфопролиферативные заболевания. HCV благодаря высокой мутационной активности способен избегать воздействия защитных механизмов иммунной системы. Существует 6 генотипов и множество субтипов вируса, которые имеют разные значения для прогноза развития заболевания и эффективности противовирусной терапии.

Основной путь передачи инфекции – через кровь (препараты для переливания элементов крови и плазмы, донорские органы, нестерильные шприцы, иглы, инструменты для татуирования, пирсинга). Вероятно заражение при половом контакте и ребенка от матери во время родов, но это случается нечасто.

Острый вирусный гепатит, как правило, характеризуется бессимптомным течением и остается невыявленным в большинстве случаев. Только у 15 % инфицированных заболевание протекает остро – с тошнотой, ломотой в теле, отсутствием аппетита и потерей веса (редко сопровождается желтухой). У 60-85 % инфицированных развивается хроническая инфекция, что в 15 раз превышает частоту хронизации при гепатите В. Хронический вирусный гепатит С протекает с повышением печеночных ферментов и скудным проявлением симптомов. У 20-30 % больных заболевание приводит к циррозу печени, увеличивая риск развития печеночной недостаточности и гепатоцеллюлярной карциномы.

Выявление РНК HCV свидетельствует о размножении вируса в организме и является методом диагностики заболевания. Генетический материал вируса можно обнаружить с помощью ПЦР через 10-12 дней после инфицирования – в этот период специфические антитела, которые образуются через несколько месяцев после заражения, отсутствуют и биохимические показатели функции печени находятся в пределах референсных значений.

Посредством ПЦР выявляют РНК вируса качественно или количественно. Благодаря качественному методу подтверждается присутствие вируса гепатита С и его активное размножение. Количественное определение вирусной нагрузки с учетом генотипа HCV позволяет контролировать проводимую терапию и прогнозировать течение болезни.

Эффективность лечения оценивается по количеству РНК до и во время терапии. Обычно вирусная нагрузка крови снижается в несколько раз за первые три месяца успешного лечения. При эффективной терапии виремия уменьшается на два порядка в первые 4-12 недель лечения и после окончания курса терапии генетический материал вируса в крови не обнаруживается. Отсутствие снижения виремии через 12 недель с начала лечения указывает на его неэффективность. Рекомендовано проводить анализ до начала терапии, на 4-й, 12-й и 24-й неделях лечения и через 24 недели после окончания курса. Длительность терапии и периодичность количественного определения РНК вируса гепатита С зависит от генотипа вируса и степени повреждения печени.

Для чего используется исследование?

  • Для подтверждения диагноза "вирусный гепатит С".
  • Для прогнозирования течения вирусного гепатита С.
  • Для мониторинга противовирусной терапии и решения вопроса о дальнейшей тактике лечения.

Когда назначается исследование?

  • При качественном обнаружении РНК вируса гепатита С.
  • При остром и хроническом вирусном гепатите С.
  • При микст-гепатитах.
  • При планировании, во время и после окончания противовирусной терапии.

Что означают результаты?

Референсные значения: не обнаружено.

  • Не обнаружено – РНК вируса гепатита С не обнаружена или значение ниже предела чувствительности метода (50 МЕ/мл).
  • 1*10^8 МЕ/мл – РНК вируса гепатита С обнаружена в концентрации выше линейного диапазона концентраций.

Линейный диапазон концентраций РНК вируса гепатита С, определяемых тест-системой, составляет 150-1*10^8 МЕ/мл.

  • Уровень вирусной нагрузки крови не указывает на степень повреждения печени и тяжесть заболевания. Для их оценки необходимо исследовать биохимические показатели и материалы биопсии.
  • При планировании лечения очень важно определить генотип вируса гепатита С.

Кто назначает исследование?

Литература

  • Возианова Ж.И. Инфекционные и паразитарные болезни: В 3х т. - К.: Здоровье, 2000. – Т.1.: 600-690.
  • Кишкун А.А. Иммунологические и серологические исследования в клинической практике. - М.:ООО МИА, 2006. – 471-476 с.
  • Harrison's Principles of Internal Medicine. 16 th ed. NY: McGraw-Hill; 2005: 1822-1855.
  • Lerat H, Rumin S, Habersetzer F, and others. In vivo tropism of hepatitis C virus genomic sequences in hematopoietic cells: influence of viral load, viral genotype, and cell phenotype. Blood. 1998 May 15;91(10):3841-9.PMID:9573022.
  • Revie D, Salahuddin SZ. Human cell types important for hepatitis C virus replication in vivo and in vitro: old assertions and current evidence. Virol J. 2011 Jul 11;8:346. doi: 10.1186/1743-422X-8-346. PMID:21745397.

С осени 2011 г. в ТНИИКИП проводятся следующие исследования методом ПЦР:

Забор крови в вакутейнер с ЭДТА (сиреневая пробка)

Хранить не более 6 ч

Ожидание результата 10 дней

Для контроля изменения вирусной нагрузки в процессе лечения

Чувствительность: 300 ГЭ/мл, линейный диапазон измерения:300-3х108 ГЭ/мл

Забор крови в вакутейнер с ЭДТА (сиреневая пробка)

Хранить не более 6 ч

Ожидание результата 10 дней

Забор крови в вакутейнер с ЭДТА (сиреневая пробка)

Хранить не более 6 ч

Ожидание результата 10 дней

Для контроля изменения вирусной нагрузки в процессе лечения

Чувствительность: 500 МЕ /мл, линейный диапазон измерения: 500-5х107 МЕ/мл

Забор крови в вакутейнер с ЭДТА (сиреневая пробка)

Хранить не более 6 ч

Ожидание результата 10 дней

Для подбора оптимальной терапии

Чувствительность: 104 МЕ/мл

Забор крови в вакутейнер с ЭДТА (сиреневая пробка)

Хранить не более 6 ч

Ожидание результата 10 дней

Забор крови в вакутейнер с ЭДТА (сиреневая пробка)

Хранить не более 6 ч

Чувствительность: 400 копий/мл

Ожидание результата 10 дней

Материал для исследования: плазма или лейкоциты крови, слюна, смывы и мазки из ротоглотки, моча (а также амниотическая жидкость, спинномозговая жидкость, бронхоальвеолярный лаваж)

Забор в стерильную посуду:

моча – в стерильный контейнер на 60 мл, сбор первой утренней порции 20-30 мл, доставить в течение 6 ч.

мазки из ротоглотки – стерильным зондом в специальную пробирку с транспортной средой для респираторных мазков,

забор крови в вакутейнер с ЭДТА (сиреневая пробка), хранить не более 6 ч

Чувствительность: 400 копий/мл (безклеточный материал) или 5 копий ДНК CMV на 10 5 клеток (для клеток). Линейный диапазон измерения: 500-10 7 копий/мл.

Ожидание результата 10 дней

Материал для исследования: плазма или лейкоциты крови, слюна, смывы и мазки из ротоглотки, моча (а также амниотическая жидкость, спинномозговая жидкость, бронхоальвеолярный лаваж)

Забор в стерильную посуду:

моча – в стерильный контейнер на 60 мл, сбор первой утренней порции 20-30 мл, доставить в течение 6 ч.

мазки из ротоглотки – стерильным зондом в специальную пробирку с транспортной средой для респираторных мазков,

забор крови в вакутейнер с ЭДТА (сиреневая пробка)

хранить не более 6 ч

Чувствительность: 400 копий/мл, 5 копий ДНК EBV на 10 5 клеток Линейный диапазон измерения: 500 – 10.000.000 копий/мл.

Ожидание результата 10 дней

Материал для исследования: осадок утренней мочи, соскобы и мазки

Забор в стерильную посуду:

моча – в стерильный контейнер на 60 мл, сбор первой утренней порции 20-30 мл, доставить в течение 6 ч.

мазки урогенитальные – в специальную пробирку с транспортной средой, на приеме у гинеколога/уролога провести сбор мазка стерильным зондом или цитощеткой в пробирку с транспортной средой для мазков ТСМ, доставить на исследование в течение 2 суток

Чувствительность: 10 3 ГЭ/мл

Ожидание результата 10 дней

Материал для исследования: смывы с объектов окружающей среды, бронхо-альвеолярный лаваж, моча, кровь,

Забор в стерильную посуду:

смывы – специальным стерильным зондом в специальную пробирку с транспортной средой для респираторных мазков,

моча – в стерильный контейнер на 60 мл, сбор первой утренней порции 20-30 мл,

Доставить в течение 6 ч.

кровь – в вакутейнер с ЭДТА

Чувствительность: 10 2 –10 3 м.т./мл.

Ожидание результата 10 дней

11. Комплексное выявление возбудителей острых кишечных инфекций в одном образце фекалий: одновременное выявление и дифференциация ДНК (РНК) микроорганизмов рода Шигелла (Shigella spp.) и энтероинвазивных E. coli (EIEC), Сальмонелла (Salmonella spp.) и термофильных Кампилобактерий (Campylobacter spp.), аденовирусов группы F (Adenovirus F) и ротавирусов группы А (Rotavirus A), норовирусов 2 генотипа (Norovirus 2 генотип) и астровирусов (Astrovirus))

Материал для исследования – фекалии

Забор: в специальный стерильный контейнер,
собрать кал из продезинфицированного судна одноразовой лопаточкой на крышке контейнера, доставить в течение 6 ч

Ожидание результата 10 дней

Материал для исследования: соскобное отделяемое слизистых оболочек урогенитального тракта, прямой кишки, ротоглотки; отделяемое конъюнктивы глаз; образцы мочи

Забор в стерильную посуду:

моча – в стерильный контейнер на 60 мл, сбор первой утренней порция 20-30 мл, доставить в течение 6 ч.

мазки урогенитальные – в специальную пробирку с транспортной средой, на приеме у гинеколога/уролога провести сбор мазка стерильным зондом или цитощеткой в пробирку с транспортной средой для мазков ТСМ, доставить на исследование в течение 2 суток

Стоимость услуги: 2350 руб.* Заказать
Срок исполнения: 2 - 7 к.д.
  • Вирус гепатита С (Hepatitis C Virus), количественное определение РНК (ультрачувствительный метод) 5650 руб. 123 Заказать
Заказать В составе комплекса дешевле Указанный срок не включает день взятия биоматериала

Не менее 3 часов после последнего приема пищи. Можно пить воду без газа.

Метод исследования: ПЦР

Вирусный гепатит С (ВГС) — инфекционное заболевание с парентеральным механизмом передачи, возбудителем которого является РНК-содержащий вирус гепатита С. Инкубационный период — в среднем 6-8 недель. Заболевание характеризуется высокой частотой формирования хронических форм и последующим развитием цирроза печени и гепатоцеллюлярной карциномы.

Выявление РНК ВГС является подтверждением острого или хронического гепатита С. Тест используется для диагностики ВГС-инфекции на ранних сроках инфицирования, оптимален для тестирования донорской крови и оценки ответа на противовирусное лечение.

ПОКАЗАНИЯ К ИССЛЕДОВАНИЮ:

  • Диагностика скрытых (латентных) форм вирусных гепатитов В и С;
  • Оценка эффективности проводимой противовирусной терапии;
  • Раннее выявление острых вирусных гепатитов В и С у контактных лиц.

ИНТЕРПРЕТАЦИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ:

Референсные значения (вариант нормы):

Параметр Референсные значения Единицы измерения
РНК HCV (качественное ультрачувствительное исследование) Не обнаружено

Комментарий к РНК HCV: Аналитическая чувствительность исследования для определения РНК вируса гепатита С -10 МЕ/мл.

Выявление РНК вируса гепатита С - доказательство инфицированности ВГС.

Результаты лабораторных исследований при различных вариантах инфекции, вызванной ВГС*
Клиническая ситуацияanti-HCVРНК ВГС
  • Острый гепатит С
  • Хронический гепатит С (РНК ВГС персистирует в сыворотке более 6 месяцев)
++
  • Острый гепатит С
  • Ложноположительные и ложноотрицательные результаты исследования
  • Разрешение острого гепатита С
  • Пациенты с острым или хроническим гепатитом С, которым успешно была проведена терапия
+-
  • Ранняя стадия острого гепатита С
  • Хронический гепатит С
  • Ложноположительный результат на РНК ВГС (редко)
-+
  • Отсутствие инфицирования вирусом гепатита С
--

*Рекомендации по диагностике и лечению взрослых больных гепатитом С, 2013.

" ["serv_cost"]=> string(4) "2350" ["cito_price"]=> NULL ["parent"]=> string(2) "25" [10]=> string(1) "1" ["limit"]=> NULL ["bmats"]=> array(1) < [0]=>array(3) < ["cito"]=>string(1) "N" ["own_bmat"]=> string(2) "12" ["name"]=> string(22) "Кровь с ЭДТА" > > ["within"]=> array(1) < [0]=>array(5) < ["url"]=>string(7) "rnk-hcv" ["name"]=> string(164) "Вирус гепатита С (Hepatitis C Virus), количественное определение РНК (ультрачувствительный метод)" ["serv_cost"]=> string(4) "5650" ["opisanie"]=> string(0) "" ["catalog_code"]=> string(6) "030211" > > >

Биоматериал и доступные способы взятия:
Тип В офисе
Кровь с ЭДТА
Подготовка к исследованию:

Не менее 3 часов после последнего приема пищи. Можно пить воду без газа.

Метод исследования: ПЦР

Вирусный гепатит С (ВГС) — инфекционное заболевание с парентеральным механизмом передачи, возбудителем которого является РНК-содержащий вирус гепатита С. Инкубационный период — в среднем 6-8 недель. Заболевание характеризуется высокой частотой формирования хронических форм и последующим развитием цирроза печени и гепатоцеллюлярной карциномы.

Выявление РНК ВГС является подтверждением острого или хронического гепатита С. Тест используется для диагностики ВГС-инфекции на ранних сроках инфицирования, оптимален для тестирования донорской крови и оценки ответа на противовирусное лечение.

ПОКАЗАНИЯ К ИССЛЕДОВАНИЮ:

  • Диагностика скрытых (латентных) форм вирусных гепатитов В и С;
  • Оценка эффективности проводимой противовирусной терапии;
  • Раннее выявление острых вирусных гепатитов В и С у контактных лиц.

ИНТЕРПРЕТАЦИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ:

Референсные значения (вариант нормы):

Параметр Референсные значения Единицы измерения
РНК HCV (качественное ультрачувствительное исследование) Не обнаружено

Комментарий к РНК HCV: Аналитическая чувствительность исследования для определения РНК вируса гепатита С -10 МЕ/мл.

Выявление РНК вируса гепатита С - доказательство инфицированности ВГС.

Результаты лабораторных исследований при различных вариантах инфекции, вызванной ВГС*
Клиническая ситуацияanti-HCVРНК ВГС
  • Острый гепатит С
  • Хронический гепатит С (РНК ВГС персистирует в сыворотке более 6 месяцев)
++
  • Острый гепатит С
  • Ложноположительные и ложноотрицательные результаты исследования
  • Разрешение острого гепатита С
  • Пациенты с острым или хроническим гепатитом С, которым успешно была проведена терапия
+-
  • Ранняя стадия острого гепатита С
  • Хронический гепатит С
  • Ложноположительный результат на РНК ВГС (редко)
-+
  • Отсутствие инфицирования вирусом гепатита С
--

*Рекомендации по диагностике и лечению взрослых больных гепатитом С, 2013.

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, пользовательских данных (сведения о местоположении; тип и версия ОС; тип и версия Браузера; тип устройства и разрешение его экрана; источник откуда пришел на сайт пользователь; с какого сайта или по какой рекламе; язык ОС и Браузера; какие страницы открывает и на какие кнопки нажимает пользователь; ip-адрес) в целях функционирования сайта, проведения ретаргетинга и проведения статистических исследований и обзоров. Если вы не хотите, чтобы ваши данные обрабатывались, покиньте сайт.

Copyright ФБУН Центральный НИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 1998 - 2020


! Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, пользовательских данных (сведения о местоположении; тип и версия ОС; тип и версия Браузера; тип устройства и разрешение его экрана; источник откуда пришел на сайт пользователь; с какого сайта или по какой рекламе; язык ОС и Браузера; какие страницы открывает и на какие кнопки нажимает пользователь; ip-адрес) в целях функционирования сайта, проведения ретаргетинга и проведения статистических исследований и обзоров. Если вы не хотите, чтобы ваши данные обрабатывались, покиньте сайт.

Стоимость услуги: 685 руб.* Заказать
Срок исполнения: 1 - 3 к.д. Заказать Указанный срок не включает день взятия биоматериала

Не менее 3 часов после последнего приема пищи. Можно пить воду без газа.

Метод исследования: ПЦР

При одновременном заказе услуги 030202 с количественным и генотипирующим исследованием, в случае положительного результата, срок исполнения может быть увеличен до получения окончательного результата.

Вирусный гепатит С (ВГС) — инфекционное заболевание с парентеральным механизмом передачи, возбудителем которого является РНК-содержащий вирус гепатита С. Инкубационный период — в среднем 6-8 недель. Заболевание характеризуется высокой частотой формирования хронических форм и последующим развитием цирроза печени и гепатоцеллюлярной карциномы.

Выявление РНК ВГС является подтверждением острого или хронического гепатита С. Определяется в крови со 2-й недели инфицирования, появляется раньше anti-HCV, что позволяет диагностировать заболевание на ранних сроках. Определение РНК проводится у лиц с клиникой острого гепатита и лиц с положительными результатами определения anti-HCV.

ПОКАЗАНИЯ К ИССЛЕДОВАНИЮ:

  • • Пациенты с признаками ОГ;
  • Пациенты с положительным результатом обнаружения anti-HСV IgG;
  • Пациенты с иммунодефицитом, имеющие заболевание печени неясной этиологии;
  • Больные ХГС во время и после противовирусного лечения;
  • Доноры.

ИНТЕРПРЕТАЦИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ:

Референсные значения (вариант нормы):

Параметр Референсные значения Единицы измерения
РНК Вируса гепатита С (качественное исследование) Не обнаружено

Аналитическая чувствительность теста: 100 МЕ/мл РНК вируса гепатита С.

Выявление РНК вируса гепатита С - доказательство инфицированности ВГС.

Результаты лабораторных исследований при различных вариантах инфекции, вызванной ВГС*
Клиническая ситуацияanti-HCVРНК ВГС
  • Острый гепатит С
  • Хронический гепатит С (РНК ВГС персистирует в сыворотке более 6 месяцев)
++
  • Острый гепатит С
  • Ложноположительные и ложноотрицательные результаты исследования
  • Разрешение острого гепатита С
  • Пациенты с острым или хроническим гепатитом С, которым успешно была проведена терапия
+-
  • Ранняя стадия острого гепатита С
  • Хронический гепатит С
  • Ложноположительный результат на РНК ВГС (редко)
-+
  • Отсутствие инфицирования вирусом гепатита С
--

*Рекомендации по диагностике и лечению взрослых больных гепатитом С, 2013.

" ["serv_cost"]=> string(3) "685" ["cito_price"]=> NULL ["parent"]=> string(2) "25" [10]=> string(1) "1" ["limit"]=> NULL ["bmats"]=> array(1) < [0]=>array(3) < ["cito"]=>string(1) "N" ["own_bmat"]=> string(2) "12" ["name"]=> string(22) "Кровь с ЭДТА" > > >

Биоматериал и доступные способы взятия:
Тип В офисе
Кровь с ЭДТА
Подготовка к исследованию:

Не менее 3 часов после последнего приема пищи. Можно пить воду без газа.

Метод исследования: ПЦР

При одновременном заказе услуги 030202 с количественным и генотипирующим исследованием, в случае положительного результата, срок исполнения может быть увеличен до получения окончательного результата.

Вирусный гепатит С (ВГС) — инфекционное заболевание с парентеральным механизмом передачи, возбудителем которого является РНК-содержащий вирус гепатита С. Инкубационный период — в среднем 6-8 недель. Заболевание характеризуется высокой частотой формирования хронических форм и последующим развитием цирроза печени и гепатоцеллюлярной карциномы.

Выявление РНК ВГС является подтверждением острого или хронического гепатита С. Определяется в крови со 2-й недели инфицирования, появляется раньше anti-HCV, что позволяет диагностировать заболевание на ранних сроках. Определение РНК проводится у лиц с клиникой острого гепатита и лиц с положительными результатами определения anti-HCV.

ПОКАЗАНИЯ К ИССЛЕДОВАНИЮ:

  • • Пациенты с признаками ОГ;
  • Пациенты с положительным результатом обнаружения anti-HСV IgG;
  • Пациенты с иммунодефицитом, имеющие заболевание печени неясной этиологии;
  • Больные ХГС во время и после противовирусного лечения;
  • Доноры.

ИНТЕРПРЕТАЦИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ:

Референсные значения (вариант нормы):

Параметр Референсные значения Единицы измерения
РНК Вируса гепатита С (качественное исследование) Не обнаружено

Аналитическая чувствительность теста: 100 МЕ/мл РНК вируса гепатита С.

Выявление РНК вируса гепатита С - доказательство инфицированности ВГС.

Результаты лабораторных исследований при различных вариантах инфекции, вызванной ВГС*
Клиническая ситуацияanti-HCVРНК ВГС
  • Острый гепатит С
  • Хронический гепатит С (РНК ВГС персистирует в сыворотке более 6 месяцев)
++
  • Острый гепатит С
  • Ложноположительные и ложноотрицательные результаты исследования
  • Разрешение острого гепатита С
  • Пациенты с острым или хроническим гепатитом С, которым успешно была проведена терапия
+-
  • Ранняя стадия острого гепатита С
  • Хронический гепатит С
  • Ложноположительный результат на РНК ВГС (редко)
-+
  • Отсутствие инфицирования вирусом гепатита С
--

*Рекомендации по диагностике и лечению взрослых больных гепатитом С, 2013.

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, пользовательских данных (сведения о местоположении; тип и версия ОС; тип и версия Браузера; тип устройства и разрешение его экрана; источник откуда пришел на сайт пользователь; с какого сайта или по какой рекламе; язык ОС и Браузера; какие страницы открывает и на какие кнопки нажимает пользователь; ip-адрес) в целях функционирования сайта, проведения ретаргетинга и проведения статистических исследований и обзоров. Если вы не хотите, чтобы ваши данные обрабатывались, покиньте сайт.

Copyright ФБУН Центральный НИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 1998 - 2020


! Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, пользовательских данных (сведения о местоположении; тип и версия ОС; тип и версия Браузера; тип устройства и разрешение его экрана; источник откуда пришел на сайт пользователь; с какого сайта или по какой рекламе; язык ОС и Браузера; какие страницы открывает и на какие кнопки нажимает пользователь; ip-адрес) в целях функционирования сайта, проведения ретаргетинга и проведения статистических исследований и обзоров. Если вы не хотите, чтобы ваши данные обрабатывались, покиньте сайт.








480 руб. | 150 грн. | 7,5 долл. ', MOUSEOFF, FGCOLOR, '#FFFFCC',BGCOLOR, '#393939');" onMouseOut="return nd();"> Диссертация, - 480 руб., доставка 1-3 часа, с 10-19 (Московское время), кроме воскресенья

Автореферат - бесплатно , доставка 10 минут , круглосуточно, без выходных и праздников

Ведерников, Виталий Евгеньевич. Количественное определение вируса гепатита C методом ПЦР в реальном времени и его генотипирование с использованием флуорогенных бинарных зондов : диссертация . кандидата биологических наук : 03.01.06 / Ведерников Виталий Евгеньевич; [Место защиты: Гос. науч. центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"].- Новосибирск, 2011.- 224 с.: ил. РГБ ОД, 61 11-3/892

Введение к работе

Актуальность исследования

Несмотря на значительные усилия, предпринимаемые в течение многих лет службами здравоохранения большинства государств по предотвращению распространения гепатита С (ГС), эта инфекция и в настоящее время является актуальной мировой проблемой. По данным экспертов на земном шаре насчитывается более 500 млн. человек, инфицированных вирусом гепатита С (ВГС), в Российской Федерации их число приближается к 5 млн.

Ситуацию в значительной мере осложняет отсутствие вакцины против ГС и высокая частота протекания инфекции в скрытой бессимптомной форме. Поэтому актуальными задачами для здравоохранения всех стран являются: профилактические меры по снижению риска заражения ВГС, повышение эффективности выявления инфицированных лиц и проведение действенной противовирусной терапии. Для диагностики гепатита С в настоящее время применяется комплекс методов, включающих определение в сыворотке крови обследуемых людей антител к вирусным антигенам с помощью иммуноферментного анализа (ИФА) и иммуноблота, а также обнаружение вирусной РНК ВГС с использованием технологий амплификационного тестирования нуклеиновых кислот (NAT).

NAT-тесты актуальны в трансфузиологии, так как позволяют выявлять РНК ВГС в ИФА-отрицательных пробах крови, полученных в период сероконверсионного окна (Жибурт и др., 2006). В современные алгоритмы первичного обследования и проведения противовирусной терапии NAT-тесты включены для выявления, количественного определения и генотипирования ВГС (в зависимости от генотипа ВГС назначают дозы препаратов и продолжительность лечения).

Российские медицинские учреждения в настоящее время не располагают достаточным ассортиментом диагностических наборов отечественного производства с требуемыми аналитическими характеристиками и актуальными для лабораторной диагностики потребительскими качествами. Представленные на отечественном рынке импортные диагностические тесты ведущих мировых производителей ограниченно доступны вследствие высокой стоимости. Поэтому для существенного улучшения ситуации с NAT-тестированием ВГС в России актуальна разработка и внедрение новых отечественных диагностических наборов.

Целью настоящего исследования является разработка, валидация и апробация наборов реагентов для количественного определения и дифференциации генотипов 1, 2, 3 вируса гепатита С на основе ПЦР в реальном времени.

Для достижения указанной цели были поставлены следующие задачи:

подобрать специфические праймеры и зонды для выявления РНК ВГС; выполнить оптимизацию условий проведения ОТ-ПЦР в режиме реального времени; совместить этапы обратной транскрипции и ПЦР;

провести оптимизацию методики проведения количественного анализа путем разработки алгоритмов обработки исходных флуоресцентных данных.

разработать композицию праймеров и генотип-специфичных флуорогенных зондов, обеспечивающую максимальную специфичность и позволяющую в одной пробирке одновременно выявлять генотипы 1, 2 и 3 ВГС; провести оптимизацию условий проведения ОТ-ПЦР в режиме реального времени;

на основе проведенных исследований разработать диагностические наборы для выявления РНК и генотипирования ВГС; определить их основные аналитические и диагностические характеристики; провести апробацию.

Научная новизна

В рамках разработки процедуры проведения количественного анализа предложен алгоритм устранения разрывов/выбросов в графиках флуоресцентных кривых с последующей обработкой фильтром высокочастотного шума. Такой алгоритм позволяет значительно повысить точность анализа при наличии в флуоресцентных кривых скачков и разрывов.

Предложен оригинальный алгоритм введения поправки на внутренний контрольный образец (ВКО) для учета потерь НК в процессе про-боподготовки, суть которой заключается в смещении значения Cq ВГС на Д Cq ВКО относительно среднего Cq ВКО по всей постановке.

При достигнутой воспроизводимости анализа (SD Количественное определение вируса гепатита C методом ПЦР в реальном времени и его генотипирование с использованием флуорогенных бинарных зондов

Читайте также:

Пожалуйста, не занимайтесь самолечением!
При симпотмах заболевания - обратитесь к врачу.

Copyright © Иммунитет и инфекции