На лукоморье есть вирусы
![]() | Осторожно! Шок-контент! Ниже расположено зашкаливающее количество разлагающихся тел. Настоятельно рекомендуется отогнать от экрана беременных женщин и детей, а также особо впечатлительных животных. За последствия, вызванные чтением и просмотром, ответственности не несём! |
Инфекции (заразные заболевания) — легкое недомогание и лютая смерть, вызываемые мелкими тварями.
Содержание
[править] Лирическое отступление
- Прионы — это что-то между живым и неживым, но ближе к неживым. Определённая форма некоторых белков, но умеет размножаться — переводить правильный вариант белка в неправильный, который тоже начинает переводить правильный в неправильный, и так по цепной реакции. Вызывает коровье бешенство, болезнь Крейцфельдта-Якоба и ещё кое-какие заболевания.
- Вирусы — это что-то между живым и неживым, но ближе к живым. Белковая оболочка, содержащая ДНК или РНК, однако не имеющая собственных механизмов размножения, и поэтому использующая клетки хозяина как фабрику воспроизводства.
- Вироиды — опять же среднее между живым и неживым, РНК с отсутствием белковой оболочки и меньшим числом нуклеотидов в сравнении с вирусами. К сожалению, поражают только растения.
- Бактерии — одноклеточные создания. Среди них будем разделять:
- Бациллы (палочки);
- Кокки (шарики);
- Вибрионы (типа запятых);
- Спириллы (спирали);
- Спирохеты (сильно закрученные спирали);
- Простейшие — чуть более развитые одноклеточные, уже имеющие ядра, что не мешает им быть настолько мелкими, чтобы паразитировать внутри клеток хозяина;
- Грибочки;
- Гельминтов тоже не забудем. Хотя есть отдельная статья, но там не всё, далеко не всё…
Во-вторых. Мы не составляем терапевтический справочник, нас больше интересует красочное описание течения болезней, а не процент хлорамина, которым обрабатывают горшки в тифозном бараке. В полном соответствии с вывешенным шаблоном.
В-третьих. Боязнь инфекционных болезней — распространенная фобия, ею страдали Николае Чаушеску и Говард Хьюз, чего и вам желаем. Запасайтесь попкорном.
[править] Особо опасные инфекции
Инфекции, которые особо опасны для жизни и здоровья. Характеризуются:
- Высокой контагиозностью (способностью передаваться окружающим);
- Высокой заболеваемостью (т. е. легкостью подхватить заразу);
- Высокой вирулентностью (то есть очень быстрой скоростью распространения);
- Тяжелым течением и высокой летальностью.
Если по-простому: легко заразиться, легко заболеть, легко сдохнуть. И заодно прихватить с собой всех тех, кто не успел достаточно быстро и далеко съебаться. И так по кругу…
Очень давно известен метод борьбы с ней — прививки. Первые упоминания о попытках прививать оспу относятся к V—VI векам в Индии. Не будем повторять общие места про врача Дженнера, про императрицу Екатерину II, самоотверженно привившую себе оспу, и императора Петра II, помершего в 15 лет от оспы. Оспу перенес и следующий по номеру Пётр — Пётр III, но выжил, в отличие от его сестры Анны, умершей, опять же от оспы, в два года.
Вызывает удивление факт, что вид Homo sapiens вообще выжил в условиях высокой заразности и смертности от оспы. Число жертв оспы за историческое время оценивается в 4 миллиарда, что на порядок бьет результаты чумы (200—300 миллионов). Как-то помогало выживать наличие двух штаммов вируса: Variola major (смертность 20-40%, по некоторым данным — до 90%) и Variola minor (смертность 1-3%). Неудачники, заразившиеся первым, покрывались пузырями и струпьями и помирали пачками; счастливчики, заразившиеся вторым, также покрывались пузырями и струпьями, теряли зрение, но выживали.
Оспа не имела других резервуаров, кроме человека, что определило её кончину. Прививки не обеспечивали 100% защищённости, но снижали циркуляцию вируса в популяции прямоходящих обезьян, вплоть до полного прекращения. В XX веке развитые страны решили на своей территории проблему натуральной оспы.
В 60-70-х годах прошлого века развитые страны, к которым относился СССР, утомившись от завозной оспы, приняли решение — оспу нахуй. Однако, из благого дела устроили гешефт. Анально нагнув бывшие колонии, выбили из них денег, сами тоже вложились. С одной стороны — немало, в расчёте на страну. С другой стороны, вакцину умели делать США и СССР, то есть тупо сделали скидку нищебродам. Как бы то ни было, в середине 70-х ВОЗ рапортовала об искорении оспы как вида. Улыбаемся и машем.
А тем временем охуевшее от эйфории и безнаказанности человечество отменило обязательную вакцинацию.
Чума — хтоничный архетипичный пиздец или типичный архипиздец. Образ чумы прочно вошёл в культуру и стал нарицательным. Разделяют следующие формы: Бубонная. Относительно медленная, дает врачам время на диагноз и лечение. Возникает при укусе заражёнными блохами. Лимфатические узлы опухают, разрастаясь до размера голубиного яйца. В дальнейшем болезнь переходит в септическую форму, с почернением конечностей и пятнами по телу. И всё. Лечится. Лёгочная. Проникновение бацилл в лёгкие при бубонной форме приводит к пневмонии и откашливанию микробов. Зараза начинает распространяться воздушно-капельным путём, у инфицированных возникает пневмония. Без лечения смертность этой формы — 90-100%. Постановка верного диагноза осложнена тем, что отсутствуют выраженные специфические признаки, что приводит к врачебным ошибкам: больной кладётся в общую палату, с ожидаемым результатом. Может убить на вторые сутки, чрезвычайно заразна. Первично-септическая или молниеносная. Сразу после заражения наступает генерализированный сепсис. Смертность ровно 100%, даже в современных условиях, так как просто не успевают поставить диагноз и дать нужные таблетки. Только человек пожаловался на недомогание — и тут же умер. Показательна история возникновения природных очагов в США. До XX века там были степи и пустыни, где жили и размножались грызуны. Грызунов ели блохи. Но природных очагов не было, пока в 1904 году в порт Сан-Франциско не пришла лоханка из Токио. Санитарные врачи обнаружили в трюме толпы крыс и двух безбилетных няшных японцев, уже больных. Судно оттащили на карантин, но владельцы груза где-то надавили, с кем-то перетёрли… В результате — вспышка. Бацилла поселяется на популяции помойных крыс, и всё бы ничего, но через некоторое время переходит на диких. И пиздец. Теперь США — одна из неблагополучных стран по чуме, дающая в ежегодной статистике несколько десятков случаев. Имеются природные очаги чумы и в братских государствах СНГ. Сравнительно недавний случай заболевания бубонной чумой в Киргизии как бы намекает, что чума ожидает тебя, анонимус. История про чумную палочку трубочку Мокрота, выделенная больными чумой на предметы общего пользования, в определённых обстоятельствах становилась источником заражения людей с легочной формой чумы. Интересное наблюдение сделано доктором бароном Р. А. Будбергом в деревне Сан-Диадзе. Disclaimer: Я высказываю свое субъективное мнение на базе доступных данных. Мнение профессиональных вирусологов и эпидемиологов может отличаться от моего. В любой непонятной ситуации обращайтесь к материалам ВОЗ. Привет, коллеги. Чем больше роюсь в данных по вспышке коронавируса 2019-nCoV, тем меньше мне нравится происходящее, с учетом предыдущих вспышек аналогичных вирусов. Предлагаю пробежаться по истории прошлых эпидемий и попробовать спрогнозировать дальнейшее течение. В мире официально объявлена пандемия COVID-19 — потенциально тяжёлой острой респираторной инфекции, вызываемой коронавирусом SARS-CoV-2 (2019-nCoV). На Хабре много информации по этой теме — всегда помните о том, что она может быть как достоверной/полезной, так и наоборот.
Если вы проживаете не в России, обратитесь к аналогичным сайтам вашей страны. Мойте руки, берегите близких, по возможности оставайтесь дома и работайте удалённо. КоронавирусыЭто семейство РНК-вирусов, как правило, вызывает легкие респираторные заболевания. Могут инфицировать различные виды животных, включая человека. Спектр видов очень широк и включает, помимо человека, летучих мышей, собак, свиней, кошек, верблюдов и многих других. Имеют специфическое строение внешней оболочки, напоминающее солнечную корону, из-за которой и получили свое название. Они были бы особо ничем не примечательны, если бы не тяжелые разновидности MERS-CoV и SARS-CoV. Тяжелый острый респираторный синдром (ТОРС) был впервые зарегистрирован в Китае в 2002 году. Возбудителем являлся коронавирус SARS-CoV. Надо сказать, что вирусы могут иметь большие различия в контексте судьбы клетки-хозяина. Часть вирусов при размножении минимально травмирует клетку-хозяина и оставляет ее в живых. Часть — выходит в среду только после разрушения цитоплазмы эукариотической клетки. SARS-CoV относился как раз к разновидности, уничтожающей носитель в процессе размножения, что приводило к разрушению клеток легочных альвеол в течение острого периода болезни. После инкубации в течение 2-10 суток, заболевание начиналось как легкий насморк и типичная ОРВИ. Дальше развитие шло по следующему сценарию:
Течение в целом благоприятное. 90% пациентов выздоравливало без особых последствий на 6-7 сутки. Это приблизительный срок, необходимый для выработки антител к любому незнакомому антигену. У оставшейся группы вирус вызывал тяжелый острый респираторный синдром, летальность которого составила 6-15%, при этом распределение было неравномерным. У пациентов старше 50 лет смертность доходила до 50%. Пациенты нуждались в искусственной вентиляции легких, подаче дополнительного кислорода для компенсации острой легочной недостаточности. Всего было зарегистрировано 8437 случаев заболевания, из которых 813 закончились летальным исходом.
Относительно благоприятным эпидемиологическим фактором была низкая контагиозность этого коронавируса. Некоторые исследователи полагают, что основная часть заболевших заразилась не от других людей, а от больных животных. Уровень смертности среди инфицированных составляет, по разным данным, от 27% до 40%. Всего было зарегистрировано 1154 подтвержденных случая и не менее, чем 431 погибший. 2019-nCoVА теперь о неприятном. Вспышка 2019-nCoV, начавшаяся в Ухане, потенциально является одной из самых значительных опасностей, с которыми сталкивалось человечество. Исходным резервуаром предположительно являются коронавирусы летучих мышей, в частности азиатских подковоносов. В этом регионе Китая летучих мышей употребляют в пищу, что сильно увеличивает риски межвидового переноса в случае мутации. Что очень тревожит
Вирус может передаваться от человека к человеку и отличается высокой контагиозностью, что радикально отличает его от предыдущих SARS-CoV и MERS-CoV. Есть такой показатель как basic reproduction number — R0. Он показывает, сколько людей успевает заразить больной за период болезни. Если число меньше 1, то эпидемия гаснет сама собой. Если больше, то оно определяет скорость нарастания эпидемии и возможность пандемии. Например, у кори это число 12-18. Практически достаточно посмотреть на больного издали, чтобы заразиться. Что-то аналогичное у краснухи. Обычный грипп имеет R0 в районе 2-3. Последние данные по 2019-nCoV говорят о диапазоне 3.3(95%CI: 2.73-3.96) — 5.47 (95%CI: 4.16-7.10). Если коротко — это дофига. Ощутимо больше, чем у гриппа. В целом, это подтверждается темпами роста заболевших. Клиника очень похожа на SARS/MERS. Вначале гриппоподобное состояние, кашель, температура. Затем резкое ухудшение состояния и появление проблем с дыханием на 8-9 сутки с развитием острого респираторного синдрома. Вирус вызывает очень тяжелую пневмонию, разрушая клетки легочных альвеол. Есть риски присоединения бактериальной инфекции. Летальность пока очень сложно определить. При 4515 зараженных имеем 60 выздоровевших и 106 умерших. Пропорции 60/106 жуткие, но есть шанс, что через неделю начнут массово выздоравливать заболевшие первой волны, которых начнут выписывать из больницы. Тем не менее проблема ресурсов здравоохранения в мире остается самой большой проблемой для тяжелых больных. Пока отсутствует. Не ведитесь на фуфломицины, арбидолы и прочие *фероны. Бессмысленно стимулировать иммунитет, если пациент не успеет синтезировать антитела до отказа дыхательной системы. Препараты прямого действия на вирус пока не изучены, но, возможно, скоро будут какие-то данные. По данным Lancet, пациенты получали антибиотики широкого спектра действия, кортикостероиды как противовоспалительное и различные комбинации противовирусных. Есть подозрение, что может оказаться эффективным довольно токсичный рибавирин, который сам по себе обладает тератогенным воздействием (может вызывать уродства плода) и может приводить к смерти из-за подавления кроветворения. Поэтому беременным его нельзя и применение строго под присмотром врача. Он демонстрировал положительные эффекты на SARS. Стандартная. Моем руки, избегаем людных мест типа метро. Не подходим ко всем, кто кашляет. Обычные маски малоэффективны. Требуются маски классом не ниже N95 с HEPA-фильтром. При этом есть риски заражения через открытые глаза и конъюнктиву. Не в ближайшее время. В лучшем случае к 2022-2023 году. 2020 год — испытания на животных. При успешности, 2021 год — на людях, 2022 — тиражирование и производство, 2023 — начало вакцинации. Скорее всего, все будет дольше, если судить по проблемам с прошлыми коронавирусами. РезюмеВсе грустно, увы. Пока я полон пессимизма и очень надеюсь, что ошибаюсь. Пока это похоже на тяжелый MERS с высокой летальностью, но с контагиозностью выше гриппа. С учетом скрытого периода и высокой связности крупных городов, стоит ожидать вспышек во всех крупных городах в ближайшую неделю-две. Не нужно реагировать на многочисленные фейки. Ищите оригинальные научные источники, например: UPD Альтернативные оптимистичные точки зренияЕсть шанс, что сейчас статистика сильно перекошена легкобольными, которых никто не регистрирует. Что, на мой взгляд, не сильно поможет в контексте высокой пиковой нагрузки на больницы. Издательство Wiley открыло бесплатный доступ к научным статьям, посвященным вирусу: secure.wiley.com/Coronavirus2020 UPD3 Статистика на 30.01.202018%) По прежнему тревожит большой процент тяжелых пациентов. Генеральный директор ВОЗ Тедрос Аданом Гебреисус подтверждает процент тяжелых пациентов:
— Tedros Adhanom Ghebreyesus (@DrTedros) January 29, 2020
Получается, если мы хотим судить от смертности, то умершие на сегодня 170 человек — это в основном те, кто пришел в больницу 10 дней назад или раньше. Т.е. в дни, когда было зафиксировано 200-400 заболевших. Если верить, что это вирус не так опасен как SARS и убивает, к примеру каждого 20-го, тогда грубо, 10 дней назад вместо 270 болеющих в реальности было 170*20 = 3400 человек в активной стадии болезни (чтобы получить смертность 1:20 они должны были быть больными но не смертельно). Если наоборот, верить что почти все заболевшие были зарегистрированы, тогда это означало бы что смертность от этого вируса в реальности может быть выше чем у SARS. Учитывая, что пока он распространяется по экспоненте, последнее очень было бы очень плохо. Получается, статистика которую мы видим — это вершина айсберга. Количество заболевших пока растет в среднем на 50% в сутки потому, что большинство больных ходят по улицам и те меры которые приняты не работают. Тогда возможно пандемии не удастся избежать. Другой вариант — заключается в том, реальная смертность у этого вируса действительно на уровне SARS. Тогда не зарегистрированных больных не так много и меры не останавливают эпидемиую по каким-то другим причинам. Какой вариант хуже — сложно сказать. UPD4 31.01.2020dfgwer провел расчеты по имеющимся данным. Прогнозы пугающие и мрачные, с чем я согласен. Робко надеюсь, что проблема в кривой статистике, на которой мы базируемся. Сейчас примерно 20% подтвержденных больных в тяжелом состоянии. При этом подтвержденных больных каждый день становится в 1.3-1.5 раз больше. Есть временной лаг между подтверждением и тяжелым течением болезни. Я попытался это учесть и вычислить вероятность тяжелого течения для среднего подтвержденного пациента. Буду считать что: Все тяжелые — подтвержденные больные Лаг между подтверждением диагноза и тяжелым состоянием t=Тт-Тх Сколько человек на 1 дне тяжелого состояния, вычисляю по формуле суммы геометрической прогрессии r=b(1-qTy)/(1-q). Отсюда можно найти b — доля больных на первом дне тяжелой фазы в текущий момент. Вероятность тяжелого течения для подтвержденных больных с учетом лага между подтверждением и тяжелым состоянием r Выходит от 30% до 100% тяжелых случаев на подтвержденного больного. Если продолжать увеличивать лаг, то выходят бессмысленные результаты больше 100%. Даже в самых оптимистичных оценках выходит 30% для подтвержденных больных. Это теперь надо поделить на долю подтвержденных больных, чтобы получить вероятность тяжелого течения для среднего больного. Если применить эти же соображения на количество умерших то выходит от 7% до 60% для подтвержденных больных, в зависимости от лага между подтверждением и смертью. Буду рад, если вы докажете что я ошибаюсь. Если нет, то это полный пиздец с сотнями миллионов трупов. И каждый третий минимум войдет в число тяжелых. П.С. Недвижимость подешевеет. UPD5 05.02.2020Под подозрением 23 260 13%) Статистика становится более оптимистичной. Уменьшается доля тяжелых пациентов, улучшается соотношение умерших к выздоровевшим пациентам. Похоже, что оптимистичные прогнозы оправдываются в плане того, что лаг у выздоровевших больше, чем у умерших. Если жесткий карантин оправдает себя, то скорость распространения вируса может снизиться. Тем не менее, остается очень вероятной эпидемия во вторичных очагах в других странах. Этому способствует несколько факторов:
![]() Хорошо видно, что пациент 1 инфицирует пациента 3 через сутки. При этом первые симптомы о обоих появятся только через 4 дня.
Развернутые графики, спасибо glaz_almaz. В трендах видно повышение эффективности диагностики, из-за чего доля подозреваемых начала падать относительно подтвержденных. UPD6 10.02.2020Ремдесивир — как и рибавирин является аналогом нуклеиновой кислоты и неспецифически препятствует нормальному синтезу РНК. Уже демонстрировал эффективность против SARS/MERS-CoV на моделях клеточных культур, мышах и нечеловекообразных приматах. Сейчас также тестируется против Эболы. Минусы — такой же потенциально токсичный как и Рибавирин. UPD7 11.02.2020Хорошая подборка препаратов для лечения коронавирусов на основании Nature reviews (спасибо glaz_almaz). UPD8 12.02.2020Особенности пациентов: Предварительные выводы: детям почти ничего не грозит, но они, скорее всего, станут бессимптомными разносчиками. Так что, садики и школы будут инкубатором. Также длительная инкубация в сочетании с заразностью в бессимптомный период будут мощным фактором преодоления карантинов.
|