Сколько делается анализ кала на вирусы

Многие вирусы могут очень долго присутствовать в организме и циркулировать в крови, до поры до времени не вызывая никаких неприятностей. Однако это вовсе не значит, что они безопасны. Лабораторные анализы на вирусы позволяют выявить наличие последних, даже если никаких симптомов нет.

Анализы на вирусы: какие инфекции они выявляют

Для выявления вирусов лаборатории проводят исследования крови несколькими методами. Наибольшее распространение на сегодня получили ПЦР и иммуноферментный (ИФА) анализы.

Иммуноферментный анализ крови определяет наличие антител к вирусам (или антигенов к ним) в крови — иммуноглобулины (lgA, lgG, lgM) вырабатываются при заражении вирусами и являются своеобразными маркёрами инфекции.

Анализ на ДНК вируса, или ПЦР-исследование, позволяет выявить тип инфицирующего агента.

В качестве биоматериала для исследования обычно берут кровь. Анализ крови может подтвердить гепатит, герпес и вирус Эпштейна-Барра, аденовирус, различные половые инфекции (в том числе и сифилис), вирус иммунодефицита человека (ВИЧ) и другие инфекции. Однако кровь не единственный биоматериал, пригодный для выявления вирусных поражений. В зависимости от заболевания и симптомов, для анализа на вирусы сдают соскоб слизистой оболочки, кал, мочу, мазок, слюну.

Как мы уже отмечали, исследование крови на вирусы можно проводить двумя разными способами. Расскажем о них подробнее.

Иммуноферментный метод анализа на вирусы позволяет установить форму болезни, вызванной вирусом (хроническая, острая или бессимптомная), а также оценить эффективность противовирусной терапии. Это один из самых распространенных и точных методов для выявления половых инфекций, в частности ВИЧ и ВПЧ, гепатита В.

Для анализа на вирусы чаще всего сдается кровь. Обязательно предупредите врача, если вы недавно проводили вакцинацию, — этот факт может отразиться на точности анализов. Рекомендуется не принимать пищу на протяжении 8-ми часов перед забором биоматериала, а также воздержаться от употребления алкоголя и от курения.

Время ожидания результатов зависит от типа вируса, на который проводится анализ, и от методики работы лаборатории. Обычно результаты готовы через 1–3 дня, но иногда приходится ждать и 2 недели.

Рассказать о том, каким образом следует трактовать результаты анализов на все виды вирусов, в рамках одной статьи невозможно. Далее мы поговорим лишь о наиболее известных заболеваниях и о часто назначаемых исследованиях.

В случае проведения анализа методом ИФА наличие IgG в крови на гепатит говорит о том, что этот вирус в организме присутствовал, но иммунная система выработала к нему антитела. Присутствие одновременно антител класса IgM и IgG говорит о заболевании в острой форме. Иммуноглобулины только класса IgM — признак первичного инфицирования.

При проведении исследования методом ПЦР определяется РНК вируса. Результаты могут быть приведены в следующем формате:

РНК вируса не выявлена.
РНК вируса выявлена в концентрации ниже предела количественного определения (менее15 МЕ/мл). Сомнительный результат.
РНК вируса гепатита С выявлена (от 15 и выше 100000000 МЕ/мл).

Для выявления этого вируса гепатита чаще всего назначается ИФА. Если в крови присутствуют антитела IgG и IgM, это значит, что вирус очень активен или же заражение произошло недавно.

В случае проведения ПЦР-анализа определяется концентрация фрагментов ДНК вируса гепатита В. Пациент получает результат с одной из приведенных трактовок:

Не обнаружено.
Сомнительный результат (результат положительный с концентрацией ДНК вируса гепатита В на границе точности метода).
Обнаружено.

Если говорить о трактовке ИФА, то наличие антител, обозначаемых как Anti-HSV-IgG, говорит не об иммунитете к вирусу, а о том, что вы уже были когда-то инфицированы. Этот маркёр наблюдается у большинства пациентов. Если показатель anti-HSV-IgG в пробах, взятых в динамике за 2-недельный период, заметно растет, это значит, что заражение произошло недавно. О рецидиве говорит высокий показатель IgG.

Расшифровка анализа крови на ВИЧ очень проста — если результат отрицательный, это значит, что вирус не обнаружен, если положительный — увы, вирус в крови есть. Но следует знать, что сегодня даже самые надежные методы точны лишь на 98–99%, то есть всегда остается шанс, что результат будет, например, ложноположительным.

При анализе на аденовирус, вызывающий респираторные заболевания, применяется в основном ИФА. В ходе анализа подсчитываются IgG-антитела. Если показатель менее 0,8 условных единиц — результат отрицательный, более 0,8 — положительный.

Не пренебрегайте профилактическими анализами на вирусы. Раннее выявление инфекции позволяет отсрочить или подавить развитие заболевания. В случае же беременности сдача биоматериала на анализ с целью выявления вирусных инфекций является обязательной процедурой. Поводом для прохождения исследования также может стать повышенный уровень лейкоцитов в крови, сдвиг лейкоцитарной формулы, увеличение количества нейтрофилов (палочкоядерных), миелоцитов и метамиелоцитов, снижение числа лимфоцитов при высокой СОЭ в результатах клинического анализа крови.

ВРЕМЯ ПРИЕМА АНАЛИЗОВ (понедельник – пятница)

Анализы принимаются с понедельника по пятницу
с 8:00 до 12:00 и с 13:00 до 16:00

ПРАВИЛА СБОРА МАТЕРИАЛА ДЛЯ АНАЛИЗА

Кровь на иммунограмму, биохимию, общий анализ сдается натощак,

кровь на ИФА и НРИФ можно сдавать через 2-3 часа после еды.

Общий анализ мочи, анализ мочи по Нечипоренко

Моча собирается в чистую сухую посуду после тщательного туалета наружных половых органов. Для общего анализа мочи лучше использовать первую утреннюю порцию мочи, выделенную после сна, в количестве 100 мл. Для анализа мочи по Нечипоренко – среднюю порцию утренней мочи в количестве 10 мл. Прием анализа: пн.-пт. 8:00-12:00; в кабинете 123

Соскоб на энтеробиоз

Необходимо заранее взять в лаборатории (кабинет 102) предметное стекло с наклеенной липкой лентой, внимательно выслушать инструкции лаборанта по забору анализа, дома (следуя инструкции) наклеить липкую ленту на перианальную область, снять, наклеить на предметное стекло, не порвав ее.

Прием анализа: пн.-пт. 8:00-12:00; 13:00-15:30, в кабинете 123

Анализ кала на яйца глистов, цисты лямблий, антиген лямблий

Собрать кал в чистую сухую посуду. Если собран вечерний кал, то до доставки в лабораторию поместить образец в холодильник. Анализ готовится 2 рабочих дня

Прием анализа: пн.–пт. 8:00-12:00; 13:00-15:30 (14:00 на антиген лямблий), в кабинете 123

До сдачи анализа исключают из пищи в течение 3-4 дней мясо, рыбу, все виды зеленых овощей, а также помидоры и яйца. Сдают на анализ утренний кал в чистой сухой посуде.

Прием анализа: пн.–пт. 8:00-12:00; 13:00-15:30, в кабинете 123

Для сдачи анализов на бактериологическое исследование необходимо заранее произвести предоплату (пн-пт 8:00 – 17:00) .

Бактериологическое исследование кала
(на дисбактериоз, на кишечную группу бактерий)

Желательно собрать утренний кал в специальную стерильную посуду (если невозможно, вечерний кал хранить в холодильнике, доставить в лабораторию к 8.00): положить в специальную стерильную баночку стерильной лопаточкой примерно с половину чайной ложечки, с самой верхней части испражнений, не касаясь других предметов. Баночку закрыть и доставить в лабораторию в течение двух часов.

Прием анализа: пн.–пт. с 8:00 – 12:00; с13:00 -15:30 в кабинете 123

Анализ на дисбактериоз готовится 5 рабочих дней.

Бактериологическое исследование мочи

Моча собирается в специальную стерильную посуду после тщательного туалета наружных половых органов. При циститах берут первую порцию мочи в количестве 3-5 мл, при заболеваниях почек – среднюю порцию мочи в том же количестве. Доставить в лабораторию не позднее 2 часов после забора.

Прием анализа: пн.-пт. 8.00-12.00 в кабинете 123

Анализ готовится 4 рабочих дня

Бактериологическое исследование мокроты

Утреннюю мокроту, выделившуюся во время приступа кашля, собирают в стерильную баночку. Перед откашливанием пациент чистит зубы и полощет рот кипяченой водой с целью механического удаления остатков пищи, слущенного эпителия и микрофлоры ротовой полости. Забранная мокрота доставляется в лабораторию не позднее 1,5-2 часов после забора.

Прием анализа: пн.–пт. с 8.00 до 12.00 в кабинете 123.

Анализ готовится 4 рабочих дня.

Бактериологическое исследование грудного молока

Для сбора молока на анализ:

1. Тщательно вымыть руки с мылом;

2. Тщательно вымыть грудь с мылом и обтереть чистым проглаженным полотенцем;

3. Руки и соски молочных желез протереть тампоном, смоченным 40% спиртом или водкой;

4. Осторожно открыть стерильную баночку, крышку положить наружной стороной;

5. Первые капли грудного молока сцедить в полотенце, последующие – в стерильную баночку;

6. Плотно закрыть крышку, упаковать в пакет и доставить в лабораторию не позднее 1,5-2 часов после забора.

Прием анализа: пн.–пт. с 8:00 – 12:00 с 13:00 – 15:30 в кабинете 123

Подготовка к сдаче мазка из зева

Мазок из зева забирается до утреннего туалета полости рта (до чистки зубов и полоскания ротовой полости) и натощак или через 2 часа после еды

ПОДГОТОВКА К ДУОДЕНАЛЬНОМУ ЗОНДИРОВАНИЮ

3а 2-3 дня до исследования исключить из пищи картофель, бобовые, цельное молоко, черный хлеб, жареные блюда.

Накануне в течение дня выпить 1 литр негазированной минеральной воды, последний прием пищи – в 18-19 часов легкий ужин.

На дуоденальное зондирование необходимо подходить к 8.00 в кабинет 125

натощак (не есть, не пить, не курить).

При отсутствии противопоказаний желательно принять спазмолитики.

С собой иметь полотенце.

В случае невозможности явиться на дуоденальное зондирование в назначенный день, пожалуйста, сообщите по тел. 28-99-90 или 28-99-91 (пн.–пт. 8 – 17)

Слепое зондирование (тюбажи по Демьянову)

Утром натощак выпить 1 стакан минеральной воды комнатной температуры без газа, затем лечь на правый бок, приложить к области печени теплую грелку. Лежать 40-60 мин.

МЕТОДЫ СБОРА МАТЕРИАЛА ДЛЯ ПЦР-ИССЛЕДОВАНИЙ:

Осуществлять взятие клинического материала, строго следуя инструкции, только стерильными одноразовыми инструментами в стерильные одноразовые флаконы, пробирки, контейнеры. Работать в одноразовых перчатках.

при температуре 20-25˚С – в течение 6 часов с момента взятия;

при температуре 2-8˚С – не более 1 суток.

Недопустимо замораживание образцов цельной крови!

Следует забирать первую порцию утренней мочи в количестве 20-30 мл в специальный сухой стерильный контейнер на 60 мл.

при комнатной температуре – в течение 6 часов;

при температуре 2-8˚С – в течение 1 суток.

Допускается однократное замораживание-оттаивание материала

МАЗКИ ИЗ РОТОГЛОТКИ ДЛЯ ПЦР

Мазки берут сухими стерильными ватными тампонами на пластиковой основе вращательными движениями с поверхности миндалин, небных дужек и задней стенки ротоглотки. После взятия материала тампон помещают в стерильную одноразовую пробирку со специальной транспортной средой и аккуратно обламывают пластиковый стержень на расстоянии не более 0,5 см от рабочей части, оставляя рабочую часть зонда с материалом в транспортной среде. Пробирку плотно закрывают крышкой.

Условия хранения и перевозки материала:

при комнатной температуре – в течение 6 ч.;

при температуре от 2 до 8˚С – в течение 3 суток;

при температуре минус 20˚С – в течение 1 месяца;

при температуре минус 70˚С – длительно.

Допускается только однократное замораживание-оттаивание материала.

ФЕКАЛИИ ДЛЯ ПЦР

Фекалии следует забирать из предварительно продезинфицированного горшка или подкладного судна. Небольшое количество забирать из нескольких мест одноразовой лопаточкой прикрепленной к крышке стерильного контейнера, в который забирают материал.

при комнатной температуре – в течение 6 часов;

при температуре 2-8˚С – в течение 3 суток;

при необходимости хранения более 3 суток – при температуре не выше -16˚С.

СОСКОБЫ (МАЗКИ) СЛИЗИСТЫХ ОБОЛОЧЕК УРОГЕНИТАЛЬНОГО ТРАКТА ДЛЯ ПЦР

Забор материала осуществляют с помощью специальных стерильных одноразовых инструментов – урогенитальных зондов, цитощеток.

1. Для получения соскоба эпителия из цервикального канала удалить слизь с поверхности шейки матки стерильным тампоном, ввести рабочую часть цитощетки в цервикальный канал и сделать два полных оборота по часовой и против часовой стрелки. Извлечь зонд, избегая касания стенок влагалища, и поместить его в пробирку с транспортной средой. Рабочую часть цитощетки обломить в области насечки и оставить в пробирке.

2. Для получения вагинального отделяемого провести по поверхности эпителия заднее-нижнего свода влагалища, вращая зонд и перенести зонд в пробирку с транспортной средой. Рабочую часть зонда обломить в области насечки и оставить в пробирке. Пробирку плотно закрыть крышкой.

3. Перед взятием соскоба из уретры необходимо обработать наружное отверстие уретры тампоном, смоченным стерильным физиологическим раствором. Ввести рабочую часть зонда в уретру, несколькими вращательными движениями собрать отделяемое и перенести зонд в пробирку с транспортной средой. Рабочую часть зонда обломить и оставить в пробирке.

Для скринингового исследования материал из разных локализаций можно помещать в одну пробирку с транспортной средой. Для диагностики воспалительных заболеваний материал с каждой локализации следует забирать в отдельную пробирку.

при комнатной температуре в течение 48 часов;

Стоимость услуги:

1080 руб.* Заказать

Срок исполнения: 1 - 3 к.д. Заказать Указанный срок не включает день взятия биоматериала

Для получения достоверных результатов, анализы на выявление возбудителей бактериальных инфекций должны проводиться не менее чем через 2 недели после последнего приема антибактериальных препаратов

Кал собирается в одноразовую стеклянную или пластиковую посуду (контейнер можно получить в регистратуре CMD), в объеме, равном 1/2 чайной ложки из средней части фекальной массы.

Нельзя собирать кал из памперсов, после клизмы, после введения ректальных свечей или приема медикаментов, влияющих на перестальтику кишечника, с примесями мочи или выделений из половых органов.

Доставка в лабораторию в день взятия материала.

Метод исследования: ПЦР

Исследование позволяет максимально эффективно расшифровать причину острых кишечных инфекций. Соотношение частоты выявления вирусных и бактериальных патогенов при острых кишечных инфекциях варьирует в разных возрастах: у детей до 3-х лет на долю вирусных агентов приходится 80-90% заболеваний, на долю бактериальных – 10-20%, среди взрослых пациентов доля вирусных возбудителей снижается до 30%. Ротавирусы являются наиболее широко распространенной причиной диарейных заболеваний у детей в возрасте до 5 лет. С норовирусами ассоциирована каждая вторая вспышка острой кишечной инфекции и 90% вспышек вирусной этиологии. Астровирусная инфекция по распространенности составляет 4% случаев госпитализации с ОКИ, не обладает клиническими особенностями, позволяющими дифференцировать ее от других кишечных инфекций. Энтеровирусная инфекция широко распространена во всех регионах мира, у человека может протекать бессимптомно или сопровождаться различными клиническими проявлениями: от легкого недомогания или диарейного синдрома до развития тяжелых заболеваний (серозный менингит, паралич, миокардит, сепсис новорожденных).

Информативность выявления РНК вирусов в диагностике кишечных инфекций остается высокой даже позже 72 часов от начала заболевания, когда концентрация вирусов в фекалиях значительно снижается.

ПОКАЗАНИЯ К ИССЛЕДОВАНИЮ:

Обследование детей и взрослых с диарейным синдромом
Обследование лиц в очагах групповой заболеваемости

ИНТЕРПРЕТАЦИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ:

Референсные значения (вариант нормы):

Параметр	Референсные значения
РНК Rotavirus	Не обнаружено
РНК Astrovirus	Не обнаружено
РНК Norovirus	Не обнаружено
РНК Enterovirus	Не обнаружено

Выявление РНК вирусов свидетельствует об инфицировании.

" ["serv_cost"]=> string(4) "1080" ["cito_price"]=> NULL ["parent"]=> string(2) "25" [10]=> string(1) "1" ["limit"]=> NULL ["bmats"]=> array(1) < [0]=>array(3) < ["cito"]=>string(1) "N" ["own_bmat"]=> string(2) "12" ["name"]=> string(6) "Кал" > > >

Биоматериал и доступные способы взятия:

Тип	В офисе
Кал

Подготовка к исследованию:

Доставка в лабораторию в день взятия материала.

Метод исследования: ПЦР

ПОКАЗАНИЯ К ИССЛЕДОВАНИЮ:

Обследование детей и взрослых с диарейным синдромом
Обследование лиц в очагах групповой заболеваемости

ИНТЕРПРЕТАЦИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ:

Референсные значения (вариант нормы):

Параметр	Референсные значения
РНК Rotavirus	Не обнаружено
РНК Astrovirus	Не обнаружено
РНК Norovirus	Не обнаружено
РНК Enterovirus	Не обнаружено

Выявление РНК вирусов свидетельствует об инфицировании.

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, пользовательских данных (сведения о местоположении; тип и версия ОС; тип и версия Браузера; тип устройства и разрешение его экрана; источник откуда пришел на сайт пользователь; с какого сайта или по какой рекламе; язык ОС и Браузера; какие страницы открывает и на какие кнопки нажимает пользователь; ip-адрес) в целях функционирования сайта, проведения ретаргетинга и проведения статистических исследований и обзоров. Если вы не хотите, чтобы ваши данные обрабатывались, покиньте сайт.

! Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, пользовательских данных (сведения о местоположении; тип и версия ОС; тип и версия Браузера; тип устройства и разрешение его экрана; источник откуда пришел на сайт пользователь; с какого сайта или по какой рекламе; язык ОС и Браузера; какие страницы открывает и на какие кнопки нажимает пользователь; ip-адрес) в целях функционирования сайта, проведения ретаргетинга и проведения статистических исследований и обзоров. Если вы не хотите, чтобы ваши данные обрабатывались, покиньте сайт.

Комплексное молекулярно-генетическое исследование, которое позволяет выявить генетический материал наиболее вероятных возбудителей острых кишечных инфекций в кале и установить этиологию заболевания.

Синонимы английские

Acute intestinal infection screening; Bacterial and viral diarrhea screening, PCR, fecal samples.

Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Как правильно подготовиться к исследованию?

Исследование рекомендуется проводить до начала приема антибиотиков и других антибактериальных химиотерапевтических препаратов.
Исключить прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел, ограничить прием медикаментов, влияющих на перистальтику кишечника (белладонна, пилокарпин и др.) и на окраску кала (железо, висмут, сернокислый барий), в течение 72 часов до сбора кала.

Общая информация об исследовании

Острые кишечные инфекции (ОКИ) – группа заболеваний, обусловленных вирусами, бактериями или паразитами, для которых характерен фекально-оральный механизм передачи. Общими для данных инфекций являются факторы передачи: пищевые продукты, вода, инфицированные бытовые предметы и грязные руки. Первые симптомы возникают через несколько часов или дней после инфицирования, начало резкое, с появлением частого жидкого стула, рвоты, боли в животе, признаков интоксикации (лихорадки, озноба, тошноты). Заболевание может носить групповой характер и проявиться у нескольких человек, употреблявших инфицированную пищу или воду.

Согласно официальной статистике, в России до 65-67% заболеваний этой группы составляют ОКИ неуточненной этиологии. Если возбудитель инфекции неизвестен, эффективность противоэпидемических мероприятий ограничивается. Соотношение частоты выявления вирусных и бактериальных патогенов варьируется в разных возрастах: у детей до 3 лет на долю вирусных агентов приходится 80-90% заболеваний, на долю бактериальных – 10-20%; среди взрослых пациентов доля вирусных возбудителей снижается до 30%.

Shigella species и Esherichia coli – грамотрицательные палочковидные микроорганизмы из семейства энтеробактерий. К роду Shigella относятся патогенные бактерии S. dysenteriae, S. flexneri, S. boydii и S. sonnei, которые являются возбудителями шигеллеза (бактериальной дизентерии). Энтероинвазивные E. coli (EIEC) очень близки с шигеллами, синтезируют и выделяют шигеллоподобный токсин, способны проникать в клетки слизистой кишечника и разрушать энтероциты, что приводит к образованию язвенных дефектов в слизистой кишечника. За значительную часть случаев "бактериологически неподтвержденной дизентерии", особенно у детей, ответственен энтероинвазивный эшерихиоз.

Бактерии рода Salmonella относятся к семейству энтеробактерий. S. typhi и S. parathyphi являются возбудителями брюшного тифа и паратифа. Существует множество серовариантов Salmonella species, способных вызвать у человека инфекцию по типу гастроэнтероколита, а также стать причиной внутрибольничных инфекций. Сальмонеллез может протекать в форме острой кишечной инфекции, тяжелой генерализированной инфекции или бессимптомного носительства. Окончательный диагноз ставится только после выделения возбудителя или обнаружения его ДНК.

Кампилобактерии являются одними из наиболее сложных для культивирования (которое требуется в ходе анализа) микроорганизмов. Это объясняется их микроаэрофильностью и возможностью подавления их роста сопутствующей флорой. Род кампилобактерий объединяет как возбудителей ОКИ (термофильные виды), так и сапрофитные и условно-патогенные виды, о чем необходимо помнить при выявлении этих микроорганизмов в клиническом материале. Применение наборов на основе ПЦР для определения термофильной группы кампилобактерий позволяет не только избежать трудоемкой и высокозатратной бактериологической работы, но и четко ограничить детекцию тех видов кампилобактерий, которые имеют этиологическую связь с острой кишечной инфекцией (С. jejuni, C. coli, C. lari, C. upsaliensis).

В соответствии с данными зарубежной литературы, норовирус – наиболее частый возбудитель вспышек ОКИ небактериальной этиологии. Эта особенность связана с низкой инфицирующей дозой и высокой устойчивостью в окружающей среде. ПЦР является "золотым стандартом" в клинической диагностике норовирусных инфекций.

Несмотря на несколько меньшую в сравнении с рота- и норовирусами распространенность, астровирусы составляют значительный пласт кишечных инфекций, у трети пациентов протекающий с явлениями колита. Ротавирусы группы А являются наиболее частой причиной спорадических заболеваний ОКИ у детей, а ДНК-содержащий аденовирус F (серотипы 40 и 41) нередко вызывает вспышки гастроэнтеритов у детей младшего возраста.

Для выявления и дифференциальной диагностики кишечных инфекций используются культуральные и молекулярно-генетические методы исследования генетического материала возбудителя в кале и определение концентрации специфических иммуноглобулинов в крови. ПЦР обладает преимуществом перед культуральными методами благодаря быстрому получению результатов, высокой специфичности и чувствительности исследования. Данный анализ позволяет со 100-процентной точностью определить возбудителя кишечного заболевания, а быстрая диагностика острых кишечных инфекций помогает избежать лишних процедур и оперативных вмешательств, своевременно начать лечение и ограничить очаг распространения инфекции.

Для чего используется исследование?

Для установления этиологического фактора острой кишечной инфекции;
для дифференциальной диагностики причин острого гастроэнтероколита (воспаления ЖКТ).

Когда назначается исследование?

При симптомах острого гастроэнтерита, вероятно, инфекционной этиологии (жидкий частый стул, рвота, лихорадка, боли в животе);
при одновременном или последовательном развитии ОКИ у нескольких членов семьи, у детей в детском учреждении или пациентов в стационаре;
при подозрении на развитие внутрибольничной кишечной инфекции (при обострении симптомов энтероколита у пациента, находящегося на лечении по поводу ОКИ).

Что означают результаты?

Референсные значения: отрицательно.

Причины положительного результата:

присутствие ДНК или РНК возбудителя ОКИ; этиология в зависимости от выявленного вида возбудителя (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus (2-й генотип), Astrovirus).

Причины отрицательного результата:

отсутствие инфицирования Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus (2-й генотип), Astrovirus.

Рекомендуется проводить исследование в первые 3 суток с начала заболевания, у госпитализированных пациентов – в первый день госпитализации.
Важно помнить, что острый энтероколит может быть обусловлен и другими инфекциями (например, амебами, лямблиями, иерсиниями, клостридиями, протеями и др.) или неинфекционными причинами (токсинами, ядовитыми веществами, острой непроходимостью кишечника, тромбозом сосудов брыжейки, воспалительными заболеваниями кишечника, острым панкреатитом, аппендицитом, целиакией, острым гепатитом, мальабсорбцией, дивертикулитом).

Кто назначает исследование?

Инфекционист, гастроэнтеролог, терапевт, педиатр.

Литература

Борисов Л. Б. Медицинская микробиология, вирусология, иммунология. М.: МИА, 2005. – 736 с.
Gómez-Duarte O., Bai J., Newel E. Detection of E. coli, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Vibrio cholerae, and Campylobacter spp. enteropathogens by Three-reaction Multiplex PCR. Diagn Microbiol Infect Dis. 2009 January; 63(1): 1-9. PMCID: PMC2701628.

Согласно руководству ВОЗ, анализы на вирус SARS-CoV-2 должны проводиться:

Методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с обратной транскрипцией. Это самый точный и надежный метод диагностики вирусной инфекции, который позволяет обнаружить даже очень небольшое количество генетического материала (РНК) вируса в биологическом материале человека. Предпочтительно брать мазок из ротоглотки или носоглотки, потому что в кале и крови вирусов меньше.
В лаборатории с уровнем биологической безопасности 2 (BSL-2). Всего существует четыре уровня безопасности. На первом уровне требования минимальные, на четвертом — самые строгие. В лабораториях с уровнем безопасности BSL-2 исследуют микробов, представляющих умеренную опасность для сотрудников лаборатории и для окружающей среды.

ПЦР-анализ с обратной транскрипцией на SARS-CoV-2 можно провести только в лабораторных условиях, потому что для него требуется набор реактивов и лабораторное оборудование. Для этого нужны:

микроцентрифуга,
мешалка,
детекторный модуль ПЦР в реальном времени с реакционным модулем амплификатора.

На дому такой тест сделать нельзя, поэтому экспресс-тестов на основе ПЦР не существует.

Но даже если в конце концов экспресс-тесты на основе ИФА и появятся, они будут уступать лабораторной ПЦР и в точности, и в скорости определения заражения вирусом. ИФА-тест обнаруживает не генетический материал вируса, а антитела — иммунные белки, которые организм вырабатывает к вирусу. Чтобы организм успел выработать антитела, с момента заражения должно пройти около недели. Если сделать ИФА-тест раньше, он не покажет заражения, даже если в организме у человека уже есть вирус SARS-CoV-2.

Где делают тест. В Европе, Великобритании и Австралии тесты делают в любой лаборатории с уровнем безопасности BSL-2, в которой есть оборудование для ПЦР-реакции с обратной транскрипцией и реактивы, которые необходимы для поиска РНК вируса SARS-CoV-2. В США тесты делают в лабораториях Центра по контролю и профилактике инфекционных заболеваний (CDC) и в государственных лабораториях общественного здравоохранения. Тест проводится в соответствии с протоколом, принятым в конкретной стране.

Принцип действия теста. В США и других странах для анализа берут мазок с задней стенки глотки, образец слюны или жидкости из нижних дыхательных путей (то есть мокроты). Затем образец доставляют в лабораторию и выделяют из него рибонуклеиновую кислоту (РНК), содержащую геном вируса. Затем к смеси реагентов добавляют фермент, который превращает РНК в ДНК — это и есть обратная транскрипция. После этого вирусную ДНК копируют миллионы раз и ищут в ней участок, соответствующий геному SARS-CoV-2. Если такой участок есть, анализ признают положительным.

Точность. Тест способен обнаружить 0,3–3 копии вирусной РНК в микролитре (0,001 мл).

Сроки. 24–48 часов.

Сколько сделано анализов. По данным CDC, на 16 марта 2020 года в США на SARS CoV-2 было проверено: в лабораториях CDC — 4 тыс. 255 анализов; в 48 государственных лабораториях — 20 тыс. 907 анализов. Анализы начали делать 18 января 2020 года.

Цена. Тестирование оплачивает государство. Сдать анализ на SARS-CoV-2 в частной лаборатории за деньги нельзя.

Это соответствует уровню безопасности BSL-3. Пример микроба, с которым обычно работают в лаборатории BSL-3 — Mycobacterium tuberculosis, то есть бактерии, вызывающие туберкулез. Получается, что в нашей стране для работы с коронавирусом лаборатории нужен почти что самый высокий уровень биологической безопасности из возможных — BSL-3. Это притом что большинство российских лабораторий, как и везде в мире, имеет уровень безопасности BSL-2. (Дополнение от 17.03.2020, 18:27 мск: в этот фрагмент внесены изменения, уточнена информация об уровнях безопасности лабораторий.)

Принцип действия теста. Как и за рубежом, анализ проводят методом ПЦР-реакции с обратной транскрипцией.

реагент-1, прозрачная бесцветная жидкость, 0,70 мл, 1 пробирка;
реагент-2, прозрачная бесцветная жидкость, 1,20 мл, 1 пробирка;
положительный контроль (ПКО), прозрачная бесцветная жидкость, 0,20 мл, 1 пробирка;
отрицательный контроль (ОКО), прозрачная бесцветная жидкость, 0,20 мл, 1 пробирка;
эксплуатационная документация: инструкция по применению и паспорт.

Данные по составу реагентов не опубликованы.

Точность. ТАСС сообщает, что тест позволяет обнаружить 50–500 вирусных частиц в образце.

Цена. Тестирование оплачивает государство. Сдать анализ на SARS-CoV-2 в частной лаборатории за деньги нельзя.

Читайте также: